More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0123 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
390 aa  780    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  79.85 
 
 
392 aa  635    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  61.77 
 
 
404 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  61.52 
 
 
404 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  61.89 
 
 
398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  60.25 
 
 
403 aa  462  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  60.88 
 
 
398 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  58.52 
 
 
401 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  58.88 
 
 
407 aa  448  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  58.52 
 
 
401 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  58.99 
 
 
403 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  58.27 
 
 
401 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  57.61 
 
 
402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  58.48 
 
 
407 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  58.27 
 
 
401 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  58.27 
 
 
401 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  58.27 
 
 
402 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  58.02 
 
 
401 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  58.02 
 
 
402 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  58.02 
 
 
402 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  58.02 
 
 
402 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  58.02 
 
 
402 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  58.05 
 
 
387 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  58.05 
 
 
388 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  57.52 
 
 
388 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  53.45 
 
 
383 aa  413  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  55.47 
 
 
379 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  53.71 
 
 
383 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  54.22 
 
 
396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  55.35 
 
 
380 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  55.39 
 
 
398 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.26 
 
 
396 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  55.21 
 
 
379 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  55.24 
 
 
388 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  51.55 
 
 
386 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.36 
 
 
384 aa  388  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.59 
 
 
385 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  54.59 
 
 
383 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  54.69 
 
 
386 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  52.1 
 
 
380 aa  354  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  49.87 
 
 
386 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.61 
 
 
385 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  49.48 
 
 
386 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  49.48 
 
 
402 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  51.26 
 
 
389 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  49.48 
 
 
386 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  51.25 
 
 
389 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  50.71 
 
 
385 aa  341  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.57 
 
 
417 aa  341  2e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  48.03 
 
 
385 aa  338  9e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.52 
 
 
412 aa  335  5.999999999999999e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  50 
 
 
383 aa  330  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  48.96 
 
 
386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  48.2 
 
 
386 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.7 
 
 
408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  49.39 
 
 
372 aa  305  7e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.91 
 
 
391 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  43.41 
 
 
443 aa  300  2e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.7 
 
 
387 aa  295  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  45.5 
 
 
513 aa  293  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  47.63 
 
 
471 aa  292  8e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  54.04 
 
 
511 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.65 
 
 
442 aa  286  4e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  46.34 
 
 
442 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  47.48 
 
 
465 aa  280  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  47.11 
 
 
472 aa  280  3e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  46.06 
 
 
350 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  46.75 
 
 
467 aa  278  1e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  45.29 
 
 
393 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  48.62 
 
 
458 aa  277  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  46.67 
 
 
474 aa  277  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  46.67 
 
 
474 aa  277  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  45.43 
 
 
468 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  46.45 
 
 
476 aa  273  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  44.94 
 
 
494 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  44.35 
 
 
488 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  44.35 
 
 
488 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  44.71 
 
 
471 aa  268  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  45.35 
 
 
471 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  45.71 
 
 
496 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  45.06 
 
 
464 aa  265  1e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  43.38 
 
 
513 aa  265  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  43.94 
 
 
461 aa  265  1e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  43.38 
 
 
513 aa  265  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  43.44 
 
 
502 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  43.24 
 
 
485 aa  264  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  47.65 
 
 
471 aa  264  2e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  47.63 
 
 
460 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  44.07 
 
 
472 aa  263  4e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  45.28 
 
 
467 aa  262  6e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  44.28 
 
 
476 aa  263  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  44.98 
 
 
457 aa  262  8e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  44.95 
 
 
468 aa  262  8e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  42.64 
 
 
504 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  43.26 
 
 
535 aa  260  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  46.13 
 
 
463 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  50.36 
 
 
469 aa  259  4e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  45.85 
 
 
464 aa  259  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  42.99 
 
 
501 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  44.55 
 
 
449 aa  259  8e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>