More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0419 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0419  asparaginase/glutaminase  100 
 
 
358 aa  728    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000000749925  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1242  Asparaginase  35.58 
 
 
330 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0987888  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1791  L-asparaginase, type II  36.05 
 
 
340 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1392  L-asparaginase, type II  35.74 
 
 
340 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1819  L-asparaginases, type II  36.05 
 
 
340 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1905  L-asparaginase, type II  35.11 
 
 
340 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217284 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5182  L-asparaginase, type II  35 
 
 
340 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699287  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1181  Asparaginase  34.58 
 
 
330 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177192  normal  0.183755 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6197  L-asparaginases, type II  34.48 
 
 
365 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1778  L-asparaginase, type II  35.35 
 
 
338 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116458  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1882  L-asparaginases, type II  34.48 
 
 
365 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1306  L-asparaginase II precursor signal peptide protein  34.98 
 
 
367 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1980  asparaginase  34.19 
 
 
333 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2007  L-asparaginase, type II  35.67 
 
 
378 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.354174  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2464  L-asparaginase, type II  34.71 
 
 
346 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232555  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2953  asparaginase  35.37 
 
 
316 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06515  L-asparaginase II  34.93 
 
 
338 aa  149  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1624  L-asparaginase, type II  33.9 
 
 
355 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.53483 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000646  L-asparaginase  34.12 
 
 
354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1919  asparaginase  34.14 
 
 
321 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2166  asparaginase family protein  34.35 
 
 
347 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.559992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1175  asparaginase family protein  34.35 
 
 
347 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120195  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2305  L-asparaginase, type II  34.35 
 
 
347 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1413  asparaginase family protein  34.35 
 
 
347 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2265  L-asparaginase, type II  34.35 
 
 
347 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.609083  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1902  asparaginase family protein  34.35 
 
 
347 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3402  asparaginase family protein  34.35 
 
 
347 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432934  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2428  asparaginase family protein  34.65 
 
 
396 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0619  L-asparaginase, type II  31.91 
 
 
352 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2637  Asparaginase  36.8 
 
 
329 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3745  L-asparaginase, type II  32.22 
 
 
356 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0646  L-asparaginase, type II  31.91 
 
 
352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0641  L-asparaginase, type II  31.91 
 
 
352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  33.72 
 
 
348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4896  asparaginase  36.06 
 
 
356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.970044  normal  0.227329 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00150  L-asparaginase type II family protein  31.56 
 
 
328 aa  136  4e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.589872 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0013  putative phage integrase  31.9 
 
 
344 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1865  asparaginase  37.54 
 
 
315 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2081  asparaginase  33.03 
 
 
309 aa  133  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.438459 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3916  L-asparaginase, type II  33.13 
 
 
349 aa  133  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3792  L-asparaginase  33.24 
 
 
347 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0751735  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3912  L-asparaginase  33.24 
 
 
347 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.278506  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3973  L-asparaginase  33.24 
 
 
347 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3870  L-asparaginase  33.24 
 
 
347 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3804  L-asparaginase  33.24 
 
 
347 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3314  L-asparaginase, type II  33.05 
 
 
346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0996  L-asparaginase, type II  33.05 
 
 
346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.396669  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1145  L-asparaginase, type II  31.49 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.209792  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2993  asparaginase  33.82 
 
 
341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.740991  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1550  Asparaginase  35.69 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1025  L-asparaginase II  31.52 
 
 
347 aa  127  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000214281  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00300  asparaginase, aspartic hydroxamate res. (Eurofung)  31.42 
 
 
378 aa  126  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0205708  normal  0.375032 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2559  asparaginase/glutaminase  34.81 
 
 
325 aa  126  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0847476  normal  0.0141583 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1178  L-asparaginase, type II  30.77 
 
 
347 aa  126  8.000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2924  L-asparaginase, type II  32.56 
 
 
348 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2006  L-asparaginase, type II  30.54 
 
 
348 aa  125  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  31.7 
 
 
348 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1362  L-asparaginase II  30.35 
 
 
348 aa  125  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000230453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2309  asparaginase  35.08 
 
 
323 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00324768  normal  0.172792 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  31.5 
 
 
348 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3114  L-asparaginase, type II  32.16 
 
 
348 aa  123  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2339  Asparaginase  32.81 
 
 
352 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0801  Asparaginase  33.53 
 
 
340 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4260  L-asparaginase II  31.15 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1705  L-asparaginase II  32.36 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108514  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1118  L-asparaginase II  31.25 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.881329 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02787  periplasmic L-asparaginase II  31.15 
 
 
348 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00534571  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3389  L-asparaginase II  31.25 
 
 
348 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0757  L-asparaginase II  31.25 
 
 
348 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188173 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3099  L-asparaginase II  31.25 
 
 
348 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149168 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3117  L-asparaginase II  31.25 
 
 
348 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02750  hypothetical protein  31.15 
 
 
348 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0683  L-asparaginases, type II  31.31 
 
 
316 aa  119  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1949  L-asparaginase II  30.38 
 
 
345 aa  119  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0010291  normal  0.072144 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3301  L-asparaginase II  30.92 
 
 
348 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2674  L-asparaginase II  30.6 
 
 
345 aa  119  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2586  L-asparaginase II  30.6 
 
 
345 aa  119  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1606  L-asparaginase, type II  30.61 
 
 
352 aa  119  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57786  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0738  L-asparaginase, type II  30.92 
 
 
348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3566  asparaginase  32.93 
 
 
318 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000188072  hitchhiker  0.00798524 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0029  L-asparaginase  29.19 
 
 
338 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.304062  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0029  L-asparaginase  31.79 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.51172  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2449  asparaginase  33.84 
 
 
327 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2132  asparaginase  33.63 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4951  L-asparaginase, type II  31.82 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1657  L-asparaginase II  30.25 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3345  L-asparaginase II  30.59 
 
 
348 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  0.418181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3353  L-asparaginase II  30.59 
 
 
348 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.529278 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3449  L-asparaginase II  30.59 
 
 
348 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.65351  normal  0.38324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3269  L-asparaginase II  30.59 
 
 
348 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3280  L-asparaginase II  30.59 
 
 
348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0792755 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0029  Asparaginase/glutaminase  29.94 
 
 
328 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1886  putative L-asparaginase type II  28.92 
 
 
332 aa  102  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0083675  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1960  L-asparaginase type II, putative  28.92 
 
 
332 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0890  asparaginase  32.3 
 
 
354 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.573715 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4228  L-asparaginase, type II  30.77 
 
 
330 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965091  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1812  L-asparaginase, type II  28.14 
 
 
374 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0266176  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0442  L-asparaginases, type II  28.86 
 
 
379 aa  97.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.228079  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3140  asparaginase  28.32 
 
 
352 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1583  asparaginase  27.6 
 
 
375 aa  96.3  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000246256  normal  0.508617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>