More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0466 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1496  aromatic amino acid aminotransferase  96.99 
 
 		 399 aa  769    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0466  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 		 399 aa  823    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00128744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1018  aromatic amino acid aminotransferase  68.77 
 
 		 398 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.039027  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1050  aromatic amino acid aminotransferase  68.09 
 
 		 398 aa  557  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0940  aromatic amino acid aminotransferase  70.1 
 
 		 398 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0875  aromatic amino acid aminotransferase  69.85 
 
 		 398 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1010  aromatic amino acid aminotransferase  67.84 
 
 		 398 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126314  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2002  aromatic amino acid aminotransferase  64.9 
 
 		 402 aa  552  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1395  aromatic amino acid aminotransferase  66.58 
 
 		 399 aa  544  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268417  hitchhiker  0.0082547 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2439  aromatic amino acid aminotransferase  65.99 
 
 		 402 aa  530  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1959  aromatic amino acid aminotransferase  66.49 
 
 		 399 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3154  aromatic amino acid aminotransferase  66.83 
 
 		 399 aa  525  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.4038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1989  aromatic amino acid aminotransferase  64.07 
 
 		 398 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.447695  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1066  aromatic amino acid aminotransferase  65.72 
 
 		 399 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0961353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20090  aromatic amino acid aminotransferase  64.07 
 
 		 398 aa  521  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2738  aromatic amino acid aminotransferase  63.07 
 
 		 398 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187643  normal  0.404838 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0879  aromatic amino acid aminotransferase  65.83 
 
 		 399 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0603  aromatic amino acid aminotransferase  65.83 
 
 		 399 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48132  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1919  aromatic amino acid aminotransferase  65.83 
 
 		 399 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0016  aromatic amino acid aminotransferase  65.83 
 
 		 399 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.815383  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2037  aromatic amino acid aminotransferase  65.83 
 
 		 399 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1738  aromatic amino acid aminotransferase  65.83 
 
 		 399 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2128  aromatic amino acid aminotransferase  66.49 
 
 		 399 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2249  aromatic amino acid aminotransferase  66.49 
 
 		 399 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0506  aromatic amino acid aminotransferase  65.83 
 
 		 399 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0916  aromatic amino acid aminotransferase  65.83 
 
 		 399 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.106367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2151  aromatic amino acid aminotransferase  60.55 
 
 		 398 aa  509  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1635  aromatic amino acid aminotransferase  60.55 
 
 		 398 aa  509  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2139  aromatic amino acid aminotransferase  59.05 
 
 		 398 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2235  aromatic amino acid aminotransferase  65.72 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1051  aromatic amino acid aminotransferase  58.54 
 
 		 398 aa  505  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5539  aromatic amino acid aminotransferase  65.72 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5866  aromatic amino acid aminotransferase  65.98 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0021  aromatic amino acid aminotransferase  61.06 
 
 		 400 aa  505  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000117324 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2211  aromatic amino acid aminotransferase  65.98 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1973  aromatic amino acid aminotransferase  62.06 
 
 		 398 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.275867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2175  aromatic amino acid aminotransferase  59.8 
 
 		 398 aa  504  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23500  aromatic amino acid aminotransferase  63.32 
 
 		 398 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283341  hitchhiker  0.00416688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1972  aromatic amino acid aminotransferase  63.57 
 
 		 398 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  hitchhiker  0.0035626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2163  aspartate aminotransferase  61.81 
 
 		 398 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1874  aromatic amino acid aminotransferase  62.06 
 
 		 398 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2174  aromatic amino acid aminotransferase  58.79 
 
 		 398 aa  500  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00875667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2440  aromatic amino acid aminotransferase  58.29 
 
 		 398 aa  499  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4002  aromatic amino acid aminotransferase  58.54 
 
 		 398 aa  496  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0358212 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3787  aromatic amino acid aminotransferase  63.32 
 
 		 398 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972413  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1538  aromatic amino acid aminotransferase  62.56 
 
 		 398 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1562  aromatic amino acid aminotransferase  58.04 
 
 		 398 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03468  aromatic amino acid aminotransferase  58.54 
 
 		 400 aa  491  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1504  aromatic amino acid aminotransferase  62.06 
 
 		 398 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2293  aromatic amino acid aminotransferase  60.05 
 
 		 396 aa  486  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.673394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2370  aromatic amino acid aminotransferase  55.78 
 
 		 401 aa  475  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0026  aromatic amino acid aminotransferase  52.76 
 
 		 400 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0030  aromatic amino acid aminotransferase  52.76 
 
 		 400 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1668  aromatic amino acid aminotransferase  51.26 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0301688  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3404  aromatic amino acid aminotransferase  52.39 
 
 		 401 aa  430  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4503  aromatic amino acid aminotransferase  51.01 
 
 		 399 aa  428  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382986  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3600  aromatic amino acid aminotransferase  53.9 
 
 		 407 aa  420  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2228  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 		 397 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.207544  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2121  aromatic amino acid aminotransferase  49.75 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0183717  normal  0.0291877 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1805  aromatic amino acid aminotransferase  50 
 
 		 397 aa  421  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0271034  normal  0.497498 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3590  aromatic amino acid aminotransferase  50.76 
 
 		 398 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2182  aromatic amino acid aminotransferase  50.76 
 
 		 398 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1999  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2411  aromatic amino acid aminotransferase  48.23 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0265912  hitchhiker  0.0000197761 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4927  aromatic amino acid aminotransferase  50.51 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177363  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2020  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00317803  hitchhiker  0.00000201349 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2225  aromatic amino acid aminotransferase  48.11 
 
 		 398 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2326  aromatic amino acid aminotransferase  50.25 
 
 		 398 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.88203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2206  aromatic amino acid aminotransferase  48.99 
 
 		 397 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000624444  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4445  aromatic amino acid aminotransferase  47.98 
 
 		 398 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1955  aromatic amino acid aminotransferase  49.24 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4515  aromatic amino acid aminotransferase  50.13 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01890  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 		 399 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2350  aromatic amino acid aminotransferase  47.98 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2228  aromatic amino acid aminotransferase  48.48 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000156913  normal  0.0325247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3682  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 		 398 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4501  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5384  aromatic amino acid aminotransferase  49.37 
 
 		 399 aa  408  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261503  normal  0.0944664 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2024  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003143  aspartate aminotransferase  48.48 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4294  aromatic amino acid aminotransferase  50.13 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.820451  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2215  aromatic amino acid aminotransferase  48.74 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00106889  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03926  tyrosine aminotransferase, tyrosine-repressible, PLP-dependent  49.87 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0286494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3939  Aromatic-amino-acid transaminase  49.87 
 
 		 397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03886  hypothetical protein  49.87 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0274153  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2156  aromatic amino acid aminotransferase  48.23 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0020376  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1593  aromatic amino acid aminotransferase  48.61 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4606  aromatic amino acid aminotransferase  49.62 
 
 		 397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2805  aromatic amino acid aminotransferase  49.75 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1222  aromatic amino acid aminotransferase  49.37 
 
 		 399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309647 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3974  aromatic amino acid aminotransferase  49.87 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5339  aromatic-amino-acid aminotransferase  48.49 
 
 		 399 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4898  aromatic amino acid aminotransferase  48.49 
 
 		 399 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3504  aromatic amino acid aminotransferase  46.97 
 
 		 397 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3642  aromatic amino acid aminotransferase  47.47 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.463621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4541  aromatic amino acid aminotransferase  49.62 
 
 		 397 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5556  aromatic amino acid aminotransferase  49.87 
 
 		 411 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1687  aromatic amino acid aminotransferase  47.49 
 
 		 399 aa  399  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.262918  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4268  aromatic amino acid aminotransferase  48.48 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0463663  normal  0.625536 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1111  aromatic amino acid aminotransferase  48.36 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.698434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>