More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0034 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0034  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  100 
 
 
298 aa  613  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.262508  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0030  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  76.27 
 
 
297 aa  457  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0001068  hitchhiker  0.00000138683 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0122  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.62 
 
 
291 aa  232  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3464  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  45.64 
 
 
300 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3390  methyltransferase  50.61 
 
 
293 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0405  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  52.32 
 
 
304 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0413  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  52.32 
 
 
312 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0270  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.64 
 
 
295 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0815274 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3149  hypothetical protein  49.41 
 
 
295 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1640  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  43.4 
 
 
354 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0924245 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0215  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  49.6 
 
 
296 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0405558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0404  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  47.62 
 
 
293 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0201  hypothetical protein  49.19 
 
 
296 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0629  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  43.85 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0390  hypothetical protein  42.61 
 
 
279 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0532843 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0025  tetrapyrrole methylase family protein  50.41 
 
 
295 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.306155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2802  tetrapyrrole methylase family protein  50.41 
 
 
295 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.460995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3175  tetrapyrrole methylase family protein  50.41 
 
 
295 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1741  tetrapyrrole methylase family protein  50.41 
 
 
295 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0042  hypothetical protein  50.41 
 
 
295 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3901  tetrapyrrole methylase family protein  50.41 
 
 
295 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3820  tetrapyrrole methylase family protein  50.41 
 
 
295 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119622  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2817  hypothetical protein  50.87 
 
 
276 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0289  hypothetical protein  50.87 
 
 
276 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0196  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.84 
 
 
292 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000023341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3136  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  44.6 
 
 
300 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3872  hypothetical protein  49.57 
 
 
299 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3266  hypothetical protein  44.91 
 
 
300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0631  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.32 
 
 
309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.830849  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4314  hypothetical protein  48.02 
 
 
292 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3431  hypothetical protein  43.6 
 
 
299 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.36467  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1061  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.56 
 
 
313 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4819  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.29 
 
 
318 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0228  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.26 
 
 
280 aa  210  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.330626 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3266  hypothetical protein  47.84 
 
 
299 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3767  hypothetical protein  43.06 
 
 
304 aa  205  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84999  normal  0.0491283 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1693  hypothetical protein  41.2 
 
 
291 aa  204  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2281  hypothetical protein  42.7 
 
 
281 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.610951 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3683  hypothetical protein  42.86 
 
 
281 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0262  hypothetical protein  42.86 
 
 
281 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0270  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  48.29 
 
 
286 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004500  tetrapyrrole (Corrin-Porphyrin) methylase family protein  41.37 
 
 
287 aa  202  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.104686  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00892  corrin/porphyrin methyltransferase  44.17 
 
 
287 aa  202  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0301  methyltransferase  42.5 
 
 
281 aa  202  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0114  hypothetical protein  42.51 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3879  hypothetical protein  42.5 
 
 
281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.071503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0390  hypothetical protein  43.93 
 
 
280 aa  198  9e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.83739  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0253  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  44.13 
 
 
280 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.239733  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3988  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  43.21 
 
 
280 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4186  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  43.21 
 
 
280 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4068  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  43.21 
 
 
280 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0353  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  43.21 
 
 
280 aa  195  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4250  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (corrin/porphyrin) methyltransferase  42.86 
 
 
280 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150216  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3691  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  42.5 
 
 
280 aa  194  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0263  tetrapyrrole (corrin/porphyrin) methylase family protein  44.24 
 
 
285 aa  195  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1930  hypothetical protein  44.24 
 
 
285 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.910019  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0352  tetrapyrrole methylase family protein  42.14 
 
 
306 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3353  hypothetical protein  42.14 
 
 
281 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4098  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  43.21 
 
 
280 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0741  methyltransferase  40.36 
 
 
281 aa  193  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2653  putative tetrapyrrole methyltransferase  41.22 
 
 
287 aa  192  6e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4593  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  42.29 
 
 
305 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0315173 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0357  hypothetical protein  40.14 
 
 
281 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2199  hypothetical protein  42.96 
 
 
286 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0186  hypothetical protein  37.23 
 
 
291 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3692  hypothetical protein  40.86 
 
 
281 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0274  hypothetical protein  42.86 
 
 
280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000430645  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0912  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  42.24 
 
 
299 aa  189  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538896  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0309  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  39.65 
 
 
295 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4330  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  41.73 
 
 
305 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4431  hypothetical protein  37.15 
 
 
282 aa  186  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.462421  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0677  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  42.65 
 
 
326 aa  186  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0060  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  37.72 
 
 
273 aa  186  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000025326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3753  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  38.87 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0021  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  37.41 
 
 
289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3544  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  40.43 
 
 
320 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0023  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  37.41 
 
 
289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0108  hypothetical protein  42.65 
 
 
397 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0368422 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0758  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  45.06 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3626  tetrapyrrole methylase family protein  39.36 
 
 
286 aa  181  9.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20320  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  37.76 
 
 
286 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0028573  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4683  hypothetical protein  40.65 
 
 
293 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1178  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  39.49 
 
 
286 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.041672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0476  putative tetrapyrrole methylase  41.81 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0540  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  41.81 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1119  putative tetrapyrrole methylase  41.81 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4112  hypothetical protein  40.56 
 
 
304 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796343  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0315  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  41.53 
 
 
295 aa  179  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.656029  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3919  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  42.86 
 
 
297 aa  179  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0903297  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1043  tetrapyrrole methylase family protein  43.16 
 
 
301 aa  178  9e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.210407  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3618  hypothetical protein  39.16 
 
 
287 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3450  hypothetical protein  39.16 
 
 
287 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3558  hypothetical protein  39.16 
 
 
287 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0591  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  42.05 
 
 
272 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4731  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3781  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  41.53 
 
 
295 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1916  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  36.52 
 
 
291 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3521  hypothetical protein  41.56 
 
 
287 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57470  hypothetical protein  43.48 
 
 
282 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1143  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  38.03 
 
 
278 aa  176  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.645043  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4418  tetrapyrrole methylase family protein  40 
 
 
289 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00450007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>