275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0539 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0539  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 198 aa  410  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.559214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  84.34 
 
 		 217 aa  358  4e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  62.94 
 
 		 212 aa  253  9e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  61.93 
 
 		 212 aa  251  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  61.93 
 
 		 212 aa  250  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2177  radical SAM domain-containing protein  60.91 
 
 		 211 aa  248  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  65.22 
 
 		 212 aa  247  8e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  65.22 
 
 		 212 aa  246  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  61.11 
 
 		 210 aa  245  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  61.93 
 
 		 211 aa  244  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2757  organic radical activating-like protein  60.91 
 
 		 211 aa  244  9e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1082  hypothetical protein  58.88 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0796738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3395  hypothetical protein  59.9 
 
 		 211 aa  241  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.709482  normal  0.257118 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  59.39 
 
 		 210 aa  241  5e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  59.9 
 
 		 210 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  59.39 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1045  hypothetical protein  59.8 
 
 		 211 aa  238  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0321486  normal  0.408994 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1198  hypothetical protein  58.88 
 
 		 210 aa  234  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.949639 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1354  hypothetical protein  57.65 
 
 		 210 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.129459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  58.88 
 
 		 210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  56.35 
 
 		 211 aa  232  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  57.36 
 
 		 210 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  56.85 
 
 		 210 aa  231  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1410  radical SAM domain protein  60.41 
 
 		 211 aa  231  6e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  56.35 
 
 		 210 aa  229  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  56.85 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  56.85 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  56.85 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  56.85 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  56.85 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  57.79 
 
 		 211 aa  230  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  56.85 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2382  hypothetical protein  60.91 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133119  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  57.58 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  59.39 
 
 		 211 aa  229  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6747  radical SAM domain-containing protein  62.44 
 
 		 210 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1161  Radical SAM domain protein  64.67 
 
 		 210 aa  228  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.228018  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  57.87 
 
 		 210 aa  228  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  55.84 
 
 		 210 aa  228  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  56.35 
 
 		 210 aa  227  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  56.35 
 
 		 210 aa  226  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  54.82 
 
 		 210 aa  226  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  56.35 
 
 		 210 aa  226  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  56.35 
 
 		 210 aa  226  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  55.84 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  55.84 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  58.79 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3190  hypothetical protein  60.41 
 
 		 211 aa  225  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241224  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  53.81 
 
 		 210 aa  223  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2298  hypothetical protein  60.41 
 
 		 210 aa  221  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  0.58951 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2039  hypothetical protein  59.02 
 
 		 215 aa  220  9e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4095  hypothetical protein  54.82 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3380  hypothetical protein  55.78 
 
 		 212 aa  218  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1837  hypothetical protein  55.78 
 
 		 212 aa  218  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0997579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0107  organic radical activating enzyme  54.11 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4381  hypothetical protein  52.49 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  59.02 
 
 		 210 aa  214  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2104  hypothetical protein  53.97 
 
 		 216 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00607165 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0718  radical SAM domain-containing protein  54.82 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.525319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0017  radical SAM domain-containing protein  56.85 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.941948 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0794  hypothetical protein  53.51 
 
 		 218 aa  202  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1403  organic radical activating-like protein  52.82 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.962415  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6594  radical SAM domain-containing protein  61.96 
 
 		 210 aa  198  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0597  hypothetical protein  57.84 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1115  radical SAM domain-containing protein  52.79 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1081  hypothetical protein  56.52 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1124  radical SAM domain protein  56.99 
 
 		 224 aa  185  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  42.27 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  44.53 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  40.31 
 
 		 211 aa  97.8  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  31.34 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  31.08 
 
 		 222 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  31.53 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  30.88 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  33.64 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  38.16 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  31.08 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  31.08 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  31.08 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  31.08 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  31.08 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  32.26 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  33.5 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  38.52 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  32.72 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  31.96 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  30.18 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  35.71 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  27.44 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  36.25 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  32.88 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  35.22 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  31.16 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  28.5 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  36.23 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  34.06 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  31.03 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  30.85 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  34 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>