139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1160 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1160  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 
227 aa  460  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0682728 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0691  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  79.74 
 
 
227 aa  388  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.947793  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2555  outer-membrane lipoprotein carrier protein  42.86 
 
 
215 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0636  outer-membrane lipoprotein carrier protein  40.71 
 
 
231 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2151  outer-membrane lipoprotein carrier protein  43.88 
 
 
215 aa  168  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100483  normal  0.437177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3440  outer-membrane lipoprotein carrier protein  39.22 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1039  outer-membrane lipoprotein carrier protein  39.22 
 
 
244 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236245  normal  0.725621 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0686  outer-membrane lipoprotein carrier protein  43.37 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  0.650962 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2340  outer-membrane lipoprotein carrier protein  41.52 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2599  outer-membrane lipoprotein carrier protein  42.21 
 
 
212 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2121  outer-membrane lipoprotein carrier protein  42.21 
 
 
238 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0711049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3076  outer-membrane lipoprotein carrier protein  42.21 
 
 
238 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.132409  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1562  outer-membrane lipoprotein carrier protein  41.92 
 
 
236 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0791  outer-membrane lipoprotein carrier protein  42.21 
 
 
238 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.654977  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2623  outer-membrane lipoprotein carrier protein  42.21 
 
 
238 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2989  outer-membrane lipoprotein carrier protein  42.21 
 
 
240 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3041  outer-membrane lipoprotein carrier protein  42.21 
 
 
238 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1989  outer-membrane lipoprotein carrier protein  42.21 
 
 
238 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4079  outer-membrane lipoprotein carrier protein  38.39 
 
 
229 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2422  outer-membrane lipoprotein carrier protein  38.84 
 
 
229 aa  158  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461482  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0848  outer-membrane lipoprotein carrier protein  38.84 
 
 
229 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255068  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0836  outer-membrane lipoprotein carrier protein  38.84 
 
 
229 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0497  outer-membrane lipoprotein carrier protein  38.39 
 
 
229 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0976  outer-membrane lipoprotein carrier protein  38.39 
 
 
229 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0937  outer-membrane lipoprotein carrier protein  38.39 
 
 
229 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.723645  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.97 
 
 
219 aa  149  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.455724  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1497  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.03 
 
 
202 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.540106  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1760  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.22 
 
 
216 aa  132  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5362  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.81 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.32 
 
 
208 aa  129  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1286  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.82 
 
 
210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0178  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.66 
 
 
207 aa  121  9e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.7 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2719  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37 
 
 
212 aa  119  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3381  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37 
 
 
210 aa  119  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.23519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0757  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.36 
 
 
212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000775377 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.08 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3425  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.93 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936296  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1121  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.87 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.310503  normal  0.176319 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1394  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.03 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3210  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.84 
 
 
216 aa  111  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.378959  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3177  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.82 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.3 
 
 
236 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.25 
 
 
214 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1518  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.17 
 
 
273 aa  105  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1935  outer-membrane lipoprotein carrier protein  33.5 
 
 
212 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.765114  normal  0.707119 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0547  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.38 
 
 
230 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.117593  hitchhiker  0.000046415 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0377  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  29.38 
 
 
230 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3608  outer-membrane lipoprotein carrier protein  30.8 
 
 
207 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3585  outer-membrane lipoprotein carrier protein  32.65 
 
 
206 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2435  outer-membrane lipoprotein carrier protein  30.88 
 
 
210 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.699017  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4003  outer-membrane lipoprotein carrier protein  31.22 
 
 
228 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0440839  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1830  outer-membrane lipoprotein carrier protein  31.22 
 
 
207 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0153108 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2003  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.92 
 
 
205 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3798  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.26 
 
 
238 aa  99.4  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06126  outer-membrane lipoprotein carrier protein  31.86 
 
 
216 aa  99  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01040  outer-membrane lipoprotein carrier protein  31.86 
 
 
216 aa  99  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.331194  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3407  outer-membrane lipoprotein carrier protein  29.46 
 
 
211 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3178  outer-membrane lipoprotein carrier protein  30.63 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308735  normal  0.0497193 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.86 
 
 
238 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0787284 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3348  outer membrane lipoprotein carrier protein  30.63 
 
 
207 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00496768  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1753  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27 
 
 
233 aa  92  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  normal  0.0644178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1549  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.07 
 
 
216 aa  91.7  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1571  outer membrane lipoprotein carrier  26.76 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.199657  normal  0.807566 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.39 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0575497  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1729  hypothetical protein  30.2 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1729  hypothetical protein  32.5 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3255  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.89 
 
 
215 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00308863  hitchhiker  0.000000000848281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2387  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.77 
 
 
208 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0116989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28210  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.06 
 
 
207 aa  85.5  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372853  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0706  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.35 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0795  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.35 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111148  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1826  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.22 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119174  hitchhiker  0.00000680848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.88 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  30 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1281  outer-membrane lipoproteins carrier protein  26.42 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.866532  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1342  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.42 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.69 
 
 
223 aa  72  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.632485  normal  0.483182 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1694  periplasmic chaperone LolA  25.16 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.972431  normal  0.23288 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2307  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.23 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1206  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.11 
 
 
225 aa  52  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000867117  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00895  outer-membrane lipoprotein carrier protein precursor  28.75 
 
 
204 aa  52  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.169529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2752  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.75 
 
 
203 aa  52  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000100398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00902  hypothetical protein  28.75 
 
 
204 aa  52  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214105  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1053  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.75 
 
 
203 aa  52  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0514291  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0996  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.75 
 
 
203 aa  52  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00638939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0966  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.75 
 
 
203 aa  52  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.015889  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2705  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.75 
 
 
203 aa  52  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0180788  normal  0.777132 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2229  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.75 
 
 
203 aa  52  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.583755  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2437  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.75 
 
 
203 aa  52  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0718725  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1964  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.61 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  0.873937 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2012  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.61 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0324067  hitchhiker  0.00729445 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2051  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.61 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00204466  hitchhiker  0.0003026 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1415  outer-membrane lipoprotein carrier protein  29.27 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.560758  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1720  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2010  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.44 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00564496  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1988  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.47 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.937867  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0380  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.09 
 
 
229 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1574  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.6 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.057142  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2157  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.02 
 
 
208 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00319842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>