More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0674 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  100 
 
 		 417 aa  835    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  70.72 
 
 		 447 aa  589  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  71.71 
 
 		 443 aa  578  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  71.22 
 
 		 444 aa  571  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  71.14 
 
 		 439 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  71.53 
 
 		 446 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  71.5 
 
 		 447 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  70.15 
 
 		 447 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  69.51 
 
 		 443 aa  527  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  70 
 
 		 443 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  54.59 
 
 		 436 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  54.35 
 
 		 436 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  54.59 
 
 		 436 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  53.55 
 
 		 441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  55.91 
 
 		 441 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  53.49 
 
 		 437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  55.67 
 
 		 424 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  56.05 
 
 		 424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  53.25 
 
 		 437 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  55.37 
 
 		 436 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  54.17 
 
 		 425 aa  435  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  55.5 
 
 		 439 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  53.81 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  53.81 
 
 		 436 aa  431  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  51.93 
 
 		 437 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  51.93 
 
 		 437 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  53.55 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  55.45 
 
 		 438 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  51.11 
 
 		 429 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  50.97 
 
 		 437 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  53.19 
 
 		 419 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  50.86 
 
 		 430 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  53.73 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  47.45 
 
 		 431 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  53.9 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  52.74 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  52.74 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  47.52 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  47.52 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  53.19 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  47.28 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  46.53 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  52.23 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  45.28 
 
 		 438 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  47 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  47 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  45.68 
 
 		 450 aa  355  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  52.93 
 
 		 428 aa  351  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 		 430 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 422 aa  288  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 430 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  39.61 
 
 		 429 aa  285  8e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  34.91 
 
 		 438 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  32.13 
 
 		 430 aa  173  5e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 416 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  28.3 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  28.3 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  28.3 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  28.3 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  28.3 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  28.54 
 
 		 400 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  28.3 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  30 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0504  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  28.06 
 
 		 400 aa  136  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 402 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 400 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  27.45 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  27.45 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 408 aa  132  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  29.41 
 
 		 413 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  28.23 
 
 		 436 aa  131  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 411 aa  131  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  26.53 
 
 		 398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  26.53 
 
 		 398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  26.53 
 
 		 398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  26.28 
 
 		 398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  26.28 
 
 		 398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  27.38 
 
 		 402 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 412 aa  129  7.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  29.21 
 
 		 402 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  27.14 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  28.93 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  27.38 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  29.21 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  29.21 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1924  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 458 aa  126  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  28.65 
 
 		 402 aa  126  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 412 aa  126  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  26.65 
 
 		 412 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>