More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1426 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1426  Rhodanese domain protein  100 
 
 
276 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.630889  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1708  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  81.52 
 
 
276 aa  478  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  51.24 
 
 
295 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  49.82 
 
 
295 aa  275  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  49.82 
 
 
289 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  49.82 
 
 
289 aa  271  6e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  49.82 
 
 
289 aa  271  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.82 
 
 
289 aa  271  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  49.82 
 
 
289 aa  271  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  50.18 
 
 
285 aa  271  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.82 
 
 
289 aa  271  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  49.82 
 
 
289 aa  271  6e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  49.82 
 
 
289 aa  271  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  51.15 
 
 
287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.39 
 
 
289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
289 aa  265  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.75 
 
 
292 aa  262  6e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  48.56 
 
 
284 aa  261  6.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.46 
 
 
299 aa  258  9e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  48.74 
 
 
289 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  47.04 
 
 
296 aa  256  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  47.81 
 
 
279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  46.4 
 
 
290 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.75 
 
 
289 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  48.2 
 
 
289 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.2 
 
 
289 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.2 
 
 
289 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  46.59 
 
 
312 aa  248  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.28 
 
 
289 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  47.67 
 
 
289 aa  247  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0951  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.86 
 
 
299 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1033  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.86 
 
 
310 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0667917 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3278  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.69 
 
 
330 aa  238  6.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2880  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.46 
 
 
289 aa  229  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518579  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  45.52 
 
 
285 aa  229  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1496  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.18 
 
 
300 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44 
 
 
282 aa  227  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.27 
 
 
300 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2237  rhodanese domain-containing protein  40.55 
 
 
304 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.814145  normal  0.0284823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2010  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.84 
 
 
299 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0121868  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1566  Rhodanese domain protein  39.25 
 
 
302 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  43.01 
 
 
283 aa  209  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  38.83 
 
 
300 aa  207  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.43 
 
 
285 aa  206  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.93 
 
 
280 aa  206  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3485  rhodanese domain-containing protein  40.93 
 
 
278 aa  204  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  39.35 
 
 
291 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  40.73 
 
 
288 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  42.46 
 
 
278 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
335 aa  203  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.13 
 
 
284 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  41.73 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.13 
 
 
284 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  39.35 
 
 
285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.97 
 
 
290 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  39.7 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  40.32 
 
 
281 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  39.21 
 
 
278 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0556  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.43 
 
 
276 aa  192  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  40.71 
 
 
284 aa  192  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  39.64 
 
 
284 aa  192  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  40.22 
 
 
276 aa  191  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  39.78 
 
 
284 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  40.5 
 
 
284 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.31 
 
 
285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  40.23 
 
 
276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  39.78 
 
 
284 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  39.13 
 
 
277 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  39.13 
 
 
277 aa  189  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  39.13 
 
 
277 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  39.13 
 
 
277 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  38.91 
 
 
277 aa  188  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  38.41 
 
 
277 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  38.55 
 
 
277 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.79 
 
 
284 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  38.41 
 
 
291 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  38.08 
 
 
627 aa  185  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0764  Rhodanese domain protein  39.22 
 
 
281 aa  185  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  38.71 
 
 
284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  39.22 
 
 
272 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  38.41 
 
 
277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  37.99 
 
 
280 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  39.21 
 
 
270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2346  rhodanese domain-containing protein  39.53 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  37.99 
 
 
277 aa  178  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.5 
 
 
284 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3515  thiosulfate sulfurtransferase  41.63 
 
 
278 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.432298  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5179  Rhodanese domain protein  38.6 
 
 
283 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3673  Rhodanese domain protein  40.29 
 
 
279 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  37.63 
 
 
277 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  37.81 
 
 
282 aa  176  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  37.68 
 
 
276 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  38.21 
 
 
285 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2623  rhodanese domain-containing protein  38.04 
 
 
283 aa  175  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3608  Rhodanese domain protein  39.93 
 
 
279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0580281  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0159  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.93 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2395  Rhodanese domain protein  36.07 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1846  Rhodanese domain protein  35.4 
 
 
274 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1872  Rhodanese domain protein  35.4 
 
 
274 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3051  Rhodanese domain protein  38.64 
 
 
272 aa  169  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0410601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>