68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0530 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  40.25 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  41.56 
 
 		 255 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  42.74 
 
 		 251 aa  171  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  39.09 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  41.32 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  37.34 
 
 		 245 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  38.82 
 
 		 245 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  36.93 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  36.93 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  36.93 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  38.4 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  38.4 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  37.3 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  36.63 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  35.42 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  36.29 
 
 		 249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  34.39 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  36.25 
 
 		 254 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  35.86 
 
 		 254 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  35.1 
 
 		 256 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  38.59 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  33.6 
 
 		 260 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  34.44 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  34.71 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  30.17 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  35.68 
 
 		 276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  32.78 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3774  hypothetical protein  32.57 
 
 		 282 aa  108  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0627  hypothetical protein  31.28 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0669  hypothetical protein  31.28 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  31.8 
 
 		 245 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  31.93 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  31.93 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  29.88 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  34.02 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  34.39 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  31.89 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  30.99 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  30.13 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  31.58 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  29.27 
 
 		 260 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  28.8 
 
 		 260 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  28.8 
 
 		 260 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  28.8 
 
 		 260 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  25.44 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  26.61 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  26.41 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2451  hypothetical protein  25.17 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  29.55 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  26.05 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  30.17 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  24.36 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  24.36 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  24.36 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  24.18 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  23.21 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4327  protein of unknown function DUF81  27.62 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  26.2 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  27.15 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  27.15 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  25.74 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2436  hypothetical protein  26.74 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0636589 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  29.6 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  23.55 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  29.7 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  23.2 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  21.26 
 
 		 252 aa  42  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>