More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0933 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  90.57 
 
 		 212 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  55.19 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  53.74 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  54.37 
 
 		 211 aa  221  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 211 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  51.94 
 
 		 211 aa  208  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  208  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 211 aa  207  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  52.4 
 
 		 215 aa  196  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 233 aa  192  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2806  GntR family transcriptional regulator  52.4 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  47.37 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 222 aa  188  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3397  GntR family transcriptional regulator  53.88 
 
 		 211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00851285  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 222 aa  181  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  45.32 
 
 		 223 aa  181  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 223 aa  181  6e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 222 aa  180  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  43.88 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  38.61 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  38.12 
 
 		 229 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  38.12 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 231 aa  121  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  38 
 
 		 239 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 230 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  34.22 
 
 		 230 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  31.69 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  35.08 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 242 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 245 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 226 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  37.2 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 238 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  32.99 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  34.43 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  33.67 
 
 		 263 aa  104  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 223 aa  104  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 263 aa  104  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 225 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  34.24 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 257 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 254 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 237 aa  101  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 226 aa  101  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 227 aa  101  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 241 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 247 aa  99.4  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>