46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0808 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  297  4e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  78.62 
 
 		 145 aa  238  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  68.1 
 
 		 137 aa  164  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  40.52 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  44.54 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  47.41 
 
 		 150 aa  114  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  39.72 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  43.97 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  43.97 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  44.83 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2282  hypothetical protein  36.84 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1593  hypothetical protein  37.72 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0563903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1669  hypothetical protein  36.84 
 
 		 113 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  38.04 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  37.34 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  35.53 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  34.17 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  34.46 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  32.93 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3212  hypothetical protein  32.62 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  38.52 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  31.61 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  33.1 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  35.29 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  31.58 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3213  hypothetical protein  30.82 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  37.7 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  26.5 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  33.09 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  24.79 
 
 		 111 aa  52.8  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  30.09 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  27.97 
 
 		 114 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1515  hypothetical protein  32.33 
 
 		 168 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  30.77 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  27.67 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  28.33 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2005  hypothetical protein  32.28 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242078  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  29.73 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  29.67 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  28.21 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  25.86 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0256  hypothetical protein  28.3 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0557189  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  22.52 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2357  hypothetical protein  35.45 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108043  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1626  hypothetical protein  22.61 
 
 		 110 aa  40  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1908  hypothetical protein  29.27 
 
 		 124 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.512123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>