More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0197 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0197  glutamate 5-kinase  100 
 
 		 260 aa  520  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.670063  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0215  glutamate 5-kinase  89.19 
 
 		 260 aa  462  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.256743 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  71.31 
 
 		 372 aa  353  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  68.63 
 
 		 372 aa  348  4e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  67.83 
 
 		 379 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  67.98 
 
 		 372 aa  347  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  70.2 
 
 		 372 aa  344  7e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  70.98 
 
 		 372 aa  343  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  67.83 
 
 		 378 aa  342  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  70.59 
 
 		 372 aa  341  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  70.59 
 
 		 372 aa  341  5e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  67.83 
 
 		 372 aa  341  5.999999999999999e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  69.02 
 
 		 372 aa  341  7e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  70.98 
 
 		 372 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  70.98 
 
 		 372 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  70.98 
 
 		 372 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  70.98 
 
 		 372 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  70.98 
 
 		 372 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  68.22 
 
 		 378 aa  340  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  72.11 
 
 		 394 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  70.98 
 
 		 372 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  70.2 
 
 		 372 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  70.2 
 
 		 372 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  71.31 
 
 		 372 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  65.66 
 
 		 382 aa  338  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  66.67 
 
 		 378 aa  338  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  69.8 
 
 		 372 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  70.92 
 
 		 372 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  65.12 
 
 		 374 aa  334  7e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  69.32 
 
 		 372 aa  334  7e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  70.36 
 
 		 374 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  70.36 
 
 		 374 aa  332  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  70.52 
 
 		 372 aa  329  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  66.28 
 
 		 372 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0844  gamma-glutamyl kinase  67.18 
 
 		 380 aa  323  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.481777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0773  gamma-glutamyl kinase  67.18 
 
 		 380 aa  323  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3914  gamma-glutamyl kinase  65.65 
 
 		 380 aa  323  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.027535 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  69.57 
 
 		 374 aa  322  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  63.53 
 
 		 371 aa  322  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  66.67 
 
 		 372 aa  314  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3672  gamma-glutamyl kinase  64.12 
 
 		 379 aa  306  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.039065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  61.33 
 
 		 390 aa  305  4.0000000000000004e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  60.16 
 
 		 375 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  59.92 
 
 		 372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  59.92 
 
 		 372 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  59.06 
 
 		 368 aa  300  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  58.75 
 
 		 376 aa  298  6e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  56.64 
 
 		 374 aa  296  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  60.39 
 
 		 378 aa  294  8e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  58.59 
 
 		 375 aa  294  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  56.64 
 
 		 376 aa  292  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  56.64 
 
 		 376 aa  292  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  55.86 
 
 		 376 aa  291  5e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  59.84 
 
 		 372 aa  288  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  59.45 
 
 		 372 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  58.27 
 
 		 372 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  58.27 
 
 		 373 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  57.95 
 
 		 374 aa  281  6.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  54.26 
 
 		 373 aa  281  7.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  57.87 
 
 		 372 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  57.87 
 
 		 372 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  57.48 
 
 		 372 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  57.48 
 
 		 372 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  54.09 
 
 		 376 aa  274  9e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0848  gamma-glutamyl kinase  58.5 
 
 		 380 aa  269  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0858  gamma-glutamyl kinase  58.37 
 
 		 374 aa  261  6e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0105345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  52.55 
 
 		 373 aa  255  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  51.76 
 
 		 390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1600  gamma-glutamyl kinase  52.57 
 
 		 405 aa  252  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0157762  hitchhiker  0.000100305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  49.8 
 
 		 370 aa  238  5.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1682  gamma-glutamyl kinase  49.01 
 
 		 390 aa  232  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  51.37 
 
 		 373 aa  230  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1503  gamma-glutamyl kinase  48.62 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  48.05 
 
 		 373 aa  230  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  49.8 
 
 		 376 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  47.67 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2603  glutamate 5-kinase  46.33 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1460  glutamate 5-kinase  53.85 
 
 		 399 aa  226  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1783  glutamate 5-kinase  53.85 
 
 		 383 aa  226  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00674296  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  47.45 
 
 		 378 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  50.61 
 
 		 373 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  50.61 
 
 		 373 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  47.04 
 
 		 372 aa  221  6e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  44.22 
 
 		 373 aa  219  5e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  46.99 
 
 		 372 aa  218  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  46.64 
 
 		 372 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  46.64 
 
 		 372 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  46.64 
 
 		 372 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  46.64 
 
 		 372 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  47.84 
 
 		 373 aa  216  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  48.74 
 
 		 374 aa  216  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  46.99 
 
 		 379 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  47.04 
 
 		 372 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  45.06 
 
 		 366 aa  215  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2583  gamma-glutamyl kinase  42.37 
 
 		 269 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  48.06 
 
 		 374 aa  215  7e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2904  gamma-glutamyl kinase  42.37 
 
 		 269 aa  214  8e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  46.37 
 
 		 372 aa  214  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  44.36 
 
 		 392 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  45.85 
 
 		 369 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>