238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0200 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 166 aa  316  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0184  peptidase A24A, prepilin type IV  56.36 
 
 		 166 aa  187  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0397814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  51.39 
 
 		 289 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  47.18 
 
 		 289 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1309  Prepilin peptidase  46.32 
 
 		 283 aa  117  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  48.61 
 
 		 291 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  43.04 
 
 		 288 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  44.9 
 
 		 295 aa  111  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  45 
 
 		 283 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  45.07 
 
 		 300 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  43.8 
 
 		 281 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  42.66 
 
 		 287 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1480  Prepilin peptidase  44.85 
 
 		 283 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  42.75 
 
 		 309 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  42.66 
 
 		 287 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  42.86 
 
 		 318 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  39.49 
 
 		 302 aa  106  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1422  Prepilin peptidase  42.97 
 
 		 282 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  41.84 
 
 		 283 aa  103  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  42.96 
 
 		 291 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  43.24 
 
 		 303 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  39.47 
 
 		 303 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  42.95 
 
 		 287 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  41.98 
 
 		 304 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  45.04 
 
 		 303 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  41.98 
 
 		 308 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  41.98 
 
 		 308 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  43.51 
 
 		 303 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  42.75 
 
 		 303 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  42.03 
 
 		 303 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  43.51 
 
 		 303 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  43.51 
 
 		 303 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  43.48 
 
 		 303 aa  100  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  40.4 
 
 		 288 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  41.36 
 
 		 304 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  44.37 
 
 		 299 aa  98.2  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  46.81 
 
 		 296 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  40 
 
 		 288 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  41.1 
 
 		 287 aa  95.9  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  40.44 
 
 		 288 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  43.88 
 
 		 286 aa  95.5  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  45.89 
 
 		 293 aa  95.1  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  41.61 
 
 		 301 aa  94.7  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  39.29 
 
 		 288 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  39.29 
 
 		 288 aa  94  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  43.88 
 
 		 286 aa  94  9e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  43.24 
 
 		 294 aa  93.6  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  40.91 
 
 		 287 aa  92.8  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  43.97 
 
 		 289 aa  92.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  40.91 
 
 		 287 aa  92.8  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  42.57 
 
 		 280 aa  92.8  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  46.45 
 
 		 288 aa  92.4  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  40.43 
 
 		 294 aa  92  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  48 
 
 		 290 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4241  prepilin peptidase  41.1 
 
 		 287 aa  91.3  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.27 
 
 		 308 aa  91.3  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3454  Prepilin peptidase  41.43 
 
 		 306 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110375  hitchhiker  0.0033362 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0013  Peptidase A24 N- domain protein  41.84 
 
 		 274 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.846368 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0149  peptidase A24A domain-containing protein  44.44 
 
 		 306 aa  90.9  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.27 
 
 		 309 aa  90.9  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  40.56 
 
 		 283 aa  90.9  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  42.76 
 
 		 297 aa  90.9  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  42.47 
 
 		 266 aa  90.9  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  42.47 
 
 		 266 aa  90.9  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  38.89 
 
 		 308 aa  90.5  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  40.12 
 
 		 308 aa  90.1  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  41.67 
 
 		 290 aa  90.5  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  40.85 
 
 		 289 aa  89.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  39.71 
 
 		 296 aa  88.6  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  40.12 
 
 		 308 aa  88.2  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1391  prepilin peptidase  42.11 
 
 		 261 aa  87.4  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0773  prepilin peptidase  47 
 
 		 289 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  38.96 
 
 		 308 aa  87.4  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  44.2 
 
 		 293 aa  87  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  44.2 
 
 		 293 aa  87  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2902  peptidase A24A prepilin type IV  46.72 
 
 		 233 aa  87  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5164  type 4 prepilin peptidase PilD  48 
 
 		 290 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  40.3 
 
 		 289 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  40.44 
 
 		 290 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  40.44 
 
 		 290 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  38.69 
 
 		 280 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1014  prepilin peptidase  37.59 
 
 		 280 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  42.34 
 
 		 283 aa  86.3  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0963  type IV prepilin peptidase  37.59 
 
 		 277 aa  85.5  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  43.57 
 
 		 305 aa  85.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3259  prepilin peptidase  37.59 
 
 		 301 aa  85.9  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000482568  hitchhiker  0.0000000000000925794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58770  type 4 prepilin peptidase PilD  48 
 
 		 290 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.896389  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0861  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  43.41 
 
 		 298 aa  84.7  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0843  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  42.66 
 
 		 285 aa  84.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120524  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  42.75 
 
 		 294 aa  84.7  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  35.71 
 
 		 263 aa  84.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  39.19 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2533  type IV pilus prepilin peptidase PilD  41.22 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0455  type IV pilus prepilin peptidase PilD  41.22 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1313  type IV pilus prepilin peptidase PilD  41.22 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3508  type IV prepilin leader peptidase  41.22 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3533  type IV prepilin leader peptidase  41.22 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3249  type IV pilus prepilin peptidase PilD  41.22 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3529  peptidase A24 N- domain-containing protein  41.22 
 
 		 351 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3806  A24 family peptidase  39.06 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000259026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>