More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0927 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0927  beta-ketothiolase  100 
 
 		 394 aa  801    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0480332  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0914  beta-ketothiolase  96.7 
 
 		 394 aa  783    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.579266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3854  beta-ketothiolase  79.9 
 
 		 395 aa  616  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2273  beta-ketothiolase  76.4 
 
 		 393 aa  610  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3022  beta-ketothiolase  76.84 
 
 		 393 aa  600  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00935658  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0688  beta-ketothiolase  70.92 
 
 		 395 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494591  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2659  beta-ketothiolase  70.48 
 
 		 393 aa  559  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  59.9 
 
 		 394 aa  481  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  58.63 
 
 		 394 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  59.39 
 
 		 394 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  59.64 
 
 		 394 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  58.63 
 
 		 394 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  60.15 
 
 		 396 aa  472  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  58.12 
 
 		 394 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  59.39 
 
 		 394 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1734  beta-ketothiolase  60.15 
 
 		 394 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1871  beta-ketothiolase  59.45 
 
 		 395 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  60.15 
 
 		 394 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  58.63 
 
 		 394 aa  462  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  59.69 
 
 		 396 aa  463  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  57.87 
 
 		 427 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  57.87 
 
 		 394 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  58.88 
 
 		 394 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  57.87 
 
 		 394 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  57.61 
 
 		 394 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  57.87 
 
 		 394 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0332  beta-ketothiolase  58.46 
 
 		 421 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471879  hitchhiker  0.00997806 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  57.87 
 
 		 394 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  57.61 
 
 		 427 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  57.87 
 
 		 427 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  57.11 
 
 		 394 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  58.42 
 
 		 395 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  57.93 
 
 		 394 aa  448  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  57.51 
 
 		 397 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  57.51 
 
 		 397 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  57.51 
 
 		 397 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  59.03 
 
 		 394 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  57.51 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  57.25 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000797473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  56.74 
 
 		 409 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  57.51 
 
 		 397 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  57.76 
 
 		 398 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  56.01 
 
 		 392 aa  438  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  58.16 
 
 		 396 aa  435  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0032  beta-ketothiolase  56.89 
 
 		 395 aa  434  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  55.81 
 
 		 396 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0025  beta-ketothiolase  58.93 
 
 		 395 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3754  beta-ketothiolase  57.51 
 
 		 394 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0377  beta-ketothiolase  57.11 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0014  beta-ketothiolase  56.12 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2149  beta-ketothiolase  57.76 
 
 		 394 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811795 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2196  beta-ketothiolase  57.76 
 
 		 394 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.858736 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2663  beta-ketothiolase  57.03 
 
 		 393 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2009  beta-ketothiolase  57.51 
 
 		 394 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0651285  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5309  acetyl-CoA acetyltransferase  53.71 
 
 		 398 aa  423  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.330072 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  54.99 
 
 		 391 aa  415  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6830  acetyl-CoA acetyltransferase  55.84 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  54.73 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  54.1 
 
 		 393 aa  414  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3331  beta-ketothiolase  55.33 
 
 		 394 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  53.96 
 
 		 389 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16380  acetoacetyl-CoA thiolase  55.5 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  52.05 
 
 		 393 aa  398  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0262  beta-ketothiolase  54.99 
 
 		 391 aa  401  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1951  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1354  beta-ketothiolase  53.96 
 
 		 389 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0022  beta-ketothiolase  53.96 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 392 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  51.91 
 
 		 392 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 390 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 402 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  51.65 
 
 		 392 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 394 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2996  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 390 aa  366  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  48.48 
 
 		 392 aa  364  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  49.37 
 
 		 393 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 391 aa  361  1e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 391 aa  361  1e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  48.48 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  48.22 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 		 392 aa  359  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  47.97 
 
 		 392 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0225  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 		 395 aa  358  7e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0641  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.87 
 
 		 390 aa  358  9e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  48.22 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  48.22 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3822  acetyl-CoA acetyltransferase  48.96 
 
 		 393 aa  356  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  47.21 
 
 		 392 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 		 392 aa  355  6.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1573  acetyl-CoA acetyltransferase  47.83 
 
 		 396 aa  355  7.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.872481  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4781  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 		 393 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909397  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5917  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 		 393 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 		 393 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4150  acetyl-CoA acetyltransferase  47.57 
 
 		 393 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 		 392 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  49.11 
 
 		 393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>