More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0898 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  100 
 
 		 410 aa  814    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  64.93 
 
 		 403 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  63.9 
 
 		 425 aa  512  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  59.31 
 
 		 414 aa  470  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  58.72 
 
 		 407 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  58.62 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  59.46 
 
 		 405 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  58.06 
 
 		 406 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  59.46 
 
 		 405 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  57.88 
 
 		 412 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  60.2 
 
 		 413 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  59.05 
 
 		 408 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  57.21 
 
 		 407 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  60.5 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  50.89 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  52.28 
 
 		 402 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  51.27 
 
 		 402 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  50.64 
 
 		 400 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  53.42 
 
 		 402 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  53.15 
 
 		 402 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  50.38 
 
 		 406 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  52.03 
 
 		 399 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  51.72 
 
 		 400 aa  348  9e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  51.39 
 
 		 399 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  46.43 
 
 		 402 aa  346  5e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  50.76 
 
 		 480 aa  345  6e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  53.5 
 
 		 401 aa  342  7e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  47.1 
 
 		 405 aa  342  8e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  47.07 
 
 		 410 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  47.33 
 
 		 410 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  45.86 
 
 		 412 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  47.06 
 
 		 410 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  47.33 
 
 		 410 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  47.07 
 
 		 408 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  47.31 
 
 		 410 aa  326  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  47.07 
 
 		 410 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  47.06 
 
 		 410 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  47.87 
 
 		 408 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  42.71 
 
 		 406 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 412 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  44.56 
 
 		 404 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  44.44 
 
 		 404 aa  318  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 404 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  41.52 
 
 		 417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  45.25 
 
 		 410 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  46.92 
 
 		 405 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  46.8 
 
 		 405 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  41.52 
 
 		 411 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  40.39 
 
 		 411 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  41.24 
 
 		 413 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  41.01 
 
 		 411 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  39.12 
 
 		 421 aa  289  7e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  39 
 
 		 414 aa  286  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  44.62 
 
 		 409 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  41.06 
 
 		 416 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  44.62 
 
 		 409 aa  282  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  41.81 
 
 		 528 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 433 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 412 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  39.75 
 
 		 436 aa  270  5e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  42.07 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  42.24 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  42.07 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  42.07 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  42.07 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  42.07 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  42.07 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 412 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  42.33 
 
 		 414 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 415 aa  263  6e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 414 aa  260  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  37.56 
 
 		 411 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  36.57 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  36.74 
 
 		 403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 415 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 427 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  37.13 
 
 		 412 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  34.82 
 
 		 421 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  27.36 
 
 		 452 aa  107  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 438 aa  106  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 452 aa  106  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 442 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  27.14 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 427 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 418 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 428 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  25.71 
 
 		 430 aa  97.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  25.64 
 
 		 429 aa  97.4  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  24.57 
 
 		 430 aa  96.7  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 427 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 436 aa  95.5  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 424 aa  93.2  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>