More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1030 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 312 aa  641    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  79.31 
 
 		 318 aa  450  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  53.73 
 
 		 287 aa  301  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  47.94 
 
 		 312 aa  277  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  50.4 
 
 		 318 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  49.6 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  50.4 
 
 		 318 aa  265  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  48.81 
 
 		 318 aa  256  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  41.06 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  41.11 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  36.32 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  30.91 
 
 		 335 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  30.91 
 
 		 335 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  28.09 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  28.38 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  27.8 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  30.31 
 
 		 342 aa  109  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  28.45 
 
 		 438 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  26.32 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  28.33 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  31.06 
 
 		 312 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  25.94 
 
 		 319 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  28.73 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  29.83 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  27.39 
 
 		 352 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  25.59 
 
 		 319 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  29.7 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  27.4 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  29.12 
 
 		 347 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  29.72 
 
 		 340 aa  96.7  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  29.8 
 
 		 327 aa  96.3  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 		 351 aa  96.7  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 		 320 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  28.96 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  29.28 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  26.76 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  26.76 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  26.76 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 339 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 339 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  28.23 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  27.12 
 
 		 323 aa  91.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  28.09 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  25.82 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  27.86 
 
 		 342 aa  90.5  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  28.35 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  26.07 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  29.88 
 
 		 312 aa  90.5  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  27.83 
 
 		 264 aa  89.7  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  28.62 
 
 		 272 aa  89  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  25.88 
 
 		 364 aa  89  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 		 332 aa  89  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.25 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  27.7 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  24.89 
 
 		 321 aa  88.2  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  27.48 
 
 		 307 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  27.48 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  25.27 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  25.83 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  26.43 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  27.23 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  28.02 
 
 		 364 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 		 310 aa  87  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  27.9 
 
 		 315 aa  85.9  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  24.54 
 
 		 310 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  25.45 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  26.29 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  26.29 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  26.29 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  26.29 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  24.16 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  26.29 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  26.29 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  26.29 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  28.24 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  26.29 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  27 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  26.51 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  29.52 
 
 		 644 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  26.27 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  30.58 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  27.42 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  28.04 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  25.33 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>