214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0719 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0719  OmpW family protein  100 
 
 		 214 aa  434  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1128  OmpW family protein  85.98 
 
 		 210 aa  348  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  45.33 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  45.28 
 
 		 229 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  43.95 
 
 		 243 aa  161  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  43.15 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  41.98 
 
 		 230 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  42.92 
 
 		 195 aa  154  9e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  42.92 
 
 		 195 aa  154  9e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  41.26 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  42.27 
 
 		 267 aa  151  8e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  40.47 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  39.63 
 
 		 233 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  42.33 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  44.22 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  43.07 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  43.07 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  41.11 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  42.19 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  39.55 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  39.25 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  41.71 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  39.44 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  38.14 
 
 		 228 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  41.36 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  40.84 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2319  OmpW family protein  41.45 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0284757 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  42.65 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  38.74 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  38.43 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  33.03 
 
 		 208 aa  121  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0567  OmpW family protein  33.49 
 
 		 208 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0535  outer membrane protein, OmpW  33.49 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  36.04 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  33.33 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  33.33 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  33.33 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  33.33 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  33.33 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  33.8 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  32.87 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  35.91 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  35.91 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  37.02 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  35.91 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  37.02 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  32.58 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  35.36 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  35.36 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  35.36 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  35.36 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  35.36 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  31.72 
 
 		 219 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  33.33 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4877  OmpW family protein  33.48 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.913281  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  32.37 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  30.45 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  34.91 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  30.45 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1957  OmpW family protein  32.26 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  30 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  29.06 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  30.14 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5385  OmpW family protein  30.26 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3005  OmpW family protein  35.2 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.561754  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1052  OmpW  34.42 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  28.38 
 
 		 213 aa  85.9  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  31.7 
 
 		 217 aa  84.7  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  33.79 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5444  OmpW family protein  30.73 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  36.42 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1326  OmpW family outer membrane protein  32.63 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0285584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1823  OmpW family protein  31.37 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  33.12 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  29.68 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  31.25 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  34.87 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  28.51 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  27.93 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  30 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  28.77 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  35.33 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  29.22 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  28.77 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  28.77 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  28.77 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  28.77 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  28.77 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  33.87 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  36.05 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  36.05 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  34.67 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  28.77 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  28.77 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  34.46 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  34.46 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  30.14 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  29.41 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  31.15 
 
 		 228 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  28.37 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.904155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>