228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0290 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0290  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  320  4e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0318  protein of unknown function DUF520  96.89 
 
 
161 aa  315  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  73.91 
 
 
161 aa  243  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  73.91 
 
 
161 aa  243  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  73.91 
 
 
161 aa  243  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  73.91 
 
 
161 aa  243  6e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  73.91 
 
 
161 aa  243  6e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  73.91 
 
 
161 aa  243  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  73.91 
 
 
161 aa  243  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  73.29 
 
 
161 aa  243  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  72.67 
 
 
161 aa  241  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2549  putative nucleotide-binding protein  72.05 
 
 
161 aa  240  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  72.67 
 
 
161 aa  239  8e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  72.67 
 
 
161 aa  239  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  70.81 
 
 
161 aa  238  3e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  71.43 
 
 
161 aa  236  7e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  70.81 
 
 
161 aa  236  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  71.43 
 
 
161 aa  235  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3208  putative nucleotide-binding protein  72.05 
 
 
161 aa  231  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0754  putative nucleotide-binding protein  72.05 
 
 
161 aa  230  7e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0741  putative nucleotide-binding protein  72.67 
 
 
161 aa  226  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1944  putative nucleotide-binding protein  71.43 
 
 
161 aa  223  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.478874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2555  putative nucleotide-binding protein  71.43 
 
 
161 aa  223  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.354154  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2579  putative nucleotide-binding protein  71.43 
 
 
161 aa  223  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0527  putative nucleotide-binding protein  71.43 
 
 
161 aa  223  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.487699  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1242  hypothetical protein  62.35 
 
 
168 aa  211  3e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.1131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4781  putative nucleotide-binding protein  62.11 
 
 
161 aa  210  8e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0520927  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3769  putative nucleotide-binding protein  60.25 
 
 
161 aa  203  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3039  hypothetical protein  60.49 
 
 
162 aa  202  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1854  putative nucleotide-binding protein  59.01 
 
 
161 aa  200  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2240  putative nucleotide-binding protein  60.25 
 
 
161 aa  199  1e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.065474  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2750  putative nucleotide-binding protein  59.63 
 
 
161 aa  199  1e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821102  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2692  putative nucleotide-binding protein  58.39 
 
 
161 aa  199  1e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  60.25 
 
 
161 aa  197  4e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  57.14 
 
 
161 aa  191  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3464  putative nucleotide-binding protein  55.28 
 
 
161 aa  190  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32342  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2671  putative nucleotide-binding protein  50.93 
 
 
161 aa  177  5e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1596  putative nucleotide-binding protein  54.66 
 
 
161 aa  177  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1080  putative nucleotide-binding protein  53.99 
 
 
163 aa  174  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240554  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1115  putative nucleotide-binding protein  52.17 
 
 
160 aa  169  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  52.17 
 
 
160 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  51.55 
 
 
161 aa  168  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1706  putative nucleotide-binding protein  50.61 
 
 
164 aa  166  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.280602  hitchhiker  0.00217335 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3028  putative nucleotide-binding protein  51.22 
 
 
164 aa  166  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.208181  normal  0.91414 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  158  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
161 aa  157  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
161 aa  157  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003420  protein yajQ  48.45 
 
 
160 aa  156  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
160 aa  155  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
161 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3815  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
161 aa  154  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2557  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  151  3e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.317915 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3443  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
161 aa  150  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.33798e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
160 aa  150  9e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
160 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
160 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3646  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
161 aa  148  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.507653  normal  0.0694826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
161 aa  148  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3114  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
161 aa  147  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
160 aa  147  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  9.45037e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  147  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  9.35771e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  43.48 
 
 
161 aa  147  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  43.48 
 
 
161 aa  147  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3724  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
161 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3532  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
161 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  7.07458e-05 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  48.43 
 
 
163 aa  144  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0710  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
161 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3601  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
161 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1993  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
160 aa  144  7e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0973999  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1902  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 
161 aa  144  7e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0203  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
160 aa  144  7e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04099  nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
160 aa  142  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  43.67 
 
 
164 aa  142  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2893  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 
161 aa  141  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 
161 aa  141  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1169  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 
161 aa  140  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1175  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 
161 aa  140  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
161 aa  140  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.32382e-06  hitchhiker  2.62338e-18 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  45.4 
 
 
161 aa  140  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  46.25 
 
 
166 aa  139  1e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0770  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
161 aa  139  1e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.79998e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
161 aa  137  4e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 
161 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 
161 aa  137  8e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
159 aa  137  9e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3487  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 
160 aa  137  9e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660179  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1728  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
160 aa  137  9e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.499513  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0732  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 
161 aa  135  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
159 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 
161 aa  135  3e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 
161 aa  135  3e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  46.25 
 
 
161 aa  134  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57130  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
159 aa  134  7e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1098  putative nucleotide-binding protein  41.61 
 
 
160 aa  134  7e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
159 aa  133  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
161 aa  133  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.15495e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  42.59 
 
 
162 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
161 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  41.72 
 
 
163 aa  131  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0101  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 
162 aa  131  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>