More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0809 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 318 aa  653    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  82.85 
 
 		 312 aa  455  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  59.07 
 
 		 287 aa  363  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  51.22 
 
 		 312 aa  320  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  49.3 
 
 		 318 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  49.52 
 
 		 318 aa  309  4e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  49.3 
 
 		 318 aa  309  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  49.65 
 
 		 318 aa  308  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  43.32 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  42.7 
 
 		 332 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 310 aa  158  9e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  28.87 
 
 		 438 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  30.84 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  29 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  30.14 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  30.05 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  32.87 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  32.87 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  30.38 
 
 		 318 aa  112  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  30.17 
 
 		 342 aa  112  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  26.43 
 
 		 352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  29.58 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  28.97 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  30.07 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  29.58 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  28.62 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  26.5 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  28.17 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  30.85 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  28.64 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  26.5 
 
 		 310 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  29.58 
 
 		 339 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  26.77 
 
 		 323 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 		 332 aa  102  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  28.7 
 
 		 319 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  27.62 
 
 		 347 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 		 319 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 		 336 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  29.11 
 
 		 319 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 		 319 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  26.5 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  28.21 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  28.64 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  30.17 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  29.37 
 
 		 307 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  29.37 
 
 		 307 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  27 
 
 		 367 aa  97.4  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 		 317 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  26.86 
 
 		 364 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  28.99 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  26.86 
 
 		 364 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  29.88 
 
 		 644 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 		 313 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  26.79 
 
 		 334 aa  95.9  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  27 
 
 		 304 aa  95.9  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  30.65 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  29.91 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  28.21 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 		 315 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  31.79 
 
 		 272 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  28.06 
 
 		 342 aa  91.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  27.97 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  26.67 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  28.84 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  26.18 
 
 		 321 aa  90.5  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  27.87 
 
 		 315 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  28.84 
 
 		 319 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  28.23 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  26.84 
 
 		 637 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.08 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  28.91 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  31.13 
 
 		 310 aa  87  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  29.27 
 
 		 309 aa  85.9  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 		 334 aa  85.9  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>