More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1096 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  100 
 
 
1764 aa  3650    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 
697 aa  449  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  37.61 
 
 
700 aa  439  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  36.95 
 
 
725 aa  433  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  35.67 
 
 
695 aa  412  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  33.47 
 
 
1406 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 
3145 aa  374  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  33.73 
 
 
648 aa  326  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 
1827 aa  323  1.9999999999999998e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  34.76 
 
 
530 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.97 
 
 
530 aa  298  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  31.59 
 
 
673 aa  294  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  33.68 
 
 
652 aa  293  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  40.86 
 
 
540 aa  292  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  30.72 
 
 
669 aa  288  8e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  32.02 
 
 
656 aa  286  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  38.93 
 
 
527 aa  283  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  37.78 
 
 
663 aa  284  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
1038 aa  275  6e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 
578 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  34.11 
 
 
542 aa  272  5e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  30.58 
 
 
677 aa  266  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 
574 aa  265  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  36.36 
 
 
577 aa  258  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 
1450 aa  257  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  33.33 
 
 
542 aa  257  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  36.27 
 
 
601 aa  255  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  34.89 
 
 
573 aa  254  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.78 
 
 
1034 aa  252  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  33.6 
 
 
604 aa  249  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  34.79 
 
 
602 aa  246  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  29.83 
 
 
720 aa  245  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  32.55 
 
 
536 aa  241  8e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  29.05 
 
 
637 aa  238  7e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  36.6 
 
 
634 aa  236  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 
607 aa  234  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.42 
 
 
760 aa  230  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  37.17 
 
 
1212 aa  230  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 
688 aa  230  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  33.98 
 
 
473 aa  229  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
1005 aa  228  9e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 
955 aa  228  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  33.47 
 
 
525 aa  227  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  34.93 
 
 
592 aa  226  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 
780 aa  226  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 
685 aa  224  9e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  33.77 
 
 
546 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  26.86 
 
 
889 aa  223  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 
520 aa  223  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  33.25 
 
 
1077 aa  222  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 
545 aa  221  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 
608 aa  220  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  27.68 
 
 
1677 aa  219  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  27.05 
 
 
762 aa  219  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.05 
 
 
762 aa  219  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  33.41 
 
 
532 aa  219  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 
611 aa  219  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
747 aa  219  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 
545 aa  219  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  34.7 
 
 
872 aa  218  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
615 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  31.34 
 
 
717 aa  217  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  33.41 
 
 
523 aa  216  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  30.51 
 
 
578 aa  217  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  32.37 
 
 
600 aa  217  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 
496 aa  215  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 
484 aa  215  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 
573 aa  213  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  35.57 
 
 
703 aa  213  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.49 
 
 
620 aa  212  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 
588 aa  211  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  27.74 
 
 
899 aa  210  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
571 aa  210  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 
662 aa  209  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 
935 aa  207  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.98 
 
 
545 aa  207  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
626 aa  207  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 
542 aa  207  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  31.98 
 
 
630 aa  206  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 
438 aa  206  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  31.29 
 
 
648 aa  206  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.68 
 
 
454 aa  204  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  34.11 
 
 
714 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  32.27 
 
 
740 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  37.22 
 
 
322 aa  202  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 
747 aa  202  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
637 aa  201  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.81 
 
 
620 aa  201  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
604 aa  201  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 
639 aa  201  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 
1073 aa  200  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 
529 aa  200  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
545 aa  200  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
713 aa  199  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 
472 aa  199  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
593 aa  199  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 
583 aa  198  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 
412 aa  198  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  36.52 
 
 
387 aa  198  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  28.66 
 
 
527 aa  197  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>