166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1106 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1106  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 359 aa  741    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  82.91 
 
 		 458 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  72.02 
 
 		 462 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  73.6 
 
 		 461 aa  479  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  69.3 
 
 		 454 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  67.8 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  68.64 
 
 		 494 aa  454  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  70.34 
 
 		 454 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  70.42 
 
 		 454 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  66.67 
 
 		 463 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  61.52 
 
 		 450 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  66.67 
 
 		 464 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  61.24 
 
 		 450 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  60.39 
 
 		 449 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  70.14 
 
 		 454 aa  425  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  69.94 
 
 		 476 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  59.94 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  59.1 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  55.46 
 
 		 460 aa  359  4e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  43.45 
 
 		 501 aa  301  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  35.64 
 
 		 451 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  32.58 
 
 		 449 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  34.17 
 
 		 447 aa  192  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  33.06 
 
 		 451 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  35.64 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  31.1 
 
 		 456 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  31.74 
 
 		 442 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  35.64 
 
 		 455 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  31.48 
 
 		 443 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  33.99 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  34.98 
 
 		 458 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  32.3 
 
 		 445 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  33.66 
 
 		 457 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  27.12 
 
 		 449 aa  144  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  30.64 
 
 		 488 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  36.14 
 
 		 458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  27.47 
 
 		 446 aa  137  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  34.44 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  33.14 
 
 		 482 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  30.04 
 
 		 446 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  30.65 
 
 		 468 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  32.55 
 
 		 463 aa  133  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  30.04 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  29.12 
 
 		 455 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  32.88 
 
 		 481 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1051  MmgE/PrpD family protein  30.85 
 
 		 449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0583163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  30.61 
 
 		 483 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  29.43 
 
 		 481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  32.32 
 
 		 456 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  30.05 
 
 		 490 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  29.94 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  33.22 
 
 		 453 aa  123  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  28.15 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  31.85 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  30.09 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  30.42 
 
 		 477 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  31.14 
 
 		 503 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  31.14 
 
 		 503 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  32.15 
 
 		 503 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  27.59 
 
 		 457 aa  116  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  30.91 
 
 		 450 aa  116  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  32.23 
 
 		 468 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  30.5 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  28.65 
 
 		 458 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  28.41 
 
 		 451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  28.49 
 
 		 458 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  30.51 
 
 		 482 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  29.72 
 
 		 481 aa  109  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  33.22 
 
 		 447 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  29.97 
 
 		 470 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3206  MmgE/PrpD family protein  29.77 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  25.58 
 
 		 485 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  28.69 
 
 		 461 aa  106  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  34.54 
 
 		 486 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  30.09 
 
 		 470 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8168  hypothetical protein  30.42 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  30.45 
 
 		 467 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  30.3 
 
 		 450 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  28.53 
 
 		 474 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  26.1 
 
 		 458 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  25.27 
 
 		 469 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  28.41 
 
 		 463 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  27.83 
 
 		 453 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  28.7 
 
 		 461 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8184  MmgE/PrpD family protein  29.72 
 
 		 443 aa  97.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  33.73 
 
 		 468 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  34.65 
 
 		 464 aa  94.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  31.76 
 
 		 462 aa  94.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  29.69 
 
 		 504 aa  92.8  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  26.91 
 
 		 453 aa  92.8  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  29.3 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  31.27 
 
 		 465 aa  90.5  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  30.53 
 
 		 476 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  30.23 
 
 		 457 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4958  MmgE/PrpD family protein  34.25 
 
 		 464 aa  87  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  27.72 
 
 		 500 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  28.38 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1843  MmgE/PrpD family protein  28.37 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.279739  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7496  MmgE/PrpD family protein  26.76 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000196116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  24 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>