212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0321 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0321  methyltransferase type 11  100 
 
 
277 aa  568  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  38.6 
 
 
290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  37.73 
 
 
290 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0254  methyltransferase type 12  38.1 
 
 
290 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  37.73 
 
 
290 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  37.73 
 
 
290 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0305  hypothetical protein  33.33 
 
 
196 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0299  hypothetical protein  35.17 
 
 
171 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0300  hypothetical protein  45.98 
 
 
115 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  23.17 
 
 
2046 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
733 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1361  methyltransferase type 11  25.22 
 
 
854 aa  66.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.610168  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3816  methyltransferase type 11  25 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.552016  normal  0.740523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  28.35 
 
 
317 aa  62.4  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2401  hypothetical protein  24.55 
 
 
288 aa  62  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
205 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2745  Methyltransferase type 11  22.49 
 
 
482 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.57 
 
 
351 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
244 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
204 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
204 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  26.85 
 
 
204 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  31.03 
 
 
213 aa  57  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 
204 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2749  Methyltransferase type 11  22.11 
 
 
471 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  26.79 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  29.66 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  32.38 
 
 
363 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  30.1 
 
 
202 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 
365 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2403  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  28.04 
 
 
204 aa  53.1  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 
362 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  28.3 
 
 
341 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6182  hypothetical protein  30.58 
 
 
299 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011056  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  28.3 
 
 
332 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  28.44 
 
 
352 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  24.78 
 
 
324 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  26.61 
 
 
400 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  25.23 
 
 
204 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
711 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  27.36 
 
 
327 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3065  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.57 
 
 
216 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  26.97 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  25.23 
 
 
204 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 
220 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  28.46 
 
 
363 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  25.23 
 
 
204 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_4986  predicted protein  29.66 
 
 
239 aa  50.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.778509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.11 
 
 
325 aa  49.7  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 
710 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  27.36 
 
 
328 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  26.85 
 
 
339 aa  49.7  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  27.36 
 
 
328 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  27.36 
 
 
328 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  27.12 
 
 
276 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0061  Orf34  30.19 
 
 
246 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  25.83 
 
 
271 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0248  methyltransferase type 11  26.36 
 
 
195 aa  49.3  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.65 
 
 
232 aa  49.3  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1562  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.19 
 
 
246 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1474  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.19 
 
 
246 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0302671  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  26.87 
 
 
270 aa  48.9  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0696  methyltransferase  31.43 
 
 
217 aa  49.3  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3642  methyltransferase type 11  24.86 
 
 
355 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000500593  decreased coverage  0.0000779954 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  22.64 
 
 
185 aa  48.9  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  31.13 
 
 
317 aa  49.3  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  24.11 
 
 
320 aa  48.9  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1161  methyltransferase type 11  24.84 
 
 
196 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  31.36 
 
 
208 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  30.93 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.03 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  31.06 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1446  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  25.5 
 
 
388 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.220597  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  27 
 
 
273 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2158  methyltransferase type 11  27.35 
 
 
363 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  25.71 
 
 
210 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.62 
 
 
296 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
246 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  29.92 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  28.97 
 
 
197 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  25 
 
 
328 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0801  putative methyltransferase  31.43 
 
 
217 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  26.24 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0529  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.636084 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2175  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
221 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.300294  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6864  Methyltransferase type 11  27.05 
 
 
307 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 
210 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  26.55 
 
 
392 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0956  methyltransferase type 11  25.95 
 
 
487 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2343  methyltransferase type 11  27.43 
 
 
367 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  25.93 
 
 
310 aa  46.6  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  29.59 
 
 
629 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3717  Methyltransferase type 12  29.75 
 
 
261 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  26.15 
 
 
349 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  24.53 
 
 
225 aa  46.6  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>