More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0358 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  100 
 
 
242 aa  489  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  79.42 
 
 
244 aa  410  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  79.01 
 
 
244 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  81.51 
 
 
240 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  81.51 
 
 
240 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  80.67 
 
 
238 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  71.97 
 
 
240 aa  362  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  70.59 
 
 
240 aa  351  7e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  70.59 
 
 
240 aa  350  8e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  69.04 
 
 
240 aa  346  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  58.75 
 
 
238 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  58.75 
 
 
238 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  57.92 
 
 
238 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  54.01 
 
 
260 aa  262  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  51.9 
 
 
258 aa  257  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  50.63 
 
 
235 aa  256  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  52.72 
 
 
237 aa  256  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.1 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  50.21 
 
 
236 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  50.84 
 
 
235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  52.32 
 
 
238 aa  252  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  51.48 
 
 
244 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  52.52 
 
 
234 aa  251  5.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  51.05 
 
 
238 aa  251  6e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  50.84 
 
 
234 aa  251  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  50.63 
 
 
235 aa  250  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  50.21 
 
 
238 aa  249  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  51.05 
 
 
239 aa  250  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  51.26 
 
 
247 aa  249  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 
238 aa  249  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  52.32 
 
 
249 aa  250  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  50.84 
 
 
247 aa  249  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0477  ABC transporter related  50.42 
 
 
238 aa  249  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  51.05 
 
 
238 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  51.05 
 
 
238 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  51.05 
 
 
238 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  49.79 
 
 
238 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  50.63 
 
 
235 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  52.52 
 
 
239 aa  249  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  51.68 
 
 
234 aa  248  6e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  49.79 
 
 
238 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  52.74 
 
 
234 aa  248  6e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  49.37 
 
 
238 aa  248  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  51.9 
 
 
236 aa  248  7e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  49.37 
 
 
238 aa  248  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  50.41 
 
 
256 aa  248  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  51.05 
 
 
237 aa  248  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  49.37 
 
 
238 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  49.37 
 
 
238 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.37 
 
 
238 aa  247  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.37 
 
 
238 aa  247  9e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.37 
 
 
238 aa  247  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  51.68 
 
 
247 aa  248  9e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.37 
 
 
238 aa  247  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  50.63 
 
 
234 aa  247  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  51.26 
 
 
234 aa  247  9e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.37 
 
 
238 aa  247  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.37 
 
 
238 aa  247  9e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.37 
 
 
234 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  50.21 
 
 
238 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  50 
 
 
235 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  50.21 
 
 
242 aa  247  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.95 
 
 
238 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  51.48 
 
 
259 aa  246  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  50 
 
 
240 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  50.21 
 
 
239 aa  246  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  49.58 
 
 
247 aa  246  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  50.21 
 
 
238 aa  245  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  50 
 
 
234 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.63 
 
 
244 aa  244  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  50.21 
 
 
237 aa  244  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  49.79 
 
 
242 aa  244  6.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  49.16 
 
 
237 aa  244  9e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  48.95 
 
 
241 aa  244  9e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  50.21 
 
 
237 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  49.37 
 
 
238 aa  243  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  49.58 
 
 
233 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
234 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2267  ABC transporter related  51.46 
 
 
238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00164993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  50.63 
 
 
237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  50.42 
 
 
238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  48.12 
 
 
237 aa  242  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  48.55 
 
 
238 aa  242  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  51.05 
 
 
234 aa  242  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  50 
 
 
234 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  48.74 
 
 
233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  49.58 
 
 
236 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  50 
 
 
247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  50.21 
 
 
238 aa  241  9e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  49.37 
 
 
242 aa  241  9e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  49.58 
 
 
235 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  50 
 
 
251 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  50.21 
 
 
234 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  47.52 
 
 
238 aa  240  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  49.37 
 
 
242 aa  240  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  51.26 
 
 
234 aa  239  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.79 
 
 
238 aa  239  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  51.67 
 
 
236 aa  240  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  47.68 
 
 
236 aa  240  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  51.48 
 
 
237 aa  240  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>