181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0403 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0403  50S ribosomal protein L32  100 
 
 		 59 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0396  50S ribosomal protein L32  96.61 
 
 		 59 aa  120  9e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1048  50S ribosomal protein L32  84.75 
 
 		 59 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0978  50S ribosomal protein L32  84.75 
 
 		 59 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0979958 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1553  50S ribosomal protein L32  83.05 
 
 		 59 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198496  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2185  50S ribosomal protein L32  83.05 
 
 		 59 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409214  normal  0.0976531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0913  50S ribosomal protein L32  83.05 
 
 		 59 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0957314 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0999  50S ribosomal protein L32  81.36 
 
 		 59 aa  104  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.852349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4231  50S ribosomal protein L32  81.36 
 
 		 59 aa  104  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0358913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2914  50S ribosomal protein L32  81.36 
 
 		 59 aa  104  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1070  50S ribosomal protein L32  81.36 
 
 		 59 aa  104  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0639  50S ribosomal protein L32  81.36 
 
 		 59 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1077  50S ribosomal protein L32  81.36 
 
 		 59 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.990769 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1119  50S ribosomal protein L32  81.36 
 
 		 59 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1715  50S ribosomal protein L32  81.36 
 
 		 59 aa  104  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0995  50S ribosomal protein L32  81.36 
 
 		 59 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0528  50S ribosomal protein L32  81.36 
 
 		 59 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2909  50S ribosomal protein L32  81.36 
 
 		 59 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2482  50S ribosomal protein L32  81.36 
 
 		 59 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.130811  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2800  50S ribosomal protein L32  81.36 
 
 		 59 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.223415  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2794  50S ribosomal protein L32  81.36 
 
 		 59 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2855  50S ribosomal protein L32  81.36 
 
 		 59 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1805  50S ribosomal protein L32  81.36 
 
 		 59 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0826  ribosomal protein L32  81.36 
 
 		 59 aa  103  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.784617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2013  50S ribosomal protein L32  77.97 
 
 		 59 aa  100  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2430  ribosomal protein L32  76.27 
 
 		 59 aa  100  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0972633  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2267  50S ribosomal protein L32  77.97 
 
 		 59 aa  100  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2432  50S ribosomal protein L32  77.97 
 
 		 59 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1728  50S ribosomal protein L32  74.58 
 
 		 60 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3652  50S ribosomal protein L32  74.58 
 
 		 60 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1509  50S ribosomal protein L32  74.58 
 
 		 59 aa  98.2  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0171128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0613  50S ribosomal protein L32  74.58 
 
 		 60 aa  97.4  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000739879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1181  50S ribosomal protein L32  72.88 
 
 		 60 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1070  50S ribosomal protein L32  72.88 
 
 		 59 aa  95.5  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.772826  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3078  50S ribosomal protein L32  72.88 
 
 		 60 aa  95.5  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3282  50S ribosomal protein L32  71.19 
 
 		 60 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2635  50S ribosomal protein L32  71.19 
 
 		 60 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1387  50S ribosomal protein L32  71.19 
 
 		 60 aa  94.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5274  50S ribosomal protein L32  71.19 
 
 		 60 aa  92.8  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3254  ribosomal protein L32  69.49 
 
 		 60 aa  93.2  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000244715  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0634  50S ribosomal protein L32  71.19 
 
 		 60 aa  92  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.307696  normal  0.0979505 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1425  50S ribosomal protein L32  64.41 
 
 		 59 aa  87  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.249628  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14890  50S ribosomal protein L32  66.1 
 
 		 60 aa  87  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25630  50S ribosomal protein L32  66.1 
 
 		 60 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000532355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2191  50S ribosomal protein L32  66.1 
 
 		 60 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1911  50S ribosomal protein L32  67.8 
 
 		 60 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.361385  unclonable  0.000000174861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1487  50S ribosomal protein L32  67.8 
 
 		 60 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3803  50S ribosomal protein L32  67.8 
 
 		 60 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2005  50S ribosomal protein L32  68.52 
 
 		 64 aa  84.3  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4160  50S ribosomal protein L32  66.1 
 
 		 60 aa  84  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1522  50S ribosomal protein L32  66.1 
 
 		 60 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.484698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3835  ribosomal protein L32  66.1 
 
 		 60 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.460634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1644  50S ribosomal protein L32  66.1 
 
 		 60 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119469  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1625  50S ribosomal protein L32  64.41 
 
 		 60 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.701038 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1237  50S ribosomal protein L32  61.02 
 
 		 59 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.409262  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1669  ribosomal protein S32  57.63 
 
 		 65 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.545135  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1626  50S ribosomal protein L32  57.63 
 
 		 60 aa  80.5  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.904867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1870  ribosomal protein L32  57.63 
 
 		 59 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1619  50S ribosomal protein L32  66.67 
 
 		 56 aa  77.8  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000529201  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1583  50S ribosomal protein L32  64.81 
 
 		 56 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000129748  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1611  50S ribosomal protein L32  61.11 
 
 		 56 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123515  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1913  50S ribosomal protein L32P  61.82 
 
 		 62 aa  77  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2507  50S ribosomal protein L32  62.96 
 
 		 56 aa  76.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000163859  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1984  50S ribosomal protein L32  61.11 
 
 		 56 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709039  decreased coverage  0.000595562 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2812  50S ribosomal protein L32  62.96 
 
 		 56 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000738596  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2297  50S ribosomal protein L32  59.26 
 
 		 56 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000139706  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1495  50S ribosomal protein L32  59.26 
 
 		 56 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02912  50S ribosomal protein L32  59.26 
 
 		 56 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002992  LSU ribosomal protein L32p  59.26 
 
 		 56 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000126442  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2780  50S ribosomal protein L32  57.41 
 
 		 56 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1574  50S ribosomal protein L32  61.11 
 
 		 55 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166965  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1682  50S ribosomal protein L32  61.11 
 
 		 55 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000176962  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2400  50S ribosomal protein L32  57.41 
 
 		 56 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000318296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2470  50S ribosomal protein L32  57.41 
 
 		 56 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000146933  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2628  ribosomal protein L32  57.41 
 
 		 56 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000100434  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2562  50S ribosomal protein L32  57.41 
 
 		 56 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000144666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3503  50S ribosomal protein L32  61.11 
 
 		 55 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266571  hitchhiker  0.00520609 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1755  50S ribosomal protein L32  57.41 
 
 		 56 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000534053  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1712  50S ribosomal protein L32  57.41 
 
 		 56 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2652  50S ribosomal protein L32  57.41 
 
 		 56 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000778579  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1715  50S ribosomal protein L32  57.41 
 
 		 56 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000625062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1578  50S ribosomal protein L32  57.41 
 
 		 56 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000427195  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0868  50S ribosomal protein L32  53.45 
 
 		 64 aa  73.6  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01085  50S ribosomal protein L32  63.64 
 
 		 57 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000124601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2558  ribosomal protein L32  63.64 
 
 		 57 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.21504e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1603  ribosomal protein L32  52.63 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0931242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2512  50S ribosomal protein L32  63.64 
 
 		 57 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454704  hitchhiker  0.0000514777 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2235  50S ribosomal protein L32  63.64 
 
 		 57 aa  73.2  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.5686e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1468  50S ribosomal protein L32  63.64 
 
 		 57 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000009475  hitchhiker  0.0000000000113971 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1211  50S ribosomal protein L32  63.64 
 
 		 57 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.3151100000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1598  50S ribosomal protein L32P  59.26 
 
 		 56 aa  72.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.208872  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2038  50S ribosomal protein L32  63.64 
 
 		 57 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000393303  hitchhiker  0.0000254001 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02335  50S ribosomal protein L32  55.56 
 
 		 56 aa  72.8  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000084206  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1599  50S ribosomal protein L32  59.26 
 
 		 56 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000342659  hitchhiker  0.00352794 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01093  hypothetical protein  63.64 
 
 		 57 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000104927  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1902  50S ribosomal protein L32  59.26 
 
 		 55 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000663482  hitchhiker  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2498  50S ribosomal protein L32  57.41 
 
 		 56 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000463288  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1604  50S ribosomal protein L32  61.82 
 
 		 57 aa  72  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000354666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0708  50S ribosomal protein L32  52.73 
 
 		 57 aa  71.2  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1085  ribosomal protein L32  57.14 
 
 		 57 aa  70.9  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>