267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0134 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0134  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 140 aa  272  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0124  large conductance mechanosensitive channel protein  91.43 
 
 		 140 aa  239  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.533935  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  65.03 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  63.83 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  61.7 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  62.24 
 
 		 151 aa  179  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  62.24 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0751  large-conductance mechanosensitive channel  65.73 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  61.81 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  65.73 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.112062 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  58.57 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2963  large conductance mechanosensitive channel protein  60.14 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  60.84 
 
 		 142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  59.44 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  59.44 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  60.84 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  60.84 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  59.44 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  59.44 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  59.44 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  59.44 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  59.44 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  60.14 
 
 		 143 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  60.14 
 
 		 143 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  60.14 
 
 		 143 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  59.44 
 
 		 199 aa  169  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  60.14 
 
 		 143 aa  169  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1187  large conductance mechanosensitive channel protein  64.34 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3094  large-conductance mechanosensitive channel  63.83 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.350384  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1318  large-conductance mechanosensitive channel  60.14 
 
 		 143 aa  160  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212571  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0340  large-conductance mechanosensitive channel  57.14 
 
 		 145 aa  160  7e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.137149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0381  large-conductance mechanosensitive channel  55.24 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000132352  hitchhiker  0.000000656046 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3672  large conductance mechanosensitive channel protein  59.57 
 
 		 140 aa  153  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3333  large-conductance mechanosensitive channel  58.04 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662595  hitchhiker  0.000286923 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0374  large-conductance mechanosensitive channel  59.83 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.606039  normal  0.0231483 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3746  large conductance mechanosensitive channel protein  59.57 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2428  large conductance mechanosensitive channel protein  55.94 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0848  large-conductance mechanosensitive channel  57.45 
 
 		 137 aa  146  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0993  large-conductance mechanosensitive channel  57.53 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2455  large-conductance mechanosensitive channel  51.77 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2316  large-conductance mechanosensitive channel  57.24 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475958  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3606  large conductance mechanosensitive channel protein  58.96 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1871  large-conductance mechanosensitive channel  56.55 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110608  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  52.08 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  52.86 
 
 		 140 aa  140  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  53.24 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  53.24 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1538  large conductance mechanosensitive channel protein  53.15 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  53.57 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0929  large-conductance mechanosensitive channel  55.17 
 
 		 140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  48.3 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  48.3 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  50.34 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3455  large conductance mechanosensitive channel protein  47.52 
 
 		 142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0277457  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  48.59 
 
 		 159 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  53.19 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 142 aa  124  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  51.75 
 
 		 163 aa  123  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3208  large conductance mechanosensitive channel protein  46.76 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0654251  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  49.64 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  49.3 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1961  mechanosensitive channel  50.68 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  50.76 
 
 		 143 aa  120  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  45.83 
 
 		 133 aa  120  5e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  48.18 
 
 		 139 aa  120  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  51.94 
 
 		 145 aa  120  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  47.52 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  47.86 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  47.18 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  46.15 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  45.71 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  45.71 
 
 		 141 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  46.85 
 
 		 132 aa  117  7e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  45.71 
 
 		 141 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  46.48 
 
 		 143 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  45.39 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  48.25 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  47.83 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  47.55 
 
 		 148 aa  114  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  49.65 
 
 		 140 aa  114  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0622  large conductance mechanosensitive channel protein  53.49 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  47.89 
 
 		 136 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  47.89 
 
 		 136 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  48.59 
 
 		 139 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  47.18 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  46.9 
 
 		 135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  47.89 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.242536 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  47.89 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  47.89 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  46.48 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  48.25 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  46.85 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  47.18 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  48.25 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  47.18 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  47.18 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  47.18 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  47.18 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  47.18 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>