211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1072 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1072  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  629  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1496  Mammalian cell entry related domain protein  33.13 
 
 		 335 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.024979  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1320  Mammalian cell entry related domain protein  26.28 
 
 		 337 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2751  paraquat-inducible ABC-type transporter, periplasmic component  31.61 
 
 		 326 aa  132  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3015  hypothetical protein  25.93 
 
 		 329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.231252  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2416  hypothetical protein  31.77 
 
 		 359 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2635  hypothetical protein  27.17 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  23.69 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4623  hypothetical protein  23.33 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  26.23 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  26.23 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0466  Mammalian cell entry related domain protein  23.92 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1983  hypothetical protein  31.15 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.042136  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1960  hypothetical protein  24.16 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0139154  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2577  hypothetical protein  24.55 
 
 		 546 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3288  hypothetical protein  24.07 
 
 		 546 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3499  hypothetical protein  29.52 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3139  hypothetical protein  23.99 
 
 		 546 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1056  Mammalian cell entry related domain protein  24.16 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0668  hypothetical protein  27.37 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2722  paraquat-inducible protein B  26.15 
 
 		 550 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2221  Mammalian cell entry related domain protein  26.62 
 
 		 556 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000538523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2893  Mammalian cell entry related domain protein  26.74 
 
 		 548 aa  70.1  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.3428  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2000  Mammalian cell entry related domain protein  26.33 
 
 		 558 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939676  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  26.15 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0257  hypothetical protein  25.9 
 
 		 543 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1704  hypothetical protein  23.43 
 
 		 554 aa  66.2  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3138  hypothetical protein  23.19 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448864  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.15 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6816  paraquat-inducible protein B'  23.08 
 
 		 556 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3376  hypothetical protein  23.4 
 
 		 559 aa  63.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166606  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0040  Mammalian cell entry related domain protein  34.27 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  21.95 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02656  putative paraquat-inducible protein B  23.48 
 
 		 555 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  20.86 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2831  hypothetical protein  24.91 
 
 		 551 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  23.77 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  26.2 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2580  hypothetical protein  23.43 
 
 		 551 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.732971 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1683  paraquat-inducible protein B  24.91 
 
 		 548 aa  60.8  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  23.11 
 
 		 572 aa  59.3  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3535  hypothetical protein  23.66 
 
 		 531 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128458  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0601  hypothetical protein  23.44 
 
 		 547 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.184325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1230  Mammalian cell entry related domain protein  25.41 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1865  hypothetical protein  22.43 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0867784 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2074  hypothetical protein  26.15 
 
 		 550 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0955309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2113  hypothetical protein  22.47 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.696493  normal  0.025726 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0403  hypothetical protein  23.51 
 
 		 545 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44090  PqiB family protein  23.47 
 
 		 537 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.760607  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2447  hypothetical protein  28.4 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106785  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  25.26 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2378  paraquat-inducible protein B  21.93 
 
 		 553 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3382  paraquat-inducible protein  21.93 
 
 		 551 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1920  hypothetical protein  22.06 
 
 		 554 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.976156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0292  paraquat-inducible protein B  21.93 
 
 		 551 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0040  paraquat-inducible protein  21.82 
 
 		 569 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00684202  normal  0.214843 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1154  paraquat-inducible protein B  21.93 
 
 		 551 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3340  paraquat-inducible protein B  21.93 
 
 		 551 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440052  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3374  mce family protein  21.93 
 
 		 551 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2561  mce family protein  21.93 
 
 		 551 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  22.14 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.05 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1268  paraquat-inducible protein B  21.98 
 
 		 551 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5506  hypothetical protein  25.78 
 
 		 533 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2692  hypothetical protein  25 
 
 		 688 aa  56.2  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  24.46 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  29.38 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2562  hypothetical protein  23.46 
 
 		 558 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0758211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1794  paraquat-inducible protein B  23.74 
 
 		 555 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  21.72 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  23.67 
 
 		 313 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2535  hypothetical protein  25.1 
 
 		 544 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1794  Mammalian cell entry related domain protein  24.12 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2932  hypothetical protein  20.79 
 
 		 548 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2135  mce-related protein  24.12 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5802  hypothetical protein  23.14 
 
 		 531 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00328946  hitchhiker  0.0014272 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3045  PqiB family protein  24.05 
 
 		 559 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114944  normal  0.0226159 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  24.01 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2114  Mammalian cell entry related domain protein  22.35 
 
 		 539 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2127  putative paraquat-inducible transmembrane protein, PqiB  22.52 
 
 		 539 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460028  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1445  Mammalian cell entry related domain protein  24.71 
 
 		 547 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0530  Mammalian cell entry related domain protein  22.43 
 
 		 547 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  27.07 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0328  Mammalian cell entry related domain protein  25.19 
 
 		 552 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  23.77 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0517  Mammalian cell entry related domain protein  22.06 
 
 		 547 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0678  hypothetical protein  21.89 
 
 		 539 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0419217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0249  ABC-type transport system periplasmic component  25 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.79889 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  24.91 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0246  Mammalian cell entry related domain protein  25.53 
 
 		 325 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0227  hypothetical protein  21.89 
 
 		 539 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0711  hypothetical protein  21.89 
 
 		 539 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  23.7 
 
 		 515 aa  53.9  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.7 
 
 		 308 aa  53.9  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4000  putative paraquat-inducible protein  24.81 
 
 		 552 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.113556  normal  0.829107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0709  Mammalian cell entry related domain protein  23.95 
 
 		 552 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  25.7 
 
 		 308 aa  53.9  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0614  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.65 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0433  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.65 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0452  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.65 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>