More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0854 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0854  inositol monophosphatase  100 
 
 
262 aa  540  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  93.89 
 
 
284 aa  511  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1095  Inositol-phosphate phosphatase  66.29 
 
 
270 aa  377  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47624 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1160  inositol monophosphatase  66.67 
 
 
270 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728684  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1001  Inositol-phosphate phosphatase  66.29 
 
 
270 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165549  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  67.56 
 
 
267 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2518  Inositol-phosphate phosphatase  66.79 
 
 
267 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000560671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1115  inositol-1(or 4)-monophosphatase  68.56 
 
 
274 aa  364  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  65.65 
 
 
330 aa  362  3e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1078  inositol monophosphatase  67.05 
 
 
273 aa  362  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.701332  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1397  inositol-phosphate phosphatase  67.56 
 
 
267 aa  362  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  hitchhiker  0.000599171 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1934  inositol-1-monophosphatase  66.79 
 
 
363 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3149  inositol-1-monophosphatase  66.41 
 
 
267 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231747  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1664  inositol-1-monophosphatase  66.41 
 
 
267 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0475156  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2689  inositol-1-monophosphatase  66.41 
 
 
320 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0179732  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2605  inositol monophosphatase family protein  66.41 
 
 
267 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2553  inositol monophosphatase family protein  66.41 
 
 
267 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1441  inositol-1-monophosphatase  66.41 
 
 
267 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2168  inositol-1-monophosphatase  66.41 
 
 
267 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289149  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2892  inositol-1(or 4)-monophosphatase  62.21 
 
 
300 aa  348  6e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1218  inositol-phosphate phosphatase  60.69 
 
 
431 aa  347  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3293  inositol-1(or 4)-monophosphatase  66.41 
 
 
328 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  61.69 
 
 
273 aa  338  4e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1380  inositol-phosphate phosphatase  64.5 
 
 
330 aa  338  8e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135454  hitchhiker  0.00587687 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1990  inositol-phosphate phosphatase  66.15 
 
 
267 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.410735 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1160  inositol monophosphatase  61.69 
 
 
268 aa  337  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00412225  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2120  inositol monophosphatase  66.15 
 
 
267 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2104  inositol-phosphate phosphatase  66.15 
 
 
267 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.466762 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5992  inositol monophosphatase  66.15 
 
 
267 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2085  inositol monophosphatase  66.15 
 
 
267 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0813  inositol monophosphatase  59.85 
 
 
268 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000261138  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1196  inositol-phosphate phosphatase  65.77 
 
 
294 aa  333  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0278883 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5391  inositol-1(or 4)-monophosphatase  65.38 
 
 
267 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.268577  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3566  inositol monophosphatase  62.21 
 
 
353 aa  330  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1681  inositol monophosphatase  63.57 
 
 
268 aa  328  4e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0963  Inositol-phosphate phosphatase  62.98 
 
 
322 aa  326  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.220962  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1045  inositol-phosphate phosphatase  62.98 
 
 
347 aa  325  5e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0806171 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2070  inositol monophosphatase  61.45 
 
 
313 aa  321  8e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4248  inositol-phosphate phosphatase  62.21 
 
 
297 aa  320  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0646891  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  60.23 
 
 
266 aa  320  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2309  inositol-phosphate phosphatase  61.07 
 
 
304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.315096 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  54.65 
 
 
266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  54.26 
 
 
263 aa  302  4.0000000000000003e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0669  inositol monophosphate family protein  54.09 
 
 
267 aa  293  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0818  Inositol-phosphate phosphatase  54.09 
 
 
267 aa  293  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0219186  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2063  Inositol-phosphate phosphatase  56.59 
 
 
259 aa  288  6e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.948209  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  53.67 
 
 
266 aa  287  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  53.31 
 
 
267 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1712  hypothetical protein  50.97 
 
 
261 aa  284  8e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1712  hypothetical protein  50.97 
 
 
261 aa  284  8e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0826  inositol monophosphatase  51.74 
 
 
272 aa  284  8e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.229284 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  52.92 
 
 
267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  52.92 
 
 
267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  52.92 
 
 
267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  52.92 
 
 
267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  52.92 
 
 
267 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1419  inositol-1-monophosphatase  52.27 
 
 
271 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57884  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  52.94 
 
 
283 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  52.34 
 
 
259 aa  282  5.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  53.31 
 
 
267 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1233  inositol monophosphatase  52.27 
 
 
271 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.901192  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  52.92 
 
 
267 aa  280  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  52.92 
 
 
267 aa  280  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0719  inositol-1(or 4)-monophosphatase  52.76 
 
 
265 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000761228  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  50.98 
 
 
267 aa  279  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  51.76 
 
 
267 aa  278  8e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  49.43 
 
 
262 aa  276  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  51.75 
 
 
267 aa  276  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  51.52 
 
 
271 aa  275  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4616  inositol monophosphatase  52.08 
 
 
272 aa  275  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00318187  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4340  inositol-phosphate phosphatase  50.94 
 
 
272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.957686  hitchhiker  0.00000000805299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  51.14 
 
 
271 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0614  inositol monophosphatase  48.84 
 
 
266 aa  272  5.000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000550019  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3515  inositol-phosphate phosphatase  51.13 
 
 
271 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.588619 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0881  inositol-phosphate phosphatase  50.57 
 
 
272 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0838  inositol-phosphate phosphatase  50.19 
 
 
272 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976712  normal  0.859665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0868  inositol-phosphate phosphatase  50.19 
 
 
272 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  50 
 
 
267 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  50 
 
 
267 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  49.61 
 
 
270 aa  270  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  50 
 
 
267 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2787  inositol monophosphatase  49.61 
 
 
267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0013173  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  49.61 
 
 
267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  51.36 
 
 
267 aa  268  8e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  49.61 
 
 
267 aa  267  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  49.61 
 
 
267 aa  267  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  49.61 
 
 
267 aa  267  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  49.61 
 
 
267 aa  267  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  49.61 
 
 
267 aa  267  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  49.61 
 
 
267 aa  267  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  49.61 
 
 
267 aa  267  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  49.61 
 
 
267 aa  267  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3030  inositol monophosphatase  50.59 
 
 
268 aa  266  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0983926  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  49.61 
 
 
267 aa  266  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40440  Inositol-1-monophosphatase  52.87 
 
 
268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443027  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004363  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  49.6 
 
 
267 aa  264  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000312516  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0274  inositol monophosphate family protein  49.02 
 
 
288 aa  264  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578849  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1410  inositol-1(or 4)-monophosphatase  48.47 
 
 
267 aa  264  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1128  inositol-1-monophosphatase  49.02 
 
 
267 aa  263  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.768163  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  49.03 
 
 
267 aa  261  8e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>