191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0080 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0080  CutA1 divalent ion tolerance protein  100 
 
 		 116 aa  238  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0078  CutA1 divalent ion tolerance protein  65.14 
 
 		 116 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000144851 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1040  periplasmic divalent cation tolerance protein, putative  44 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0584  CutA1 divalent ion tolerance protein  41 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.759939  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3246  CutA1 divalent ion tolerance protein  43 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1741  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.59 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4157  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.84 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.496256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3575  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.27 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0417  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.18 
 
 		 107 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000143312  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3405  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.24 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.467432  normal  0.0160634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0547  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.24 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.108424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0539  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  40.19 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00953533  decreased coverage  0.00314697 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0660  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.24 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.970126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3725  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.24 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.414398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0637  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.24 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.887126  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0697  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  41.24 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3152  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.74 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3265  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.18 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.189693  hitchhiker  0.00423146 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2684  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.18 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0664  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.21 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1056  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.81 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0246  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.82 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.299344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3665  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.36 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0560029  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4630  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.62 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292633  normal  0.456703 
 
 
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NC_010622  Bphy_2811  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.84 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0694531  normal  0.434183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4624  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.67 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0633  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.08 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_4014  CutA1 divalent ion tolerance protein  38 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000995556 
 
 
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NC_008701  Pisl_1044  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.22 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.402781  hitchhiker  0.00376288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4166  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.38 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2482  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.95 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.634613  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0040  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.8 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.214285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0342  periplasmic cytochrome biogenesis protein  39.22 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0235103 
 
 
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NC_013946  Mrub_0428  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.89 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.832839 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2339  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.65 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119887  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2603  periplasmic divalent cation tolerance protein  37 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_3748  periplasmic divalent cation tolerance protein  37 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0029  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.68 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_1193  CutA1 divalent ion tolerance protein  37 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0316727  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A3141  periplasmic divalent cation tolerance protein  37 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A1952  periplasmic divalent cation tolerance protein  37 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3718  divalent cation tolerance family protein  37 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3776  divalent cation tolerance family protein  37 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.930326  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_3506  periplasmic divalent cation tolerance protein  37 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1262  CutA1 divalent ion tolerance protein  37 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112671  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_0605  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.75 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  decreased coverage  0.0027095 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3475  CutA1 divalent ion tolerance protein  39 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3629  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.78 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0304  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0432895 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1180  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.54 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
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NC_009952  Dshi_2619  putative divalent-cation tolerance protein  41.76 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0176718 
 
 
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NC_007651  BTH_I3040  periplasmic divalent cation tolerance protein  37 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.994008  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_3616  CutA1 divalent ion tolerance protein  38 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00421644  hitchhiker  0.000000032142 
 
 
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NC_009921  Franean1_5137  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.4 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504404  normal  0.028749 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3194  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.64 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2175  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.17 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1473  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.27 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.168159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3914  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.88 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_1359  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.16 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458665  normal  0.151703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5355  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.29 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0656579 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2560  divalent cation tolerance protein  40.4 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1739  hypothetical protein  36.17 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2188  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.64 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2991  periplasmic divalent cation tolerance protein  36.19 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1082  threonine synthase  33.68 
 
 		 580 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000183977  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3289  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.26 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1539  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.27 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.234612 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03011  periplasmic divalent cation tolerance protein  36.79 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0021  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.89 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.722189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0483  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.64 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3409  divalent-cation tolerance protein CutA  34.51 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3269  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.24 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.011597 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0373  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.37 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1669  putative divalent cation tolerance protein  38.32 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1598  CutA1 divalent ion tolerance protein  34 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0519  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.66 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0812329  normal  0.323933 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0954  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  35.05 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2717  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.34 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.583537  normal  0.620046 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1378  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.37 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.897354  normal  0.0284083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0548  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.65 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3534  divalent-cation tolerance protein CutA  31 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1750  CutA1 divalent ion tolerance protein  31 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0777  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.04 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1667  CutA1 divalent ion tolerance protein  36 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.024619 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1230  CutA1 divalent ion tolerance protein  34 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1133  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.24 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0286  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.19 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.560656  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_0504  divalent-cation tolerance protein CutA  33.65 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2158  CutA1 divalent ion tolerance protein  38 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.890158  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_31390  uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations  35.29 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473848 
 
 
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NC_008751  Dvul_2000  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.98 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.314038  normal  0.502944 
 
 
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NC_013510  Tcur_3135  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.32 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00931834  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_0723  divalent-cation tolerance protein CutA  33.01 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0376  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_3007  hypothetical protein  34.62 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_0277  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0727054 
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_2261  periplasmic divalent cation tolerance protein  35 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.155745  normal  0.159586 
 
 
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NC_008554  Sfum_3298  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.35 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.577988 
 
 
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NC_009972  Haur_4155  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.01 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000487398  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_0037  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.33 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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