More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0683 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  219  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  188  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  83.04 
 
 
112 aa  188  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  83.04 
 
 
112 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  82.14 
 
 
112 aa  187  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  184  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  184  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  184  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  183  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  182  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  182  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  182  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  182  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  181  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  80.36 
 
 
112 aa  181  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0742  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0306564  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3013  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00180505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  180  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  180  7e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  78.57 
 
 
112 aa  180  7e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  180  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  180  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
136 aa  180  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  180  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  180  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  180  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  180  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  77.68 
 
 
112 aa  179  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  179  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  179  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  178  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  178  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  177  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  177  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  177  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  177  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  177  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2112  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  176  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  176  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  176  8e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  176  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  176  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  176  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  176  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
114 aa  176  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  176  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  176  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  175  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  175  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  175  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  175  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1710  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
133 aa  175  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.619022  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  73.21 
 
 
112 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  73.21 
 
 
112 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  174  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  174  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  174  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  75.89 
 
 
112 aa  174  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1663  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  174  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.824699  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  174  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  174  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  77.68 
 
 
112 aa  174  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  174  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  174  5e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  75 
 
 
112 aa  173  6e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  173  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  173  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  73.21 
 
 
112 aa  173  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  173  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  172  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  173  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  173  9e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  173  9e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>