235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1187 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1187  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  100 
 
 
339 aa  699  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0669  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  92.17 
 
 
335 aa  643  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1843  fructose-1,6-bisphosphatase  61.09 
 
 
335 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0532341  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1943  fructose-1,6-bisphosphatase  61.89 
 
 
338 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.713905  normal  0.0350228 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2126  fructose-1,6-bisphosphatase  61.59 
 
 
338 aa  420  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2266  fructose-1,6-bisphosphatase  61.59 
 
 
338 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.014374  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0875  fructose-1,6-bisphosphatase  60.91 
 
 
338 aa  418  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0821253  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3795  fructose-1,6-bisphosphatase  60.79 
 
 
337 aa  415  1e-115  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3263  fructose-1,6-bisphosphatase  60.49 
 
 
335 aa  416  1e-115  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139597  hitchhiker  8.37949e-09 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1149  fructose-1,6-bisphosphatase  60.42 
 
 
335 aa  416  1e-115  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191646  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1586  fructose-1,6-bisphosphatase  61.75 
 
 
335 aa  417  1e-115  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1067  fructose-1,6-bisphosphatase  60.24 
 
 
335 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.641395  normal  0.908963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2444  fructose-1,6-bisphosphatase  59.7 
 
 
339 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2775  fructose-1,6-bisphosphatase  60.98 
 
 
336 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2250  fructose-1,6-bisphosphatase  60.36 
 
 
339 aa  408  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.523394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2760  fructose-1,6-bisphosphatase  60.06 
 
 
339 aa  406  1e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1763  fructose-1,6-bisphosphatase  58.31 
 
 
341 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106936 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2704  fructose-1,6-bisphosphatase  58.23 
 
 
334 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67490  fructose-1,6-bisphosphatase  58.81 
 
 
336 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309201  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5843  fructose-1,6-bisphosphatase  58.99 
 
 
336 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45640  fructose-1,6-bisphosphatase  58.73 
 
 
337 aa  381  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191472  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5090  fructose-1,6-bisphosphatase  58.41 
 
 
336 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4914  fructose-1,6-bisphosphatase  58.41 
 
 
336 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0685  fructose-1,6-bisphosphatase  57.1 
 
 
338 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5040  fructose-1,6-bisphosphatase  58.41 
 
 
336 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0423  fructose-1,6-bisphosphatase  58.1 
 
 
336 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0157  fructose-1,6-bisphosphatase  54.49 
 
 
338 aa  371  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2987  fructose-1,6-bisphosphatase  54.49 
 
 
338 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2925  fructose-1,6-bisphosphatase  54.49 
 
 
338 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0920  fructose-1,6-bisphosphatase  56.48 
 
 
338 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.701252  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3031  fructose-1,6-bisphosphatase  54.49 
 
 
338 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0990  fructose-1,6-bisphosphatase  54.49 
 
 
338 aa  371  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2618  fructose-1,6-bisphosphatase  54.49 
 
 
338 aa  371  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.36  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0508  fructose-1,6-bisphosphatase  58.28 
 
 
335 aa  371  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1604  fructose-1,6-bisphosphatase  55.09 
 
 
338 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3071  fructose-1,6-bisphosphatase  56.79 
 
 
338 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137108  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5168  fructose-1,6-bisphosphatase  57.41 
 
 
336 aa  371  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4125  fructose-1,6-bisphosphatase  58.65 
 
 
337 aa  371  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00362057  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0370  fructose-1,6-bisphosphatase  57.73 
 
 
336 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0469  fructose-1,6-bisphosphatase  54.49 
 
 
338 aa  371  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0973  fructose-1,6-bisphosphatase  58.33 
 
 
337 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798772  normal  0.126092 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0889  fructose-1,6-bisphosphatase  57.83 
 
 
339 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.138169  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0877  fructose-1,6-bisphosphatase  57.83 
 
 
339 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798323  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2381  fructose-1,6-bisphosphatase  58.01 
 
 
337 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.881144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0535  fructose-1,6-bisphosphatase  58.33 
 
 
337 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115593  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1014  fructose-1,6-bisphosphatase  58.33 
 
 
337 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3283  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  53.37 
 
 
343 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0352  fructose-1,6-bisphosphatase  57.1 
 
 
336 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0021  fructose-1,6-bisphosphatase  54.43 
 
 
335 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193201  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0084  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  57.56 
 
 
337 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03469  fructose-1,6-bisphosphatase  57.47 
 
 
336 aa  360  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0813  fructose-1,6-bisphosphatase  56.39 
 
 
329 aa  357  2e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.66321e-06  hitchhiker  0.000279081 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0731  fructose-1,6-bisphosphatase  54.52 
 
 
329 aa  355  6e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.93174e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3770  fructose-1,6-bisphosphatase  55.56 
 
 
329 aa  354  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.61659e-07  hitchhiker  0.001107 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0281  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  55.95 
 
 
336 aa  353  3e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320713  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2577  fructose-1,6-bisphosphatase  51.82 
 
 
337 aa  353  3e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.157967 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0020  fructose-1,6-bisphosphatase  55.84 
 
 
338 aa  352  7e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  6.87853e-08 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3013  fructose-1,6-bisphosphatase  55.08 
 
 
322 aa  351  8e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514687  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0784  fructose-1,6-bisphosphatase  55.16 
 
 
342 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0298171  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3373  fructose-1,6-bisphosphatase  54.84 
 
 
330 aa  349  5e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.87487e-06  hitchhiker  0.00208925 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3991  fructose-1,6-bisphosphatase  54.84 
 
 
325 aa  348  5e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0676  fructose-1,6-bisphosphatase  54.52 
 
 
330 aa  348  9e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  4.49089e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1857  fructose-1,6-bisphosphatase  51.61 
 
 
334 aa  347  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  2.62461e-10  hitchhiker  0.000253993 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0649  fructose-1,6-bisphosphatase  54.84 
 
 
330 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  1.2106e-05  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3663  fructose-1,6-bisphosphatase  54.84 
 
 
325 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0199188  hitchhiker  8.25139e-06 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3844  fructose-1,6-bisphosphatase  54.52 
 
 
325 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0810382  unclonable  9.76669e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3721  fructose-1,6-bisphosphatase  54.84 
 
 
330 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10391  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0648  fructose-1,6-bisphosphatase  54.52 
 
 
330 aa  345  4e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  6.05795e-06  hitchhiker  6.05277e-06 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0773  fructose-1,6-bisphosphatase  55.08 
 
 
329 aa  346  4e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  1.38522e-07  normal  0.0106002 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4138  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  50.96 
 
 
319 aa  344  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  2.56898e-08  unclonable  5.22982e-12 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1393  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  53.33 
 
 
364 aa  340  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.834199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2986  fructose-1,6-bisphosphatase  53.35 
 
 
330 aa  341  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0368  fructose-1,6-bisphosphatase  52.79 
 
 
339 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.244889  normal  0.233864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3755  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  50 
 
 
365 aa  340  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0189  fructose-1,6-bisphosphatase  52.79 
 
 
339 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0209227  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0531  fructose-1,6-bisphosphatase  53.55 
 
 
330 aa  339  5e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.012262  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1859  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  54.9 
 
 
334 aa  337  2e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  1.01477e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0599  fructose-1,6-bisphosphatase  52.88 
 
 
320 aa  337  2e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.76806e-08  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3628  fructose-1,6-bisphosphatase  52.92 
 
 
357 aa  336  3e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2319  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  53.53 
 
 
338 aa  336  4e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.514677  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1409  fructose-1,6-bisphosphatase  52.13 
 
 
333 aa  333  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1511  D-fructose 1,6-bisphosphatase  51.56 
 
 
365 aa  328  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  4.22669e-08  decreased coverage  8.00022e-05 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1495  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  50.64 
 
 
337 aa  328  7e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  6.16027e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1982  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  50.48 
 
 
364 aa  327  1e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0586  D-fructose 1,6-bisphosphatase  51.97 
 
 
331 aa  328  1e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  3.25166e-05  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3589  D-fructose 1,6-bisphosphatase  56.47 
 
 
338 aa  327  1e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0270544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3026  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  49.08 
 
 
358 aa  325  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00242569  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2788  D-fructose 1,6-bisphosphatase  48.15 
 
 
357 aa  323  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450037  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2636  D-fructose 1,6-bisphosphatase  52.44 
 
 
333 aa  322  6e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0412723  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0541  fructose-1,6-bisphosphatase  49.53 
 
 
327 aa  322  6e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0242  fructose-1,6-bisphosphatase  50.33 
 
 
323 aa  317  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0389611  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0530  fructose-1,6-bisphosphatase  48.3 
 
 
327 aa  314  2e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.059521  normal  0.0102388 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2450  fructose-1,6-bisphosphatase  50.92 
 
 
378 aa  312  4e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709501  normal  0.535256 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00214  fructose-1,6-bisphosphatase  48.38 
 
 
325 aa  311  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2403  D-fructose 1,6-bisphosphatase  47.59 
 
 
369 aa  308  8e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96213  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4614  fructose-1,6-bisphosphatase  44.84 
 
 
322 aa  294  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1481  D-fructose 1,6-bisphosphatase  48.49 
 
 
351 aa  294  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1278  D-fructose 1,6-bisphosphatase  45.39 
 
 
322 aa  283  4e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  4.38051e-08  normal  0.25369 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1915  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  44.52 
 
 
371 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.934073 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3920  fructose-1,6-bisphosphatase  44.44 
 
 
349 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>