More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1074 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  779    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0799  protein of unknown function DUF140  89.39 
 
 		 216 aa  336  5e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.745929 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  43.05 
 
 		 382 aa  285  9e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  42.78 
 
 		 375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  41.54 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  36.2 
 
 		 380 aa  206  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  33.23 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  35.87 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  35.1 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  32.32 
 
 		 374 aa  189  7e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  32.32 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  35.65 
 
 		 377 aa  188  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  35.65 
 
 		 377 aa  188  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  35.8 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  28.5 
 
 		 413 aa  182  9.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  33.43 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  34.26 
 
 		 366 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  31.62 
 
 		 366 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  29.01 
 
 		 367 aa  177  4e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  30.61 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  30.12 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  28.37 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  30.39 
 
 		 378 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  30.75 
 
 		 376 aa  172  7.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  30.86 
 
 		 378 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  30.12 
 
 		 369 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0670  hypothetical protein  33.68 
 
 		 369 aa  170  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  39.11 
 
 		 372 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  31.2 
 
 		 376 aa  167  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  30.86 
 
 		 378 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  33.33 
 
 		 377 aa  166  9e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  33.68 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  32.52 
 
 		 368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  31.82 
 
 		 378 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  33.13 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  30.86 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  34.67 
 
 		 387 aa  163  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  33.02 
 
 		 365 aa  163  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  31.23 
 
 		 474 aa  162  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  32.08 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  30.75 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  32.08 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  36.49 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  30.98 
 
 		 406 aa  160  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  41.71 
 
 		 250 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  33.82 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  31.1 
 
 		 382 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  30.42 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  29.86 
 
 		 368 aa  156  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  31.84 
 
 		 377 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  32.83 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  33.71 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  31.13 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  31.13 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  32.58 
 
 		 376 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  34.98 
 
 		 368 aa  155  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  31.36 
 
 		 384 aa  153  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2637  hypothetical protein  40.08 
 
 		 401 aa  153  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  31.28 
 
 		 377 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  30.19 
 
 		 430 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3136  hypothetical protein  40.57 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  29.63 
 
 		 377 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  32.11 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  29.27 
 
 		 373 aa  151  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  36.97 
 
 		 257 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  32.33 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  29.02 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  29.31 
 
 		 383 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  29.81 
 
 		 370 aa  150  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1058  protein of unknown function DUF140  31.38 
 
 		 375 aa  150  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00141261  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1984  protein of unknown function DUF140  31.02 
 
 		 383 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  36.33 
 
 		 370 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  32.77 
 
 		 384 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  29.02 
 
 		 372 aa  149  8e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  28.44 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  33.21 
 
 		 382 aa  147  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1540  hypothetical protein  32.24 
 
 		 395 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  29.68 
 
 		 382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  30.7 
 
 		 382 aa  146  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  34.23 
 
 		 255 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  30 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  30.51 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2365  hypothetical protein  27.97 
 
 		 373 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00138547  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  31.8 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  29.53 
 
 		 373 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  31.65 
 
 		 382 aa  143  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  31.74 
 
 		 382 aa  143  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  37.28 
 
 		 256 aa  143  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  31.65 
 
 		 381 aa  143  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  35 
 
 		 376 aa  142  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  30.19 
 
 		 383 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  35.5 
 
 		 257 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  29.91 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  34.5 
 
 		 258 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  28.57 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  31.28 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  34.63 
 
 		 266 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  35.84 
 
 		 258 aa  140  4.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2908  hypothetical protein  40.18 
 
 		 275 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  31.99 
 
 		 381 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>