267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0380 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 162 aa  333  7e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  84.57 
 
 		 162 aa  283  5.999999999999999e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  54.43 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  51.83 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  51.57 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  50.94 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  50.94 
 
 		 167 aa  168  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  49.37 
 
 		 160 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  48.73 
 
 		 160 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  51.25 
 
 		 165 aa  159  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  54.61 
 
 		 167 aa  157  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  46.84 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  48.1 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 219 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  47.47 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  53.9 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  53.9 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  53.9 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 		 166 aa  154  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  53.9 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  53.9 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  51.2 
 
 		 169 aa  154  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  47.17 
 
 		 177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  46.2 
 
 		 160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  48.77 
 
 		 163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  50 
 
 		 162 aa  154  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 166 aa  154  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  53.9 
 
 		 167 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 195 aa  154  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  50 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  47.27 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 		 209 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  52.48 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  49.38 
 
 		 162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  45.83 
 
 		 170 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  44.94 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  53.9 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  48.77 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  44.3 
 
 		 160 aa  148  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  47.88 
 
 		 170 aa  148  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  48.18 
 
 		 162 aa  147  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  45.57 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  45.57 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  45.57 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  44.3 
 
 		 160 aa  147  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  45.57 
 
 		 160 aa  147  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  44.94 
 
 		 160 aa  147  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  44.58 
 
 		 183 aa  147  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  40.62 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  44.94 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  47.13 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  45.12 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  43.56 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  47.3 
 
 		 172 aa  144  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  45.99 
 
 		 162 aa  144  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  45.99 
 
 		 162 aa  144  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  45.99 
 
 		 162 aa  144  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  45.99 
 
 		 162 aa  144  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  45.99 
 
 		 162 aa  144  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  45.99 
 
 		 162 aa  144  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  45.99 
 
 		 162 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  45.12 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 		 162 aa  142  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  44.17 
 
 		 167 aa  142  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  49.66 
 
 		 168 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  47.3 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 		 162 aa  141  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  43.03 
 
 		 171 aa  141  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  49.66 
 
 		 169 aa  141  3e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 183 aa  141  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  44.65 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  44.03 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  51.54 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  46.06 
 
 		 163 aa  141  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 161 aa  140  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  47.27 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  47.62 
 
 		 170 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 163 aa  140  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 164 aa  140  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  44.53 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  45.12 
 
 		 170 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  47.26 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  48.59 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  50.77 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 		 174 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 171 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  44.31 
 
 		 195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  42.5 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  43.04 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  41.21 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  45.18 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2360  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.138466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>