More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0109 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  100 
 
 
195 aa  393  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.228917  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0108  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  95.38 
 
 
195 aa  381  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.926859 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  85.13 
 
 
195 aa  347  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  84.1 
 
 
195 aa  345  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2950  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  84.02 
 
 
196 aa  343  7e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3227  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  84.02 
 
 
196 aa  343  8e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2880  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  83.51 
 
 
196 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0502764 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2757  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  83.08 
 
 
195 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2991  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  82.56 
 
 
195 aa  337  7e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.922972  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0354  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  82.56 
 
 
195 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.332869 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3525  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  82.05 
 
 
195 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0345  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  82.56 
 
 
195 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3691  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  82.05 
 
 
195 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2712  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  82.05 
 
 
195 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3664  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  82.05 
 
 
195 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1790  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  82.05 
 
 
195 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3722  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  82.05 
 
 
195 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2763  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  82.05 
 
 
195 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3241  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  82.05 
 
 
195 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2680  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  81.54 
 
 
195 aa  334  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63199  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0330  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  81.54 
 
 
195 aa  334  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.843047  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0406  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  81.54 
 
 
195 aa  334  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.186972 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0427  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  81.54 
 
 
195 aa  334  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0400  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  81.54 
 
 
195 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3558  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  81.03 
 
 
195 aa  333  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.451024  hitchhiker  0.0000499164 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0817  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  76.41 
 
 
195 aa  317  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4256  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  78.35 
 
 
197 aa  314  7e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104462 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1711  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.9 
 
 
195 aa  313  9e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04590  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  77.32 
 
 
197 aa  313  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5879  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.77 
 
 
197 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.971219  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67930  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.77 
 
 
197 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0820983  normal  0.0255307 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3382  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.38 
 
 
195 aa  309  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915315  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0251  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  74.87 
 
 
198 aa  308  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000155006  normal  0.0277595 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.38 
 
 
195 aa  308  5e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0289  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.77 
 
 
210 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0309  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.77 
 
 
210 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7048  decreased coverage  0.00641142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4919  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.77 
 
 
197 aa  304  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608103  hitchhiker  0.001484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0314  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.26 
 
 
197 aa  303  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1168  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  74.23 
 
 
202 aa  303  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0323  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.26 
 
 
197 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.352379  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3173  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  72.68 
 
 
197 aa  300  7.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  72.68 
 
 
206 aa  300  9e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5338  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  74.74 
 
 
197 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4897  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  74.74 
 
 
197 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0111  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  71.65 
 
 
198 aa  298  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0398099  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0698  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  73.71 
 
 
206 aa  298  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1966  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  72.31 
 
 
195 aa  296  9e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.768951  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0213  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  72.68 
 
 
197 aa  296  9e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5520  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  72.16 
 
 
201 aa  296  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.329612  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0753  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  74.23 
 
 
197 aa  295  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1589  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  73.71 
 
 
203 aa  295  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273051 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2617  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  71.13 
 
 
197 aa  295  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0487  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  70.1 
 
 
197 aa  292  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0833  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  72.68 
 
 
199 aa  291  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0326052  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0519  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  71.65 
 
 
197 aa  290  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.881117  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0125  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  70.62 
 
 
197 aa  289  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3043  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  71.13 
 
 
199 aa  286  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2652  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  71.13 
 
 
199 aa  286  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0730  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  73.71 
 
 
210 aa  282  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.201413  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0763  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  73.71 
 
 
210 aa  282  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0148166 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2805  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  69.59 
 
 
197 aa  281  4.0000000000000003e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0060  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  65.46 
 
 
208 aa  280  1e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.403359  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1032  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  72.68 
 
 
209 aa  280  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.637673 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4375  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  69.07 
 
 
210 aa  270  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.661676  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2948  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  70.1 
 
 
204 aa  265  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44039  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2121  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  64.4 
 
 
221 aa  265  4e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.902859  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2443  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  63.4 
 
 
224 aa  265  4e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.447729  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1094  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  63.92 
 
 
197 aa  264  8e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3051  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  63.02 
 
 
197 aa  257  9e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.177409  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2938  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.31 
 
 
198 aa  249  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2554  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.44 
 
 
197 aa  246  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03041  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.36 
 
 
201 aa  241  7e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03051  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.87 
 
 
201 aa  240  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.299371  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0283  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.36 
 
 
201 aa  239  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603914  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2717  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.87 
 
 
195 aa  238  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0429  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.76 
 
 
207 aa  238  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.554154 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3040  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.76 
 
 
195 aa  236  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000415747  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03141  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
201 aa  234  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0125  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
209 aa  234  8e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0467  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.38 
 
 
195 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3285  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.76 
 
 
209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3981  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4308  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
202 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1063  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
198 aa  231  5e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.179926  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2771  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.38 
 
 
195 aa  231  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259514  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
195 aa  231  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2478  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.9 
 
 
195 aa  231  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0104295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2548  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.87 
 
 
195 aa  231  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3493  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
202 aa  231  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0220  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
202 aa  231  7.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.87 
 
 
195 aa  230  9e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.725915  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0148  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.41 
 
 
197 aa  229  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1619  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.76 
 
 
198 aa  230  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0247  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.33 
 
 
201 aa  230  1e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3597  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
199 aa  229  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15260  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.49 
 
 
194 aa  230  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.802497  normal  0.249652 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
195 aa  229  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.9 
 
 
195 aa  229  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.805329 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
236 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25121  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
209 aa  228  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>