More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1248 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0607  glycosyl transferase family protein  79.63 
 
 
386 aa  658    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1248  glycosyl transferase family 9  100 
 
 
385 aa  799    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9727 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  36.76 
 
 
392 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  35.17 
 
 
458 aa  222  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  34.97 
 
 
394 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  34.84 
 
 
390 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  34.84 
 
 
390 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  34.84 
 
 
390 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  34.84 
 
 
390 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  34.84 
 
 
390 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  34.84 
 
 
390 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
404 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 
392 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 
392 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 
392 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 
475 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 
402 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2341  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
390 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0778  glycosyl transferase family 9  26.58 
 
 
369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  28.83 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1231  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.86 
 
 
356 aa  125  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.11 
 
 
361 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.16 
 
 
352 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1800  LPS heptosyltransferase-like  25.6 
 
 
362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597786 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  28.93 
 
 
356 aa  116  6e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.95 
 
 
361 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.23 
 
 
367 aa  113  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  28.02 
 
 
356 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0391  glycosyl transferase family 9  23.36 
 
 
359 aa  107  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0900723  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.75 
 
 
356 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.25 
 
 
352 aa  103  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  28.3 
 
 
361 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.51 
 
 
352 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.51 
 
 
352 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.51 
 
 
352 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  24.49 
 
 
356 aa  100  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.25 
 
 
352 aa  100  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.29 
 
 
350 aa  100  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.11 
 
 
356 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.65 
 
 
356 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.65 
 
 
356 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.11 
 
 
356 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.65 
 
 
356 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.51 
 
 
340 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.51 
 
 
340 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  27.51 
 
 
340 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.71 
 
 
360 aa  90.9  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  23.84 
 
 
409 aa  90.1  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  24.16 
 
 
330 aa  89.7  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3516  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.56 
 
 
387 aa  89.4  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3647  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.56 
 
 
397 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.22 
 
 
367 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.48 
 
 
387 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 
357 aa  87.4  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  26.73 
 
 
360 aa  87  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.48 
 
 
339 aa  86.7  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
379 aa  86.3  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.17 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  24.13 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  22.55 
 
 
330 aa  82  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  24.13 
 
 
373 aa  82  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00662  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase III  23.96 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  22.63 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3715  hypothetical protein  32.14 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  21.29 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3947  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  31.21 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25 
 
 
355 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887327  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  24.61 
 
 
349 aa  75.5  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  23.4 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  22.88 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  35.9 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  28.14 
 
 
382 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1910  heptosyltransferase family protein  34.81 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1360  heptosyltransferase family protein  34.81 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.88 
 
 
352 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.41 
 
 
349 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1047  heptosyltransferase family protein  34.81 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0330  heptosyltransferase family protein  34.81 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.638826  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4090  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  23.99 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1209  heptosyltransferase  34.81 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0821  heptosyltransferase family protein  34.81 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1756  glycosyl transferase family 9  24.84 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0677074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1200  heptosyltransferase  34.81 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.88 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  22.39 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.88 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.34 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66240  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.49 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  22.13 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1100  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  23.4 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000330109  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.6 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0393  glycosyl transferase family protein  23.14 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.326109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  23.71 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  28.76 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  25.3 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0579  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.84 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0417722 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.57 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4359  glycosyl transferase family protein  22.19 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114677  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>