More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1433 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  46.97 
 
 		 735 aa  636    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  44.44 
 
 		 726 aa  635    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  63.19 
 
 		 787 aa  1001    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  46.61 
 
 		 728 aa  655    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  46.47 
 
 		 727 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  46.16 
 
 		 720 aa  640    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  47.12 
 
 		 726 aa  668    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  62.87 
 
 		 829 aa  997    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  45.03 
 
 		 721 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  45.1 
 
 		 724 aa  647    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  63.07 
 
 		 787 aa  1000    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  45.2 
 
 		 728 aa  659    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  45.09 
 
 		 722 aa  649    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  45.91 
 
 		 727 aa  655    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  46.74 
 
 		 728 aa  656    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1433  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 788 aa  1631    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.189419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  45.08 
 
 		 721 aa  643    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  63.07 
 
 		 787 aa  1000    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  45.57 
 
 		 721 aa  639    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  45.7 
 
 		 721 aa  640    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  46.48 
 
 		 727 aa  652    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  57.31 
 
 		 713 aa  868    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  62.84 
 
 		 786 aa  1012    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  63.67 
 
 		 786 aa  1009    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  56.67 
 
 		 726 aa  819    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  44.91 
 
 		 720 aa  638    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  63.19 
 
 		 787 aa  1001    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2677  UvrD/REP helicase  60.84 
 
 		 826 aa  944    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  46.37 
 
 		 727 aa  656    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  46.51 
 
 		 730 aa  647    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  63.86 
 
 		 783 aa  1031    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  62.88 
 
 		 787 aa  1007    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1474  UvrD/REP helicase  60.81 
 
 		 781 aa  942    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.517963 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1715  UvrD/REP helicase  94.29 
 
 		 787 aa  1542    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  46.45 
 
 		 741 aa  662    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  45.93 
 
 		 728 aa  637    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  56.67 
 
 		 743 aa  887    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  44.28 
 
 		 722 aa  638    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  63.56 
 
 		 787 aa  1006    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1536  UvrD/REP helicase  60.89 
 
 		 809 aa  961    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  46.29 
 
 		 729 aa  653    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  63.22 
 
 		 790 aa  1025    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3035  UvrD/REP helicase  60.1 
 
 		 814 aa  942    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2767  UvrD/REP helicase  60.44 
 
 		 848 aa  939    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053662 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  57.96 
 
 		 731 aa  853    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1723  ATP-dependent DNA helicase UvrD  60.82 
 
 		 825 aa  972    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  63.86 
 
 		 783 aa  1030    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  44.18 
 
 		 722 aa  635    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  45.29 
 
 		 728 aa  643    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  46.86 
 
 		 739 aa  648    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  63.53 
 
 		 786 aa  1013    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  63.49 
 
 		 787 aa  1026    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  44.07 
 
 		 723 aa  646    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1916  ATP-dependent DNA helicase UvrD  60.15 
 
 		 818 aa  943    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28639  hitchhiker  0.00561083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  44.28 
 
 		 722 aa  638    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  62.7 
 
 		 846 aa  1008    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  63.07 
 
 		 787 aa  1000    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5331  UvrD/REP helicase  58.7 
 
 		 822 aa  919    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  46.87 
 
 		 728 aa  655    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  62.76 
 
 		 787 aa  1008    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  47.79 
 
 		 721 aa  647    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3324  ATP-dependent DNA helicase UvrD  60.84 
 
 		 816 aa  939    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235629 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  44.96 
 
 		 722 aa  648    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  44.71 
 
 		 722 aa  645    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  46.29 
 
 		 725 aa  657    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  45.66 
 
 		 720 aa  642    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  44.28 
 
 		 722 aa  638    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  63.31 
 
 		 840 aa  1013    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  45.08 
 
 		 728 aa  659    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  63.07 
 
 		 787 aa  1000    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  45.79 
 
 		 726 aa  646    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  44.35 
 
 		 722 aa  638    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  46.29 
 
 		 723 aa  642    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  59.34 
 
 		 744 aa  880    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  45.08 
 
 		 721 aa  639    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  62.86 
 
 		 787 aa  1007    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  44.65 
 
 		 722 aa  645    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  44.84 
 
 		 722 aa  648    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  63.31 
 
 		 787 aa  1013    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1696  UvrD/REP helicase  60.5 
 
 		 793 aa  930    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99054 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  63.19 
 
 		 787 aa  1003    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  43.69 
 
 		 724 aa  637    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  63.65 
 
 		 786 aa  1011    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  60.77 
 
 		 788 aa  947    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  45.23 
 
 		 726 aa  647    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0236  DNA-dependent helicase II  45.23 
 
 		 720 aa  634  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  44.78 
 
 		 720 aa  634  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  44.21 
 
 		 724 aa  635  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  43.4 
 
 		 734 aa  634  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0008  UvrD/REP helicase  44.91 
 
 		 723 aa  633  1e-180  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.680024  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  44.15 
 
 		 720 aa  630  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  43.87 
 
 		 723 aa  631  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  44.15 
 
 		 720 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  44.15 
 
 		 720 aa  629  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  44.15 
 
 		 737 aa  631  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  44.15 
 
 		 720 aa  629  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  44.15 
 
 		 720 aa  630  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  44.15 
 
 		 720 aa  629  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  44.15 
 
 		 720 aa  630  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  46.55 
 
 		 725 aa  631  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>