83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1028 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1028  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 
373 aa  741    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  83.38 
 
 
373 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.865482  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0739  hypothetical protein  59.4 
 
 
371 aa  441  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  58.31 
 
 
371 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0799  YeeE/YedE  59.4 
 
 
373 aa  431  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236196  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0688  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  59.62 
 
 
371 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277778  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0732  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  59.35 
 
 
371 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.90241  normal  0.157208 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4041  YeeE/YedE  57.14 
 
 
367 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1987  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  51.82 
 
 
374 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1941  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  49.32 
 
 
371 aa  343  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.368246 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0777  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50.9 
 
 
368 aa  302  5.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226768  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1485  putative transmembrane protein  45.71 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3776  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.35 
 
 
373 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2201  transmembrane protein  37.31 
 
 
420 aa  232  8.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000866574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1667  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.37 
 
 
423 aa  231  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0571  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.68 
 
 
423 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.484751  normal  0.560137 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2440  putative transmembrane protein  36.71 
 
 
373 aa  199  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746191  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2224  hypothetical protein  35.51 
 
 
421 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1966  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.86 
 
 
421 aa  189  5e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2872  hypothetical protein  38.33 
 
 
357 aa  189  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2696  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.31 
 
 
360 aa  186  7e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.06 
 
 
345 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4152  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.78 
 
 
347 aa  176  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0839918  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3665  YeeE/YedE family membrane protein  34.21 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1268  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.23 
 
 
368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4968  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.63 
 
 
400 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4379  hypothetical protein  34.43 
 
 
400 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.204255  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1528  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.31 
 
 
368 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.31 
 
 
351 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317851  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4381  hypothetical protein  35.98 
 
 
351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2813  hypothetical protein  34.12 
 
 
362 aa  140  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4263  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.23 
 
 
400 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409839  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3923  hypothetical protein  30.42 
 
 
348 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.554926 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4145  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.7 
 
 
349 aa  110  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689999  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4366  hypothetical protein  29.11 
 
 
363 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3126  YeeE/YedE  27.11 
 
 
361 aa  97.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  27.81 
 
 
343 aa  95.1  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  25.21 
 
 
359 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  25.21 
 
 
359 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4250  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.35 
 
 
363 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.778498  normal  0.233136 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.53 
 
 
330 aa  91.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3681  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  27.66 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241689  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3774  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.82 
 
 
374 aa  89.7  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4955  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.73 
 
 
370 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  27.76 
 
 
344 aa  87.8  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  28.85 
 
 
385 aa  86.3  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3909  hypothetical protein  25.81 
 
 
353 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.192183 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  27.83 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  27.83 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  27.83 
 
 
352 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  27.83 
 
 
352 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  27.52 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  27.52 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.22 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1097  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.51 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.661012 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.93 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.4 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4161  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.47 
 
 
360 aa  72.8  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  27.04 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  25.89 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  25.81 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.25 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.16 
 
 
364 aa  64.3  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0226086  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.32 
 
 
371 aa  62.8  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  24.45 
 
 
355 aa  62  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.51 
 
 
368 aa  59.7  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  34.29 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.94 
 
 
215 aa  56.2  0.0000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0372  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.57 
 
 
415 aa  56.2  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0829  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.21 
 
 
409 aa  54.7  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  22.4 
 
 
354 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1601  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.57 
 
 
416 aa  53.1  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382495  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1655  hypothetical protein  36.67 
 
 
103 aa  52.8  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000348591  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1691  hypothetical protein  25.84 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.187562 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0045  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.3 
 
 
216 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0957  metal-activated pyridoxal enzyme  36.21 
 
 
352 aa  48.9  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.361179  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2590  hypothetical protein  33.03 
 
 
455 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0419  YeeE/YedE  26.92 
 
 
385 aa  46.6  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453794  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.04 
 
 
174 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.93 
 
 
183 aa  46.2  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.71 
 
 
171 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0403  hypothetical protein  37.27 
 
 
356 aa  45.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0063  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.33 
 
 
471 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>