236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0220 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0220  cytochrome c assembly protein  100 
 
 
282 aa  551  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.141329  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0202  cytochrome c assembly protein  83.99 
 
 
282 aa  463  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.848267  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1177  cytochrome c assembly protein  47.21 
 
 
276 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262716  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3439  cytochrome c assembly protein  47.79 
 
 
309 aa  201  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00951271  hitchhiker  0.000487073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0517  cytochrome c assembly protein  47.39 
 
 
305 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.416062  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2642  cytochrome c assembly protein  46.15 
 
 
314 aa  192  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3676  cytochrome c assembly protein  46.39 
 
 
297 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438967  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2513  cytochrome C assembly family protein  46.67 
 
 
299 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3514  cytochrome C assembly family protein  46.67 
 
 
299 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3269  cytochrome C assembly family protein  46.67 
 
 
299 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3516  cytochrome C assembly family protein  46.67 
 
 
299 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0435  cytochrome C assembly family protein  46.67 
 
 
299 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.75155  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3478  cytochrome C assembly family protein  46.67 
 
 
299 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213677  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1294  cytochrome C assembly family protein  46.67 
 
 
290 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2810  hypothetical protein  47.7 
 
 
303 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.443588  normal  0.1588 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2792  cytochrome c assembly protein  46.39 
 
 
298 aa  188  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18001  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0519  cytochrome c assembly protein  47.13 
 
 
297 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  0.474671 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0494  cytochrome c assembly protein  47.13 
 
 
297 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1150  cytochrome C assembly family protein  47.7 
 
 
299 aa  185  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0641  cytochrome c assembly protein  45.92 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0561  cytochrome c assembly protein  48.29 
 
 
297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0577846  hitchhiker  0.000678361 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0109  cytochrome c assembly protein  48.29 
 
 
297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0591  cytochrome c assembly protein  48.29 
 
 
297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2946  cytochrome c assembly protein  46.53 
 
 
315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3093  cytochrome c assembly protein  47.52 
 
 
312 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349808  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2133  cytochrome c assembly protein  44.81 
 
 
275 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.324766  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2645  cytochrome c assembly protein  49.15 
 
 
302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3055  cytochrome c assembly protein  48.72 
 
 
302 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0521  cytochrome c assembly protein  37.87 
 
 
269 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312653  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3343  cytochrome c assembly protein  36.4 
 
 
267 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3627  cytochrome c assembly protein  42.4 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.470506  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2937  cytochrome c assembly protein  42.4 
 
 
266 aa  136  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.390266  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0961  cytochrome c assembly protein  38.8 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2372  transmembrane protein  36.05 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.34584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0843  cytochrome c assembly protein  36.32 
 
 
269 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0869  cytochrome c assembly protein  37.05 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1501  cytochrome c assembly protein  37.38 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0377  cytochrome c assembly protein  36.13 
 
 
255 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.015203 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1201  metal dependent phosphohydrolase  34.63 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1113  cytochrome c assembly protein  39.63 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2312  cytochrome c assembly protein  34.1 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2262  cytochrome c assembly protein  39.33 
 
 
282 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3219  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  36.75 
 
 
274 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3380  cytochrome c assembly protein  37.18 
 
 
266 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0591  cytochrome c assembly protein  32.03 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1506  cytochrome c assembly protein  34.96 
 
 
271 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1460  cytochrome c assembly protein  34.68 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.164878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1017  cytochrome c assembly protein  33.19 
 
 
270 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  0.587271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4261  cytochrome c assembly protein  34.23 
 
 
283 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.99902  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1065  cytochrome c assembly protein  34.68 
 
 
269 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1708  hypothetical protein  31.67 
 
 
268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.61279  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4159  cytochrome c assembly protein  33.78 
 
 
269 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0672  cytochrome c assembly protein  33.97 
 
 
269 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1986  cytochrome c assembly protein  34.57 
 
 
268 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3403  cytochrome c assembly protein  33.91 
 
 
266 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.887838  normal  0.688779 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1337  hypothetical protein  35.86 
 
 
273 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1939  cytochrome c assembly protein  46.36 
 
 
280 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.664487 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2922  cytochrome c assembly protein  32.85 
 
 
262 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1280  cytochrome c assembly protein  33.91 
 
 
284 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0144  hypothetical protein  37.84 
 
 
265 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.772264  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0056  hypothetical protein  37.84 
 
 
265 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.046398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1471  hypothetical protein  33.05 
 
 
270 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0127  cytochrome c assembly protein  36.91 
 
 
280 aa  99  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.496419  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39590  Cytochrome c assembly-like protein  36.36 
 
 
266 aa  99  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.208055  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0046  cytochrome c assembly protein  36.91 
 
 
263 aa  99  8e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.975637  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0997  cytochrome c assembly protein  29.06 
 
 
269 aa  99  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1149  cytochrome c assembly protein  33.73 
 
 
264 aa  99  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3018  cytochrome c assembly protein  32.73 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00647598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15940  hypothetical protein  34.91 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.182655  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0887  hypothetical protein  29.49 
 
 
262 aa  94  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.8995  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0425  cytochrome c assembly protein  40.27 
 
 
266 aa  92.8  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1371  hypothetical protein  34.33 
 
 
266 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02262  putative cytochrome C assembly protein  40.82 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3772  cytochrome c assembly protein  29.91 
 
 
255 aa  90.5  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3019  cytochrome c assembly protein  29.06 
 
 
262 aa  89  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000524804  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1061  cytochrome c assembly protein  32.34 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000186655  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2840  cytochrome c assembly protein  29.06 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000354809  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2922  cytochrome c assembly protein  29.06 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.140112  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1355  hypothetical protein  29.06 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3369  cytochrome c assembly protein  31.93 
 
 
263 aa  86.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0445  cytochrome c assembly protein  31.22 
 
 
289 aa  86.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002534  CcsA-related protein  30.59 
 
 
264 aa  86.3  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1285  cytochrome c assembly protein  28.09 
 
 
262 aa  85.5  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000446299  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1208  cytochrome c assembly protein  28.09 
 
 
262 aa  85.5  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214986  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3105  cytochrome c assembly protein  28.09 
 
 
262 aa  85.5  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000197765  normal  0.104427 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1252  cytochrome c assembly protein  28.09 
 
 
262 aa  85.5  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1669  cytochrome c assembly protein  29.62 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1157  cytochrome c assembly protein  28.21 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000603609  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1166  cytochrome c assembly protein  29.26 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00369516  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2756  cytochrome c assembly protein  29.24 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000043762  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2671  cytochrome c assembly protein  31.87 
 
 
274 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000343586  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1252  cytochrome c assembly protein  27.95 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000544074  hitchhiker  0.00000156209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1047  cytochrome c assembly protein  27.6 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00493417  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0093  hypothetical protein  31.35 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03482  hypothetical protein  30.47 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3231  putative cytochrome C assembly protein  31.17 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00112943  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3366  cytochrome c assembly protein  31.17 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0757452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0885  hypothetical protein  31.17 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.215466  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1623  cytochrome c assembly protein family  32.95 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0256537  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0560  cytochrome C assembly protein  32.95 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000010432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>