95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0786 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  100 
 
 		 310 aa  650    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  64.14 
 
 		 304 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  62.79 
 
 		 304 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  62.46 
 
 		 304 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  62.46 
 
 		 304 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  66.03 
 
 		 291 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  65.15 
 
 		 293 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  58.66 
 
 		 352 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  54.62 
 
 		 313 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  53.08 
 
 		 309 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  48.99 
 
 		 327 aa  294  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  44.8 
 
 		 346 aa  292  5e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1476  cytochrome c class I  49.33 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  45.06 
 
 		 352 aa  288  6e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  43.19 
 
 		 351 aa  288  9e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4236  cytochrome c class I  51.09 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185461  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  42.61 
 
 		 351 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  45.59 
 
 		 353 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  42.61 
 
 		 351 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  43.79 
 
 		 355 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  43.79 
 
 		 355 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  43.48 
 
 		 355 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  42.61 
 
 		 352 aa  279  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  43.17 
 
 		 355 aa  278  9e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  43.43 
 
 		 372 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003030  cytochrome c family protein  43.31 
 
 		 350 aa  270  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  43.48 
 
 		 282 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  40.97 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  45.18 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  39.69 
 
 		 269 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  38.2 
 
 		 675 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  40.34 
 
 		 675 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4873  cytochrome c class I  37.8 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  37.27 
 
 		 698 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  36.48 
 
 		 331 aa  172  5e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.59 
 
 		 689 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  40.77 
 
 		 694 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  40.77 
 
 		 721 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  36.43 
 
 		 712 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  39.16 
 
 		 773 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  40.34 
 
 		 721 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  38.74 
 
 		 669 aa  168  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  37.45 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  38.66 
 
 		 691 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  39.09 
 
 		 728 aa  165  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  35.96 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  37.97 
 
 		 369 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6947  cytochrome c class I  36.65 
 
 		 358 aa  162  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  37.97 
 
 		 357 aa  162  8.000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.27 
 
 		 726 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  36.6 
 
 		 708 aa  158  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  38.89 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.66 
 
 		 699 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  42.05 
 
 		 329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2599  cytochrome c family protein  35.8 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.349522  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1092  cytochrome c class I  37.19 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  35.9 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2608  cytochrome c class I  37.34 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  36.29 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  39.01 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  39.64 
 
 		 407 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  39.64 
 
 		 407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  32.63 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  38.25 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  54.24 
 
 		 139 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  30.25 
 
 		 671 aa  112  9e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_003296  RS03090  putative cytochrome C signal peptide protein  33.63 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.649207  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2708  cytochrome c, class I  32.11 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0051  cytochrome c family protein  31.65 
 
 		 347 aa  89.4  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0075  cytochrome c family protein  31.65 
 
 		 347 aa  89.4  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.667536  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0036  cytochrome c family protein  31.65 
 
 		 347 aa  89  9e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.170219  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0653  cytochrome c  50 
 
 		 130 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0884  cytochrome c family protein, degenerate  53.75 
 
 		 125 aa  87  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4179  cytochrome c, class I  27.57 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402721  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0885  cytochrome C  32.14 
 
 		 181 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1187  cytochrome C  45.45 
 
 		 79 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  29.2 
 
 		 348 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 185 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  26.5 
 
 		 211 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  31.03 
 
 		 678 aa  46.2  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  32.03 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  47.92 
 
 		 1113 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  32.17 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  32.17 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2157  hypothetical protein  32.97 
 
 		 171 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.580825  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  32.17 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  32.48 
 
 		 421 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4159  putative sulfur oxidation protein (SoxA); cytochrome c precursor  24.49 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  27.81 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  29.7 
 
 		 632 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  30.3 
 
 		 404 aa  43.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  30.43 
 
 		 468 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.56 
 
 		 447 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  29.81 
 
 		 242 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 220 aa  42.7  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>