60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0132 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0132  phasin family protein  100 
 
 		 194 aa  384  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000741228  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0874  hypothetical protein  44.85 
 
 		 191 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000363906  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1408  hypothetical protein  45.71 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1394  hypothetical protein  33.09 
 
 		 155 aa  95.1  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.887957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1530  hypothetical protein  27.53 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0590292  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3102  phasin family protein  32.12 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.499435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4742  phasin family protein  34.32 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0164964  normal  0.333304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3470  phasin family protein  31.58 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.103748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1497  phasin family protein  31.76 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2171  phasin family protein  30.87 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3309  phasin family protein  32.43 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.815805 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2225  phasin family protein  31.76 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3095  phasin family protein  31.76 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211608  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2609  phasin family protein  31.76 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2664  phasin family protein  31.76 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1716  phasin family protein  31.76 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2044  phasin family protein  30.87 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2742  phasin-like protein  31.76 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1867  phasin family protein  31.76 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102377  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5943  phasin  31.08 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000944857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2134  phasin family protein  31.08 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00690855  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2018  phasin family protein  28.49 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0441052  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2151  phasin family protein  31.08 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1544  phasin  31.76 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000489464  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5440  phasin  31.08 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1136  phasin family protein  31.08 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6019  phasin  26.88 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2588  phasin family protein  30.41 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272544  hitchhiker  0.000478575 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1612  phasin family protein  30.41 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000706224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1467  phasin family protein  30.41 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00148952  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2554  phasin family protein  31.08 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697191  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1766  phasin family protein  33.11 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1366  phasin family protein  33.11 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000804871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1200  phasin  29.73 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000122357  normal  0.77319 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2494  phasin family protein  33.11 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000038642  normal  0.0253479 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1942  phasin family protein  28.48 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000889348  hitchhiker  0.00205341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1605  hypothetical protein  28.48 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000106096  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1614  phasin family protein  27.88 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0000449838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2140  phasin  28.38 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3019  phasin  24.84 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00196796  normal  0.647468 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1992  phasin family protein  29.73 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000361107 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3864  phasin  25 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3423  phasin  27.92 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal  0.962237 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3088  phasin  29.73 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000310339  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0737  phasin family protein  28.66 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.986561  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4308  phasin family protein  25.74 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3122  phasin  30.15 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1506  hypothetical protein  29.05 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000313141  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2304  phasin  27.57 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4349  phasin  26.06 
 
 		 173 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6167  phasin family protein  23.84 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2358  phasin family protein  27.03 
 
 		 188 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4922  phasin  24.66 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0875  phasin family protein  26.67 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000437683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3422  phasin  27.5 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.14313e-25  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4225  phasin family protein  24.29 
 
 		 164 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2522  phasin family protein  24.2 
 
 		 168 aa  45.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.632882  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1354  hypothetical protein  25.32 
 
 		 175 aa  45.1  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2336  phasin  23.18 
 
 		 174 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0596  hypothetical protein  23.87 
 
 		 171 aa  41.6  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>