158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0415 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0415  DNA repair protein RecO  100 
 
 
244 aa  499  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0408  DNA repair protein RecO  92.62 
 
 
244 aa  464  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2168  DNA repair protein RecO  58.02 
 
 
278 aa  278  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1065  DNA repair protein RecO  57.61 
 
 
272 aa  275  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0820208  normal  0.0227401 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0930  DNA repair protein RecO  57.38 
 
 
273 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133285  normal  0.103629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0995  DNA repair protein RecO  57.38 
 
 
273 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1012  DNA repair protein RecO  57.2 
 
 
279 aa  271  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39895  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1016  DNA repair protein RecO  57.2 
 
 
279 aa  271  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  54.58 
 
 
291 aa  270  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0656  DNA repair protein RecO  57.2 
 
 
278 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1136  DNA repair protein RecO  57.2 
 
 
278 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2897  DNA repair protein RecO  57.5 
 
 
309 aa  270  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.64605  normal  0.158668 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1094  DNA repair protein RecO  57.2 
 
 
278 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1087  DNA repair protein RecO  57.08 
 
 
306 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4248  DNA repair protein RecO  55.97 
 
 
278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0843  DNA repair protein RecO  54.32 
 
 
336 aa  265  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236883  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  54.36 
 
 
298 aa  265  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0545  DNA repair protein RecO  55.56 
 
 
286 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2893  DNA repair protein RecO  55.56 
 
 
286 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2464  DNA repair protein RecO  55.56 
 
 
275 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2817  DNA repair protein RecO  55.56 
 
 
275 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2777  DNA repair protein RecO  55.56 
 
 
275 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2838  DNA repair protein RecO  55.56 
 
 
275 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1787  DNA repair protein RecO  55.56 
 
 
275 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806002  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1732  DNA repair protein RecO  55.56 
 
 
286 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.467987  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2310  DNA repair protein RecO  47.45 
 
 
252 aa  228  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0770241  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2031  DNA repair protein RecO  46.09 
 
 
242 aa  204  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0971735  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1757  DNA repair protein RecO  49.38 
 
 
242 aa  203  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.108646  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2084  DNA repair protein RecO  47.15 
 
 
256 aa  190  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.987652  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0866  DNA repair protein RecO  45.64 
 
 
244 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0186156 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1010  DNA repair protein RecO  45.64 
 
 
244 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.028746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3633  DNA repair protein RecO  42.69 
 
 
249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3059  DNA repair protein RecO  43.68 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.763582  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0794  recombination protein O, RecO  41.74 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1198  DNA repair protein RecO  41.67 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.456888  decreased coverage  0.00478766 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0483  DNA repair protein  43.04 
 
 
231 aa  161  9e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1684  DNA repair protein RecO  42.86 
 
 
234 aa  160  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3265  DNA repair protein RecO  42.48 
 
 
262 aa  154  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0405649 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2618  DNA repair protein RecO  42.11 
 
 
262 aa  153  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1461  DNA repair protein RecO  39.74 
 
 
242 aa  148  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  38.6 
 
 
241 aa  145  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  38.6 
 
 
241 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  38.6 
 
 
241 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5259  DNA repair protein RecO  41.7 
 
 
256 aa  145  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  37.12 
 
 
238 aa  145  8.000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0032  DNA repair protein RecO  35.02 
 
 
234 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2243  DNA repair protein RecO  38.56 
 
 
246 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  39.83 
 
 
243 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1206  DNA repair protein RecO  37.55 
 
 
245 aa  141  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0996  DNA repair protein RecO  39.22 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4747  DNA repair protein RecO  38.84 
 
 
233 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02459  DNA repair protein RecO  37.12 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1103  DNA repair protein RecO  37.12 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0298375  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2957  DNA repair protein RecO  38.16 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118345  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3801  DNA repair protein RecO  37.12 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3069  DNA repair protein RecO  37.55 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02423  hypothetical protein  37.12 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1070  DNA repair protein RecO  37.55 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1112  DNA repair protein RecO  37.12 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2741  DNA repair protein RecO  37.72 
 
 
242 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184755  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2718  DNA repair protein RecO  37.12 
 
 
242 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888529  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2782  DNA repair protein RecO  37.72 
 
 
242 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2845  DNA repair protein RecO  37.72 
 
 
242 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.316896  normal  0.789708 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2720  DNA repair protein RecO  37.12 
 
 
242 aa  139  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2851  DNA repair protein RecO  37.12 
 
 
242 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2822  DNA repair protein RecO  37.72 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2930  DNA repair protein RecO  37.12 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.4363  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54300  DNA repair protein RecO  38.02 
 
 
233 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13820  DNA repair protein RecO  36.82 
 
 
230 aa  138  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  37.99 
 
 
244 aa  138  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0652  DNA replication and repair protein RecO  37.1 
 
 
274 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10662  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3052  DNA repair protein RecO  36.24 
 
 
236 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1751  DNA repair protein RecO  40.16 
 
 
251 aa  134  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00839209  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  36.36 
 
 
243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1477  DNA repair protein RecO  38.3 
 
 
229 aa  131  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.451299  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2343  DNA repair protein RecO  39.85 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.89674  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1435  DNA repair protein RecO  37.5 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1075  DNA repair protein RecO  38.26 
 
 
227 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  35.22 
 
 
241 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4286  DNA repair protein RecO  37.07 
 
 
227 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1404  DNA repair protein RecO  38.43 
 
 
257 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4215  DNA repair protein RecO  37.07 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.322545  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4372  DNA repair protein RecO  36.36 
 
 
227 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.197267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3949  DNA repair protein RecO  37.07 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 
240 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1349  DNA repair protein RecO  36.73 
 
 
247 aa  119  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.170679  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1633  DNA repair protein RecO  35.74 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.183624  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0882  DNA repair protein RecO  34.89 
 
 
224 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0596  DNA repair protein RecO  35.63 
 
 
256 aa  115  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201329 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03534  recombinational DNA repair protein  33.94 
 
 
219 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2764  DNA repair protein RecO  34.44 
 
 
240 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.165076  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0093  DNA repair protein RecO  32.5 
 
 
202 aa  105  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3110  DNA repair protein RecO  34.05 
 
 
236 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0026851  normal  0.0227356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1280  DNA repair protein RecO  34.05 
 
 
236 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.588723  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03405  DNA repair protein RecO  33.77 
 
 
234 aa  105  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0642  DNA repair protein RecO  31.43 
 
 
233 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.272971  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1203  DNA repair protein RecO  34.05 
 
 
236 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0374149  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1247  DNA repair protein RecO  33.62 
 
 
236 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00802629  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2973  DNA repair protein RecO  32.34 
 
 
239 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318586  hitchhiker  0.00228518 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1094  DNA repair protein RecO  30.77 
 
 
233 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.533412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>