More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0235 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.92 
 
 		 426 aa  643    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0257  gamma-glutamyl phosphate reductase  90.8 
 
 		 425 aa  769    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 429 aa  879    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.16 
 
 		 426 aa  644    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  71.97 
 
 		 426 aa  624  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.45 
 
 		 426 aa  616  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.92 
 
 		 426 aa  613  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.57 
 
 		 423 aa  590  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.1 
 
 		 423 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.33 
 
 		 423 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.09 
 
 		 458 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.09 
 
 		 458 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.09 
 
 		 458 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.09 
 
 		 458 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.09 
 
 		 458 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.54 
 
 		 435 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.1 
 
 		 423 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.33 
 
 		 423 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.81 
 
 		 423 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.08 
 
 		 435 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.33 
 
 		 423 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.81 
 
 		 423 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0579  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.33 
 
 		 423 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.62 
 
 		 423 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3377  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.1 
 
 		 423 aa  561  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4018  hitchhiker  0.00000000120564 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.95 
 
 		 421 aa  531  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.56 
 
 		 421 aa  521  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4584  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.52 
 
 		 436 aa  518  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.77 
 
 		 432 aa  512  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.24 
 
 		 418 aa  505  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.74 
 
 		 421 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.5 
 
 		 421 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3751  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.88 
 
 		 430 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3913  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.33 
 
 		 426 aa  503  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4545  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.95 
 
 		 426 aa  504  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.33 
 
 		 429 aa  499  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3262  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.1 
 
 		 426 aa  501  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960329  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0425  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.57 
 
 		 437 aa  498  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.29 
 
 		 418 aa  497  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  57.94 
 
 		 428 aa  497  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.14 
 
 		 427 aa  495  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.95 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.97 
 
 		 421 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.64 
 
 		 434 aa  491  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.77 
 
 		 444 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.67 
 
 		 419 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0963  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.54 
 
 		 437 aa  491  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0723541  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.67 
 
 		 430 aa  488  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.74 
 
 		 421 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.53 
 
 		 425 aa  489  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.34 
 
 		 421 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.95 
 
 		 426 aa  485  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0269  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.94 
 
 		 429 aa  483  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303722  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.29 
 
 		 435 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6000  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.62 
 
 		 426 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137203 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.39 
 
 		 420 aa  483  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4974  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.97 
 
 		 423 aa  472  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.126752  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.09 
 
 		 425 aa  473  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.26 
 
 		 423 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.5 
 
 		 423 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0293  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.48 
 
 		 433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00187024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0322  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.25 
 
 		 433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930114  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.08 
 
 		 423 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4007  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.37 
 
 		 439 aa  459  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000305093 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.01 
 
 		 419 aa  458  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.08 
 
 		 423 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2142  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.41 
 
 		 424 aa  450  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.26 
 
 		 418 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.26 
 
 		 418 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  52.27 
 
 		 423 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.19 
 
 		 418 aa  433  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.69 
 
 		 416 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.14 
 
 		 418 aa  413  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.33 
 
 		 418 aa  409  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.46 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.62 
 
 		 418 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1238  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  52.01 
 
 		 427 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.08 
 
 		 418 aa  401  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.38 
 
 		 418 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.3 
 
 		 415 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.06 
 
 		 415 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2671  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.84 
 
 		 417 aa  395  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1478  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.48 
 
 		 424 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.56 
 
 		 456 aa  392  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.15 
 
 		 425 aa  393  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4280  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.73 
 
 		 427 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.14 
 
 		 420 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.91 
 
 		 424 aa  388  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.01 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.72 
 
 		 419 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0528  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.84 
 
 		 429 aa  388  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2285  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.23 
 
 		 422 aa  391  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3011  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.66 
 
 		 427 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.14 
 
 		 418 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.15 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.56 
 
 		 418 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.43 
 
 		 418 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.91 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.17 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0413  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.02 
 
 		 431 aa  386  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399966  normal  0.231581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>