More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1082 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0789  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  83.55 
 
 		 393 aa  681    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.284669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1082  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 392 aa  815    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0516  coproporphyrinogen III oxidase  58.91 
 
 		 404 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0955  coproporphyrinogen III oxidase  58.91 
 
 		 404 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0995  coproporphyrinogen III oxidase  58.91 
 
 		 404 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369674  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0867  coproporphyrinogen III oxidase  58.91 
 
 		 404 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0850  coproporphyrinogen III oxidase  59.69 
 
 		 419 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2479  coproporphyrinogen III oxidase  58.25 
 
 		 413 aa  478  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226119  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4103  coproporphyrinogen III oxidase  57.62 
 
 		 404 aa  478  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.274585  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2405  coproporphyrinogen III oxidase  58.4 
 
 		 404 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0855  coproporphyrinogen III oxidase  58.66 
 
 		 404 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286896  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1582  coproporphyrinogen III oxidase  56.85 
 
 		 405 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229924  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2100  coproporphyrinogen III oxidase  56.85 
 
 		 405 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3053  coproporphyrinogen III oxidase  56.59 
 
 		 405 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2953  coproporphyrinogen III oxidase  56.85 
 
 		 405 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.640184  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3019  coproporphyrinogen III oxidase  56.59 
 
 		 405 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18574  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2644  coproporphyrinogen III oxidase  56.85 
 
 		 405 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1968  coproporphyrinogen III oxidase  56.85 
 
 		 405 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137157  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0811  coproporphyrinogen III oxidase  56.85 
 
 		 405 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2282  coproporphyrinogen III oxidase  54.1 
 
 		 422 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485067  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0665  coproporphyrinogen III oxidase  56.59 
 
 		 404 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0912478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3577  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.84 
 
 		 390 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0892028  normal  0.365381 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1962  coproporphyrinogen III oxidase  54.36 
 
 		 422 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154783  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2161  coproporphyrinogen III oxidase  54.36 
 
 		 424 aa  456  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0050137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3089  coproporphyrinogen III oxidase  55.56 
 
 		 409 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0816  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  53.09 
 
 		 396 aa  455  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.847489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.82 
 
 		 416 aa  451  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1341  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.06 
 
 		 394 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0901  coproporphyrinogen III oxidase  54.52 
 
 		 409 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2033  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  53.05 
 
 		 414 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4323  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.05 
 
 		 419 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  54.45 
 
 		 399 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1631  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.68 
 
 		 394 aa  431  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.526463  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0703  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.61 
 
 		 457 aa  426  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.625393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2703  putative anaerobic coproporphyrinogen III oxidase oxidoreductase protein  50.25 
 
 		 417 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0068  coproporphyrinogen III oxidase  50.51 
 
 		 408 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4026  coproporphyrinogen III oxidase  50.65 
 
 		 407 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0921  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.34 
 
 		 414 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698977 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.61 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0856  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.34 
 
 		 414 aa  402  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0770  coproporphyrinogen III oxidase  50.65 
 
 		 378 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.261122  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3612  coproporphyrinogen III oxidase  50.39 
 
 		 379 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0040  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  50.92 
 
 		 384 aa  398  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0755  coproporphyrinogen III oxidase  50.39 
 
 		 379 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0759  coproporphyrinogen III oxidase  49.35 
 
 		 378 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573813 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0479  coproporphyrinogen III oxidase  53.11 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2444  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.4 
 
 		 385 aa  392  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4035  coproporphyrinogen III oxidase  49.09 
 
 		 379 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3115  coproporphyrinogen III oxidase  49.35 
 
 		 378 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3361  coproporphyrinogen III oxidase  48.45 
 
 		 380 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679793 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02785  coproporphyrinogen III oxidase  48.97 
 
 		 378 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.179359  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4258  coproporphyrinogen III oxidase  48.97 
 
 		 378 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3387  coproporphyrinogen III oxidase  49.35 
 
 		 378 aa  391  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02748  hypothetical protein  48.97 
 
 		 378 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.153415  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2472  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.62 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3455  coproporphyrinogen III oxidase  49.74 
 
 		 380 aa  388  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.766268  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0740  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.71 
 
 		 378 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0826  coproporphyrinogen III oxidase  49.22 
 
 		 376 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0143  coproporphyrinogen III oxidase  49.22 
 
 		 376 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483536 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0825  coproporphyrinogen III oxidase  49.22 
 
 		 376 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.330416  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3278  coproporphyrinogen III oxidase  47.68 
 
 		 378 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.026335 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0117  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.87 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3267  coproporphyrinogen III oxidase  47.68 
 
 		 378 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  47.87 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3299  coproporphyrinogen III oxidase  47.94 
 
 		 378 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3097  coproporphyrinogen III oxidase  48.57 
 
 		 378 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345052 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3343  coproporphyrinogen III oxidase  47.68 
 
 		 378 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3351  coproporphyrinogen III oxidase  47.42 
 
 		 378 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.315269 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3447  coproporphyrinogen III oxidase  47.42 
 
 		 378 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.286445 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2322  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.22 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5101  coproporphyrinogen III oxidase  47.87 
 
 		 391 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5327  coproporphyrinogen III oxidase  48.55 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5151  coproporphyrinogen III oxidase  47.96 
 
 		 391 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.294445  normal  0.707101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0364  coproporphyrinogen III oxidase  47.69 
 
 		 395 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0760  coproporphyrinogen III oxidase  47.92 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3288  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.94 
 
 		 396 aa  368  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.23 
 
 		 385 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.958254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2346  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  49.23 
 
 		 385 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3079  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  46.7 
 
 		 380 aa  368  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.862444  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5052  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  48.71 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0471  coproporphyrinogen III oxidase  48.45 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3273  coproporphyrinogen III oxidase  48.32 
 
 		 408 aa  366  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0847  coproporphyrinogen III oxidase  47.66 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05040  coproporphyrinogen III oxidase  47.92 
 
 		 384 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4159  coproporphyrinogen III oxidase  47.4 
 
 		 386 aa  363  3e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03584  coproporphyrinogen III oxidase  44.78 
 
 		 390 aa  363  3e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0124  coproporphyrinogen III oxidase  46.91 
 
 		 392 aa  363  4e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3668  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.56 
 
 		 388 aa  362  5.0000000000000005e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.231493  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0485  coproporphyrinogen III oxidase  47.4 
 
 		 384 aa  362  9e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0537  coproporphyrinogen III oxidase  46.39 
 
 		 386 aa  361  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0906426  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2693  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.55 
 
 		 387 aa  360  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02372  coproporphyrinogen III oxidase  46.51 
 
 		 385 aa  360  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0007  coproporphyrinogen III oxidase  45.11 
 
 		 391 aa  359  6e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.712639  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1121  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.85 
 
 		 378 aa  358  8e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.002803  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002450  coproporphyrinogen III oxidase, oxygen-independent  44.28 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2866  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.56 
 
 		 379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00010545  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3046  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.27 
 
 		 380 aa  355  5.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.482476  normal  0.758269 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3359  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  44.82 
 
 		 385 aa  354  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1258  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.94 
 
 		 385 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0161407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3046  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.19 
 
 		 388 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000324324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>