48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1095 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1095  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 10429 aa  18630    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4997  Outer membrane autotransporter barrel  39.23 
 
 		 998 aa  259  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.4 
 
 		 1242 aa  216  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1775  outer membrane autotransporter  27.84 
 
 		 831 aa  167  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00532654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  25.43 
 
 		 2848 aa  108  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1209  outer membrane autotransporter, putative  27.64 
 
 		 3484 aa  95.1  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  27.39 
 
 		 939 aa  94  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  29.1 
 
 		 1068 aa  85.5  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  25.66 
 
 		 972 aa  85.1  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  26.15 
 
 		 1012 aa  77.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1155  autotransporter domain-containing protein  28.51 
 
 		 1677 aa  73.9  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  25.95 
 
 		 763 aa  69.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  26.89 
 
 		 759 aa  67.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  24.85 
 
 		 1769 aa  63.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.17 
 
 		 774 aa  61.2  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  23.96 
 
 		 3822 aa  60.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  22.45 
 
 		 1369 aa  60.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  23.96 
 
 		 4238 aa  60.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  23.96 
 
 		 4238 aa  59.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  21.02 
 
 		 3506 aa  59.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0096  autotransporter beta-domain-containing protein  25.77 
 
 		 1035 aa  58.5  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1208  outer membrane autotransporter TapA  29.43 
 
 		 991 aa  57  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  48.57 
 
 		 5613 aa  56.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  23.32 
 
 		 985 aa  56.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  25.2 
 
 		 1886 aa  55.5  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1041  autotransporter beta-domain-containing protein  33.33 
 
 		 1084 aa  54.7  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  23.56 
 
 		 2711 aa  54.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.96 
 
 		 1489 aa  53.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.51 
 
 		 919 aa  53.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  22.86 
 
 		 990 aa  52.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  23.88 
 
 		 1550 aa  52.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  25.32 
 
 		 1130 aa  52  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1370  autotransporter beta-domain-containing protein  27.64 
 
 		 955 aa  50.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.498654  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  22.71 
 
 		 1519 aa  51.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1833  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.85 
 
 		 1048 aa  50.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.92 
 
 		 1029 aa  50.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  33.65 
 
 		 1446 aa  50.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25 
 
 		 1848 aa  49.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1329  outer membrane autotransporter  22.86 
 
 		 1058 aa  49.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0892684  normal  0.563685 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  22.27 
 
 		 1881 aa  49.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  24.79 
 
 		 5981 aa  49.3  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  22.81 
 
 		 1016 aa  49.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0998  outer membrane autotransporter  26.26 
 
 		 728 aa  48.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0947  putative autotransporter protein  26.26 
 
 		 728 aa  48.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3276  hypothetical protein  26.26 
 
 		 728 aa  48.9  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393702  hitchhiker  0.00000976174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  22.22 
 
 		 1004 aa  48.5  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1723  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.55 
 
 		 1953 aa  47.8  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0576481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  21.2 
 
 		 1001 aa  48.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>