More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0195 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0195  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 86 aa  170  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000826463  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0213  50S ribosomal protein L27  98.84 
 
 		 86 aa  169  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.280528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3105  50S ribosomal protein L27  84.52 
 
 		 86 aa  143  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2957  50S ribosomal protein L27  82.14 
 
 		 86 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3916  50S ribosomal protein L27  77.38 
 
 		 91 aa  137  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00853508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0842  50S ribosomal protein L27  77.38 
 
 		 85 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.987021  normal  0.6635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0771  50S ribosomal protein L27  77.38 
 
 		 85 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  78.57 
 
 		 85 aa  132  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  76.19 
 
 		 85 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4217  50S ribosomal protein L27  77.38 
 
 		 85 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  76.19 
 
 		 87 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  75 
 
 		 87 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2821  50S ribosomal protein L27  76.19 
 
 		 86 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000571878  normal  0.308516 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2656  50S ribosomal protein L27  75 
 
 		 86 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0134308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0750  50S ribosomal protein L27  75.61 
 
 		 85 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00233026 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3489  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 87 aa  127  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.562103  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3259  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 87 aa  127  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0445  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 87 aa  127  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2522  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 87 aa  127  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587643  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3523  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 87 aa  127  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122565  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1141  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 87 aa  127  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1304  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 87 aa  127  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3525  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 87 aa  127  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.986116  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2801  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 87 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000884705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3066  50S ribosomal protein L27  75 
 
 		 86 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 87 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5485  50S ribosomal protein L27  75.61 
 
 		 85 aa  126  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.132015  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3667  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 87 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000345306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 87 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000367957  normal  0.045539 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0100  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 87 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00352754  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0485  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 87 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162621  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0582  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 87 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00040366  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  75 
 
 		 86 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 85 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  121  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  120  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3276  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  120  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212602 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1269  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 85 aa  120  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000774064  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0512  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  120  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 86 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 87 aa  117  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 86 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000945082  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  116  9e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00000322672  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  114  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  114  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  114  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  115  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4237  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000765087  hitchhiker  0.00000018706 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  114  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  114  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 86 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  70.73 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3681  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 87 aa  114  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  114  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 85 aa  114  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000537628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  114  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  114  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  114  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 92 aa  113  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3737  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 85 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000346028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 93 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03050  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00726587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0522  ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000023922  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4507  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000060246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5207  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3378  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.4045e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0515  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000794781  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03001  hypothetical protein  68.29 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0066535  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3481  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3670  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000967389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60450  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112062 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3585  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000250774  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>