196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0920 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0920  putative transmembrane protein  100 
 
 		 295 aa  605  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0922  putative transmembrane protein  85.42 
 
 		 295 aa  498  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.357756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  56.13 
 
 		 285 aa  318  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  56.13 
 
 		 289 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  57.25 
 
 		 258 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  55.09 
 
 		 271 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  53.56 
 
 		 285 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  53.93 
 
 		 278 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5095  DNA uptake lipoprotein-like  56.18 
 
 		 274 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1818  DNA uptake lipoprotein-like protein  55.78 
 
 		 274 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6285  DNA uptake lipoprotein-like  55.78 
 
 		 274 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1794  DNA uptake lipoprotein-like protein  55.78 
 
 		 274 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1705  competence lipoprotein ComL  56.05 
 
 		 274 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1480  competence lipoprotein ComL  56.45 
 
 		 274 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124446  normal  0.0477124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1732  competence lipoprotein ComL  56.05 
 
 		 274 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424697  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2334  competence lipoprotein ComL  55.65 
 
 		 313 aa  295  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1325  competence lipoprotein ComL  55.65 
 
 		 280 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.028744  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2252  competence lipoprotein ComL  55.65 
 
 		 313 aa  295  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1814  competence lipoprotein ComL  55.65 
 
 		 274 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.861802  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0082  competence lipoprotein ComL  55.65 
 
 		 274 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2206  putative competence lipoprotein ComL  55.65 
 
 		 274 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1085  competence lipoprotein ComL  55.65 
 
 		 274 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0185202  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2169  putative competence lipoprotein ComL  55.65 
 
 		 274 aa  295  9e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1840  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  56.33 
 
 		 286 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0444128  normal  0.143398 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  52.14 
 
 		 257 aa  292  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2347  putative competence lipoprotein, ComL  55.1 
 
 		 286 aa  289  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0433334 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  53.75 
 
 		 269 aa  273  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  52.11 
 
 		 265 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  52.94 
 
 		 268 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  50.4 
 
 		 266 aa  267  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  52.7 
 
 		 281 aa  262  4.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1829  putative transmembrane protein  52.24 
 
 		 300 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0739498  normal  0.248165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1899  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  52.24 
 
 		 265 aa  259  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2179  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  52.21 
 
 		 268 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1864  putative transmembrane protein  51 
 
 		 274 aa  256  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2004  putative transmembrane protein  52.57 
 
 		 274 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.519821  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2616  putative transmembrane protein  48.47 
 
 		 274 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3500  putative transmembrane protein  47.71 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.390268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4485  putative transmembrane protein  48.16 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  44.11 
 
 		 267 aa  236  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2876  putative transmembrane protein  45.77 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.676791 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  42.74 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  38.98 
 
 		 337 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  44.26 
 
 		 279 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.894464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0971  competence lipoprotein ComL  39.35 
 
 		 286 aa  205  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0814  putative competence lipoprotein precursor  43.48 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  37.65 
 
 		 339 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  37.25 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  37.65 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60230  competence protein ComL  41.59 
 
 		 341 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000131056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5184  competence protein ComL  41.15 
 
 		 341 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  35.43 
 
 		 254 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  37.76 
 
 		 330 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  36.47 
 
 		 339 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4837  competence lipoprotein ComL, putative  38.22 
 
 		 338 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.616108  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  37.92 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  33.86 
 
 		 301 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  38.16 
 
 		 340 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3916  putative lipoprotein  34.94 
 
 		 252 aa  180  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  38.01 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  38.06 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  38.06 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  37.09 
 
 		 255 aa  173  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  37.09 
 
 		 272 aa  172  7.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2606  putative lipoprotein  37.4 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000151596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3266  putative lipoprotein  33.73 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  36.55 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  35.32 
 
 		 253 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2951  putative lipoprotein  37.44 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000165501  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3500  putative lipoprotein  35.42 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.538329  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3723  putative lipoprotein  34.02 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0666  putative lipoprotein  34.15 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1021  putative lipoprotein  37 
 
 		 253 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000015232  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3167  putative lipoprotein  35.37 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0598273  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3580  hypothetical protein  36.56 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2851  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  37.61 
 
 		 243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1135  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  37.17 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  34.29 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  34.29 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3172  putative lipoprotein  36.56 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000327515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  34.29 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2994  putative lipoprotein  36.56 
 
 		 282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000158327  normal  0.33203 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3075  putative lipoprotein  36.56 
 
 		 282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000146144  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0877  DNA uptake lipoprotein  36.52 
 
 		 277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.594367  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1919  putative lipoprotein  35.63 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.527039  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1857  competence lipoprotein  35.63 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  40.29 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0883  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  35.84 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.192303  normal  0.0728426 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3144  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  36.73 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02485  predicted lipoprotein  34.45 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  34.45 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3836  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  34.45 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000106829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  34.45 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  34.45 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000166686  normal  0.272944 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  34.45 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02449  hypothetical protein  34.45 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2976  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  34.45 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0410955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2753  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  34.45 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000042018  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3273  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  35.24 
 
 		 253 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000016984  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1118  putative lipoprotein  35.24 
 
 		 253 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000738911  normal  0.0672977 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>