More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0312 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0312  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  100 
 
 
387 aa  811    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.991338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2600  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  68.7 
 
 
362 aa  535  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2970  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  67.67 
 
 
364 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000014581 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3134  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  64.64 
 
 
368 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2577  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  62.33 
 
 
365 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176672  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2766  perosamine synthetase  64.27 
 
 
368 aa  485  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2126  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  57.46 
 
 
372 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0334323  normal  0.0133651 
 
 
-
 
NC_004310  BR0521  perosamine synthase, putative  51.9 
 
 
367 aa  414  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2624  perosamine synthase  50.27 
 
 
367 aa  401  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0289  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  48.34 
 
 
367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3402  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  46.44 
 
 
507 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3061  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  44.54 
 
 
393 aa  315  8e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0752  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  46.15 
 
 
368 aa  313  3.9999999999999997e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.582657 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3157  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  45.41 
 
 
371 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2570  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.19 
 
 
372 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4223  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  44.38 
 
 
374 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206706  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0080  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  42.51 
 
 
371 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0082  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.51 
 
 
371 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1964  perosamine synthetase  41.34 
 
 
591 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0666  aminotransferase  41.34 
 
 
586 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0571  aminotransferase  41.34 
 
 
586 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3660  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.18 
 
 
383 aa  292  6e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795674  normal  0.3486 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4737  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.18 
 
 
383 aa  292  6e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.301664 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1981  perosamine synthetase  41.06 
 
 
591 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1514  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.27 
 
 
373 aa  280  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0056  perosamine synthetase  40.22 
 
 
375 aa  276  6e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0267366  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3378  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.89 
 
 
368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.65764  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0593  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.22 
 
 
383 aa  268  1e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4084  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.63 
 
 
392 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2633  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.11 
 
 
390 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152572  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3059  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.9 
 
 
370 aa  267  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0525  aminotransferase  46.43 
 
 
255 aa  263  4e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0594  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  37.84 
 
 
372 aa  260  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0110  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.12 
 
 
406 aa  256  4e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1589  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.53 
 
 
370 aa  256  6e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2405  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.87 
 
 
402 aa  256  7e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.12432  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4213  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  38.11 
 
 
382 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4504  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  38.24 
 
 
382 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0669579  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2521  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.78 
 
 
369 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162044 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0950  putative perosamine synthetase  36.07 
 
 
365 aa  250  2e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.251305  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2644  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.96 
 
 
389 aa  250  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5132  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.81 
 
 
380 aa  247  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16970  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.69 
 
 
391 aa  246  4e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2836  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  36.51 
 
 
366 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281865  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0334  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.12 
 
 
377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.272347  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2345  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.89 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0874  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.66 
 
 
366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1039  glutamine--scyllo-inositol transaminase  38.79 
 
 
394 aa  243  5e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000569321 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0792  hypothetical protein  35.54 
 
 
500 aa  243  5e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0821  hypothetical protein  35.28 
 
 
500 aa  242  7e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1213  cell wall biosynthesis enzyme  38.4 
 
 
368 aa  241  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.578129  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5394  aminotransferase family protein  37.74 
 
 
371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2305  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  35.38 
 
 
383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2587  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.29 
 
 
383 aa  240  4e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0384123  hitchhiker  0.000234634 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3048  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.83 
 
 
382 aa  240  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1460  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.4 
 
 
363 aa  239  8e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.594691  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0563  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.7 
 
 
381 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1355  perosamine synthetase, putative  34.97 
 
 
364 aa  238  1e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2329  pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis  36.94 
 
 
385 aa  238  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3253  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.99 
 
 
384 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3629  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.95 
 
 
372 aa  236  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1141  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase enzyme  35.54 
 
 
379 aa  236  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1586  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.67 
 
 
382 aa  236  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.257863  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0448  processing protease  36.9 
 
 
363 aa  236  4e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1974  DegT/DnrJ/EryC1/StrS family protein  36.7 
 
 
384 aa  236  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.953061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3098  UDP-bacillosamine synthetase  35.46 
 
 
385 aa  236  7e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0037  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.04 
 
 
379 aa  235  8e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1135  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  37.81 
 
 
361 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0369  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.28 
 
 
389 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5668  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.08 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.01985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7630  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.33 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409815  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1461  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.46 
 
 
399 aa  234  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3387  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.07 
 
 
381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0121  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.46 
 
 
358 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0714  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.5 
 
 
375 aa  232  9e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.07 
 
 
724 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1137  aspartate aminotransferase  36.86 
 
 
360 aa  232  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1524  putative amino-sugar biosynthesis protein  36.83 
 
 
395 aa  231  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14101  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  35.95 
 
 
398 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3545  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  37.13 
 
 
377 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.975669  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0404  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.77 
 
 
404 aa  231  2e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.542778 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00668  UDP-bacillosamine synthetase  35.91 
 
 
383 aa  230  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2810  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  38.74 
 
 
380 aa  230  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1610  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.92 
 
 
357 aa  229  4e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1969  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.11 
 
 
384 aa  229  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.886816  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0252  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.1 
 
 
381 aa  229  7e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0171  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.1 
 
 
381 aa  229  7e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1938  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.54 
 
 
397 aa  229  9e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0629  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.29 
 
 
384 aa  229  9e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10738  putative aminotransferase  38.9 
 
 
365 aa  227  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.250686  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0393  aminotransferase  33.7 
 
 
380 aa  227  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01121  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  37.03 
 
 
395 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.273629 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2975  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35 
 
 
391 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0362  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.6 
 
 
392 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.350885  normal  0.854352 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3119  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35 
 
 
391 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001802  putative aminotransferase DegT family  34.9 
 
 
383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08620  predicted PLP-dependent enzyme possibly involved in cell wall biogenesis  36.84 
 
 
370 aa  226  6e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0047  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.54 
 
 
386 aa  225  9e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0361  aminotransferase-like  34.9 
 
 
383 aa  225  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2855  aminotransferase family, DegT/DnrJ/EryC1/StrS  35.25 
 
 
385 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  hitchhiker  0.00000526937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>