More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0823 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0823  lactoylglutathione lyase  100 
 
 
128 aa  263  5e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457459  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3703  lactoylglutathione lyase  77.17 
 
 
146 aa  206  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  75.78 
 
 
138 aa  202  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1870  lactoylglutathione lyase  75 
 
 
138 aa  201  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2047  lactoylglutathione lyase  75 
 
 
138 aa  201  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.050639  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  75.78 
 
 
136 aa  200  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3939  lactoylglutathione lyase  74.8 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338387  normal  0.236164 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  72.66 
 
 
136 aa  195  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2552  glyoxalase I  69.53 
 
 
136 aa  184  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2915  lactoylglutathione lyase  67.94 
 
 
132 aa  180  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.401625 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0520  lactoylglutathione lyase  68.5 
 
 
135 aa  179  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0107856 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0396  lactoylglutathione lyase  67.72 
 
 
135 aa  178  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789224  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2925  lactoylglutathione lyase  65.91 
 
 
131 aa  178  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0411  lactoylglutathione lyase  68.5 
 
 
135 aa  178  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208299  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2232  lactoylglutathione lyase  68.8 
 
 
136 aa  178  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00348977  normal  0.524619 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1978  glyoxalase I  67.19 
 
 
135 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077498  hitchhiker  0.00100198 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01621  glyoxalase I, Ni-dependent  67.19 
 
 
135 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00282129  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1989  lactoylglutathione lyase  67.19 
 
 
135 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656309  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1728  glyoxalase I  67.19 
 
 
135 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2363  glyoxalase I  67.19 
 
 
135 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0314391  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01611  hypothetical protein  67.19 
 
 
135 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00318347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1547  glyoxalase I  67.19 
 
 
135 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.726295  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1862  glyoxalase I  67.19 
 
 
135 aa  177  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1739  glyoxalase I  66.93 
 
 
135 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00795001  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1605  glyoxalase I  66.93 
 
 
135 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1545  glyoxalase I  66.93 
 
 
135 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1908  glyoxalase I  66.93 
 
 
135 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1688  lactoylglutathione lyase  67.97 
 
 
135 aa  177  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.900233  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1532  glyoxalase I  66.14 
 
 
135 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.178368  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1843  glyoxalase I  66.41 
 
 
135 aa  177  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.816118  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1867  lactoylglutathione lyase  68 
 
 
136 aa  176  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0466217  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1760  lactoylglutathione lyase  66.93 
 
 
135 aa  175  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000424118  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2567  lactoylglutathione lyase  66.93 
 
 
135 aa  175  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000056884  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1869  lactoylglutathione lyase  66.93 
 
 
135 aa  175  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189976  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0502  lactoylglutathione lyase (glyoxalase I)  64.57 
 
 
136 aa  175  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2107  lactoylglutathione lyase  67.2 
 
 
136 aa  175  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201436  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0503  glyoxalase I  65.62 
 
 
135 aa  174  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457828  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  66.14 
 
 
135 aa  173  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2044  lactoylglutathione lyase  66.4 
 
 
136 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1795  glyoxalase I  65.35 
 
 
135 aa  172  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.118408  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2668  lactoylglutathione lyase  65.35 
 
 
135 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2101  lactoylglutathione lyase  64.8 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0339497  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0442  glyoxalase I  64.06 
 
 
135 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2200  lactoylglutathione lyase  65.35 
 
 
135 aa  170  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.351573  hitchhiker  0.00000414723 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1720  lactoylglutathione lyase  64.06 
 
 
135 aa  170  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000901416  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2179  lactoylglutathione lyase  63.49 
 
 
136 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19190  lactoylglutathione lyase  62.5 
 
 
129 aa  167  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1873  glyoxalase I  64 
 
 
136 aa  166  8e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2073  lactoylglutathione lyase  63.2 
 
 
136 aa  166  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05640  lactoylglutathione lyase  62.79 
 
 
128 aa  165  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  60.94 
 
 
129 aa  164  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  60.94 
 
 
128 aa  164  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2360  lactoylglutathione lyase  64 
 
 
136 aa  164  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18750  lactoylglutathione lyase  60.94 
 
 
128 aa  164  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000523182  normal  0.0730899 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02988  hypothetical protein  65.57 
 
 
129 aa  163  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0531  lactoylglutathione lyase  65.08 
 
 
138 aa  163  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000101735  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4018  glyoxalase I  62.5 
 
 
128 aa  163  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000451487  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1623  lactoylglutathione lyase  61.72 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000216677  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0580  lactoylglutathione lyase  59.38 
 
 
129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1865  lactoylglutathione lyase  63.49 
 
 
138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.296961  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1837  lactoylglutathione lyase  62.4 
 
 
136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429943  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1402  lactoylglutathione lyase  59.06 
 
 
127 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  61.72 
 
 
129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0213  lactoylglutathione lyase  59.38 
 
 
129 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  61.72 
 
 
129 aa  161  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2732  lactoylglutathione lyase  59.38 
 
 
129 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1845  lactoylglutathione lyase  61.72 
 
 
128 aa  161  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0681  lactoylglutathione lyase  61.72 
 
 
128 aa  161  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.553347  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2346  lactoylglutathione lyase  59.38 
 
 
129 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.546588  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0712  lactoylglutathione lyase  59.38 
 
 
129 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2426  lactoylglutathione lyase  59.38 
 
 
129 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792679  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0697  lactoylglutathione lyase  59.38 
 
 
129 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  60.94 
 
 
129 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0876  lactoylglutathione lyase  59.38 
 
 
238 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002942  lactoylglutathione lyase  64.75 
 
 
129 aa  160  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000118696  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0739  glyoxalase I  60.16 
 
 
132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.871991  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2098  lactoylglutathione lyase  62.2 
 
 
128 aa  159  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1765  lactoylglutathione lyase  60.16 
 
 
128 aa  158  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0566  lactoylglutathione lyase  60.94 
 
 
135 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0402  lactoylglutathione lyase  60.94 
 
 
135 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69151  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2057  lactoylglutathione lyase  65.6 
 
 
136 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000866783  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2281  lactoylglutathione lyase  65.6 
 
 
136 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00527881  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2104  lactoylglutathione lyase  65.6 
 
 
136 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00629536  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000260  lactoylglutathione lyase  62.99 
 
 
128 aa  158  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3539  glyoxalase I  59.38 
 
 
127 aa  157  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1182  lactoylglutathione lyase  62.5 
 
 
128 aa  157  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  59.38 
 
 
128 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2413  response regulator receiver domain-containing protein  59.52 
 
 
127 aa  156  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0638  glyoxalase I  59.06 
 
 
137 aa  155  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.144519  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2709  lactoylglutathione lyase  59.84 
 
 
127 aa  155  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0169  lactoylglutathione lyase  57.81 
 
 
137 aa  155  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2269  lactoylglutathione lyase  64.8 
 
 
136 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151296  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4555  hypothetical protein  64.8 
 
 
136 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  56.69 
 
 
130 aa  153  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2625  glyoxalase I  59.38 
 
 
129 aa  153  9e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738569  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4951  lactoylglutathione lyase  57.48 
 
 
135 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1510  lactoylglutathione lyase  59.38 
 
 
127 aa  152  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345652  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  57.48 
 
 
130 aa  152  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02261  putative lactoylglutathione lyase  57.14 
 
 
132 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0600753  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2563  lactoylglutathione lyase  58.4 
 
 
136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.023799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>