More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1241 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1241  iojap-like protein  100 
 
 		 130 aa  260  4.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0614  iojap-like protein  92.25 
 
 		 129 aa  246  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0781  Iojap-related protein  69.23 
 
 		 256 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11902  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2526  Iojap-related protein  69.23 
 
 		 241 aa  197  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2215  iojap-like protein  64.89 
 
 		 146 aa  187  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2336  iojap-like protein  64.89 
 
 		 146 aa  187  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0980  iojap-like protein  67.8 
 
 		 149 aa  180  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5625  Iojap-related protein  66.95 
 
 		 148 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2194  hypothetical protein  65.08 
 
 		 203 aa  179  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2321  iojap-like protein  66.95 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.891424 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1686  Iojap-related protein  66.95 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2298  iojap-like protein  66.95 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2392  iojap-like protein  63.49 
 
 		 205 aa  174  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2068  iojap-like protein  63.49 
 
 		 152 aa  174  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.286889 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1992  iojap-like protein  63.49 
 
 		 213 aa  174  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0989402  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1011  iojap domain-containing protein  66.96 
 
 		 154 aa  174  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1071  iojap domain-containing protein  66.09 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18972  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0796  iojap domain-containing protein  66.09 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1888  iojap domain-containing protein  66.09 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791339  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1381  iojap superfamily protein  66.09 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.601287  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1236  iojap domain-containing protein  66.09 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.757129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1227  iojap domain-containing protein  66.09 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0354  iojap domain-containing protein  66.09 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.623814  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1297  iojap-like protein  64.91 
 
 		 154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605705  normal  0.0750793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3263  Iojap-related protein  65.79 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.874451 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1949  iojap-like protein  59.54 
 
 		 250 aa  168  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1341  hypothetical protein  57.26 
 
 		 189 aa  153  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1901  iojap-like protein  55.04 
 
 		 274 aa  152  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1706  iojap-like protein  55.04 
 
 		 262 aa  152  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0218041  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1972  Iojap-related protein  52.71 
 
 		 274 aa  151  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2687  iojap-like protein  56.91 
 
 		 221 aa  149  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0645219  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2079  Iojap-related protein  56.67 
 
 		 261 aa  149  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3200  iojap-like protein  54.76 
 
 		 263 aa  149  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2625  iojap-like protein  53.28 
 
 		 233 aa  148  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.247151  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1732  iojap-like protein  52 
 
 		 289 aa  148  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3524  iojap-like protein  54.1 
 
 		 261 aa  147  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395947  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  57.89 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  53.7 
 
 		 115 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  48.7 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  49.52 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  50.93 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  41.94 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  44.76 
 
 		 115 aa  100  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  43.36 
 
 		 118 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  43.36 
 
 		 118 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  43.36 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  39.81 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  37.37 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  42.48 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  40.74 
 
 		 116 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  46.23 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0485  Iojap-related protein  37.96 
 
 		 120 aa  92  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.40385e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  46.23 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  46.23 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  37.37 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  40.5 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  43 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  39.25 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  42.06 
 
 		 130 aa  91.3  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  38.46 
 
 		 115 aa  90.1  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1562  iojap-like protein  40 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.985002  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  37.38 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  37.38 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  37.04 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2544  iojap-like protein  35.4 
 
 		 135 aa  88.2  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139238  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  41.12 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  38.1 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  37.86 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  37.86 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  41.35 
 
 		 105 aa  87.4  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  35.24 
 
 		 115 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  37.04 
 
 		 109 aa  86.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  40 
 
 		 164 aa  86.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  35.51 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  39.39 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  43.3 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2990  iojap-like protein  39.64 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.923836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  35.92 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  35.92 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  36.04 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  35.92 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4730  iojap-like protein  41.75 
 
 		 109 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11649  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1717  iojap-related protein  40 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4220  iojap-like protein  40.78 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0701  iojap-like protein  38.53 
 
 		 109 aa  84.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000119797  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3209  iojap-related protein  42.86 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.013969  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1083  iojap-like protein  36.54 
 
 		 400 aa  84.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1739  iojap-like protein  44 
 
 		 173 aa  84.7  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  35.58 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  40 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1094  hypothetical protein  41.9 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  42.86 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  37.96 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  41.24 
 
 		 147 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1172  hypothetical protein  41.9 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149943  normal  0.124229 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1817  Iojap-related protein  39.47 
 
 		 118 aa  83.6  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  37.23 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  37.76 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0346  iojap-related protein  34.31 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>