More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0319 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  100 
 
 
455 aa  934    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  55.24 
 
 
469 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  55.46 
 
 
471 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 
465 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 
465 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 
469 aa  514  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 
465 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 
465 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 
465 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  50.11 
 
 
472 aa  474  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  50.22 
 
 
440 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  48.26 
 
 
464 aa  448  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  47.14 
 
 
448 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03166  ABC transporter, ATP binding protein  42.35 
 
 
437 aa  359  7e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  44.01 
 
 
450 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.41 
 
 
454 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  43.93 
 
 
438 aa  330  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  41.83 
 
 
449 aa  323  6e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  42.22 
 
 
468 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  46.28 
 
 
456 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  41.8 
 
 
488 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  41.87 
 
 
870 aa  302  9e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  40.47 
 
 
443 aa  295  8e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  38.22 
 
 
432 aa  295  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  38.6 
 
 
429 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  52.71 
 
 
435 aa  289  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  38 
 
 
472 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  40.45 
 
 
447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  46.56 
 
 
457 aa  284  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  54.03 
 
 
816 aa  281  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  37.44 
 
 
410 aa  280  3e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  38.18 
 
 
424 aa  279  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  39.6 
 
 
493 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  37.68 
 
 
472 aa  270  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  35.67 
 
 
498 aa  269  7e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  37.05 
 
 
406 aa  269  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  37.26 
 
 
421 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  37.03 
 
 
421 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  35.15 
 
 
436 aa  264  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  42.69 
 
 
416 aa  261  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  34.38 
 
 
405 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  36.56 
 
 
406 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  35.14 
 
 
405 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0594  ABC transporter related  47.88 
 
 
260 aa  257  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0939  ABC transporter related  47.17 
 
 
254 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  36.71 
 
 
416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  39.29 
 
 
416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  35.68 
 
 
478 aa  253  6e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  38.95 
 
 
423 aa  253  7e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  37.24 
 
 
711 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  48.97 
 
 
390 aa  246  6e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  48.97 
 
 
390 aa  246  8e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  45.74 
 
 
415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  45.56 
 
 
393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.56 
 
 
393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1731  ABC transporter-related protein  33.87 
 
 
410 aa  241  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  35.71 
 
 
407 aa  239  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  36.03 
 
 
409 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  33.74 
 
 
424 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  46.4 
 
 
246 aa  237  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  35.78 
 
 
411 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  35.56 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  45.69 
 
 
422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  44.98 
 
 
419 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.86 
 
 
415 aa  228  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  44.84 
 
 
421 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  33.82 
 
 
408 aa  227  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  40.77 
 
 
424 aa  226  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  41 
 
 
427 aa  226  7e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  43.53 
 
 
392 aa  225  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  34.21 
 
 
439 aa  225  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  39.74 
 
 
418 aa  225  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  50.25 
 
 
244 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  31.8 
 
 
394 aa  225  2e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  44.18 
 
 
418 aa  223  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  35 
 
 
425 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  48.73 
 
 
420 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  41.95 
 
 
427 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  41.09 
 
 
429 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  31.71 
 
 
416 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  40.82 
 
 
395 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  43.63 
 
 
428 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  39.36 
 
 
419 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  34.67 
 
 
424 aa  217  4e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  41.86 
 
 
418 aa  216  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2170  putative ABC transporter  33.57 
 
 
431 aa  216  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  44.9 
 
 
429 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  32.87 
 
 
411 aa  216  9e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 
422 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  51.24 
 
 
439 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  38.83 
 
 
427 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.24 
 
 
417 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  40.89 
 
 
429 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  40.32 
 
 
649 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  35.67 
 
 
411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  39.15 
 
 
431 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  43.22 
 
 
418 aa  213  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  41.41 
 
 
428 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  42.91 
 
 
429 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  44.07 
 
 
420 aa  212  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>