More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1056 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1056  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  179  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0816  30S ribosomal protein S15  94.38 
 
 		 89 aa  169  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2220  30S ribosomal protein S15  83.15 
 
 		 89 aa  151  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1897  30S ribosomal protein S15  83.15 
 
 		 89 aa  151  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.320723  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1398  SSU ribosomal protein S15P  80.9 
 
 		 89 aa  150  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129269  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  80.9 
 
 		 89 aa  146  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  80.9 
 
 		 89 aa  146  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  79.78 
 
 		 89 aa  146  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  80.9 
 
 		 89 aa  146  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  80.9 
 
 		 89 aa  146  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  80.9 
 
 		 89 aa  146  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  80.9 
 
 		 89 aa  146  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  80.9 
 
 		 89 aa  146  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3515  30S ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 88 aa  145  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3261  30S ribosomal protein S15  86.42 
 
 		 88 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  78.65 
 
 		 89 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1258  30S ribosomal protein S15  79.31 
 
 		 88 aa  144  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142171 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5185  30S ribosomal protein S15  80.46 
 
 		 88 aa  143  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0867  30S ribosomal protein S15  80.46 
 
 		 88 aa  142  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.350166  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2818  30S ribosomal protein S15  79.78 
 
 		 88 aa  142  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.219702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  79.55 
 
 		 90 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0952  30S ribosomal protein S15  80.46 
 
 		 88 aa  142  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000371083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  79.55 
 
 		 90 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1419  30S ribosomal protein S15  82.72 
 
 		 88 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22503  normal  0.956384 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1488  30S ribosomal protein S15  75.28 
 
 		 88 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  73.03 
 
 		 89 aa  132  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1496  ribosomal protein S15  71.26 
 
 		 87 aa  131  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211437 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  69.66 
 
 		 89 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  69.66 
 
 		 89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2812  30S ribosomal protein S15  71.43 
 
 		 86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1695  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000686217  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01306  30S ribosomal protein S15  70.24 
 
 		 86 aa  124  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.154774  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0724  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0155068 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4487  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4177  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4709  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217974  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0782  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00988358  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4709  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4574  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0323645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0206  30S ribosomal protein S15  70.24 
 
 		 86 aa  120  9e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3605  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.228641  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0182  30S ribosomal protein S15  69.05 
 
 		 86 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62720  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  66.29 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5458  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259891  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  69.14 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42790  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  60.67 
 
 		 89 aa  116  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03032  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3606  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3649  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02983  hypothetical protein  64.04 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3461  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.22404 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0533  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3577  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3471  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3639  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3471  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3540  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  69.14 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4485  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3345  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.157077  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  65.91 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0728  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  69.62 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0588  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258599  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3602  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1698  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0492  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.156818  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2705  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0076009  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0079  30S ribosomal protein S15  65 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>